29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00960 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00960  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  305  9e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  1.90076e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2687  protein of unknown function DUF1047  100 
 
 
150 aa  305  9e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.43085e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00967  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  305  9e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  3.51017e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1120  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  305  9e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  3.45625e-08  normal  0.906723 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2640  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  305  9e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  8.30726e-09  hitchhiker  3.41922e-07 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1065  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  305  9e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.95489e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2164  hypothetical protein  99.33 
 
 
150 aa  303  5e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.75676e-09  normal  0.229611 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1070  hypothetical protein  99.33 
 
 
150 aa  303  5e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.0913e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2360  hypothetical protein  99.33 
 
 
150 aa  303  6e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.93337e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1132  hypothetical protein  89.93 
 
 
150 aa  280  6e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  3.20725e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1144  hypothetical protein  89.93 
 
 
150 aa  280  6e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000646309  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1027  hypothetical protein  89.93 
 
 
150 aa  280  6e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  4.04614e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1178  hypothetical protein  89.93 
 
 
150 aa  280  6e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000328612  normal  0.811815 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1110  hypothetical protein  89.93 
 
 
150 aa  280  6e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  1.88427e-05  hitchhiker  0.00310953 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1468  hypothetical protein  88.59 
 
 
151 aa  276  9e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  2.58069e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1753  hypothetical protein  84 
 
 
152 aa  258  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.37665e-08  decreased coverage  4.11108e-07 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1944  hypothetical protein  80 
 
 
164 aa  245  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.9157e-06  normal  0.132767 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2632  hypothetical protein  80 
 
 
151 aa  245  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  5.55352e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2544  hypothetical protein  80 
 
 
151 aa  245  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.10259e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1599  hypothetical protein  77.85 
 
 
157 aa  238  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000141741  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2550  hypothetical protein  78 
 
 
152 aa  238  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  4.02776e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1565  hypothetical protein  79.05 
 
 
153 aa  238  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2859  hypothetical protein  78.38 
 
 
153 aa  236  7e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  4.99435e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1558  hypothetical protein  60.54 
 
 
148 aa  179  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00564355  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003445  hypothetical protein  56.76 
 
 
149 aa  171  3e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000947124  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02330  hypothetical protein  56.08 
 
 
149 aa  169  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1089  hypothetical protein  54.05 
 
 
169 aa  162  2e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0857  hypothetical protein  49.66 
 
 
148 aa  143  8e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  1.17366e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0171  hypothetical protein  33.33 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.563681  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>