265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00812 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  100 
 
 
402 aa  789    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
402 aa  789    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  87.81 
 
 
403 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  100 
 
 
402 aa  789    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  99.5 
 
 
402 aa  786    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  100 
 
 
402 aa  789    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  99.75 
 
 
402 aa  788    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  99.73 
 
 
375 aa  732    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  87.81 
 
 
403 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  99.75 
 
 
402 aa  788    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  87.81 
 
 
403 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  87.81 
 
 
403 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  99.75 
 
 
402 aa  788    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  87.56 
 
 
403 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  85.04 
 
 
404 aa  651    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  51.8 
 
 
391 aa  348  8e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  51.64 
 
 
433 aa  345  6e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  53.74 
 
 
404 aa  338  9.999999999999999e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  44.95 
 
 
398 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  45.79 
 
 
401 aa  325  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  45.88 
 
 
390 aa  319  5e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3154  hypothetical protein  43.91 
 
 
397 aa  315  8e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000811574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3401  hypothetical protein  43.91 
 
 
397 aa  315  8e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0773641  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18420  fucose permease  49.33 
 
 
414 aa  315  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.29199 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3376  hypothetical protein  43.65 
 
 
397 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1875  hypothetical protein  43.37 
 
 
397 aa  309  5e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3079  major facilitator transporter  43.08 
 
 
397 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284057  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  44.24 
 
 
427 aa  297  3e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2780  major facilitator superfamily MFS_1  47.15 
 
 
395 aa  289  5.0000000000000004e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3724  major facilitator superfamily MFS_1  47.51 
 
 
391 aa  276  5e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.830199  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  39.21 
 
 
400 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  37.9 
 
 
425 aa  230  3e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3060  major facilitator superfamily MFS_1  41.11 
 
 
402 aa  223  6e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154269  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  38.81 
 
 
404 aa  219  8.999999999999998e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0704  integral membrane protein  47.49 
 
 
282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.64582  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  36.18 
 
 
413 aa  206  8e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3917  major facilitator superfamily MFS_1  40.17 
 
 
397 aa  205  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  35.92 
 
 
388 aa  205  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2690  major facilitator superfamily MFS_1  37.2 
 
 
464 aa  204  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3179  major facilitator superfamily MFS_1  38.38 
 
 
413 aa  196  5.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0049  major facilitator superfamily MFS_1  34.06 
 
 
480 aa  196  5.000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200181  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2534  major facilitator transporter  37.77 
 
 
417 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441567  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2714  major facilitator transporter  37.25 
 
 
404 aa  188  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.773773  hitchhiker  0.00188089 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07710  Major Facilitator Superfamily transporter  31.88 
 
 
502 aa  182  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.18857  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3025  major facilitator transporter  36.93 
 
 
433 aa  178  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3048  sugar (and other) transporter, C-terminal region  50.3 
 
 
182 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00412524  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2737  major facilitator superfamily MFS_1  38.38 
 
 
423 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00369572 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0666  major facilitator superfamily MFS_1  38.62 
 
 
409 aa  172  7.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0347459  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3180  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 
446 aa  159  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0150137 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0565  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 
443 aa  158  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.308939  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2689  major facilitator superfamily MFS_1  37.72 
 
 
433 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3874  major facilitator superfamily MFS_1  38.71 
 
 
397 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.369996  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 
387 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  31.63 
 
 
384 aa  143  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3049  sugar (and other) transporter, N-terminal region  38.73 
 
 
207 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000734773  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 
385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 
386 aa  138  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 
394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 
389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 
391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 
381 aa  126  7e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 
394 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  27.15 
 
 
405 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
387 aa  123  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  29.56 
 
 
398 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 
389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 
390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  28.91 
 
 
384 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 
388 aa  116  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  30.53 
 
 
403 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 
387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 
402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 
379 aa  114  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 
385 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 
392 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  29.84 
 
 
384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  29.44 
 
 
391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  27.51 
 
 
417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  24.94 
 
 
386 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  31.15 
 
 
383 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6269  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 
394 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.280386  normal  0.421192 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  31.06 
 
 
383 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  26.39 
 
 
397 aa  109  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 
405 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 
387 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2563  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 
430 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134659  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  29.85 
 
 
400 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 
377 aa  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  26.67 
 
 
397 aa  104  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  30.2 
 
 
382 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1528  major facilitator transporter  25.84 
 
 
387 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441356  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  28.34 
 
 
432 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6301  major facilitator transporter  25.84 
 
 
387 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2902  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  32.89 
 
 
402 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3406  putative amino acid ABC transporter, permease protein  32.89 
 
 
402 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1638  putative amino acid ABC transporter, permease protein  32.89 
 
 
402 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.501244  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3830  putative amino acid ABC transporter, permease protein  32.89 
 
 
402 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.852722  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3911  putative amino acid ABC transporter, permease protein  32.89 
 
 
402 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2963  putative amino acid ABC transporter, permease protein  32.89 
 
 
402 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.798243  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0050  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  32.89 
 
 
372 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>