75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00781 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2828  virulence-related outer membrane protein  100 
 
 
171 aa  350  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.166158  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0963  outer membrane protein X  100 
 
 
171 aa  350  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00475804  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00798  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  350  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0838  outer membrane protein X  100 
 
 
171 aa  350  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.202918  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2829  outer membrane protein X  100 
 
 
171 aa  350  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2534  outer membrane protein X  100 
 
 
171 aa  350  5.9999999999999994e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0526917  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00781  outer membrane protein X  100 
 
 
171 aa  350  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0871  outer membrane protein X  100 
 
 
171 aa  350  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00356643  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0884  outer membrane protein X  100 
 
 
171 aa  350  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00860999  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0962  outer membrane protein X  91.23 
 
 
171 aa  323  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0983  outer membrane protein X  91.23 
 
 
171 aa  323  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0871  outer membrane protein X  91.23 
 
 
171 aa  323  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.676559  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0899  outer membrane protein X  91.23 
 
 
171 aa  323  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0929  outer membrane protein X  90.64 
 
 
171 aa  320  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1301  outer membrane protein X  80.92 
 
 
172 aa  258  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0373252  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1767  outer membrane protein X  70.69 
 
 
174 aa  235  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000237049  normal  0.012422 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1606  outer membrane protein X  70.69 
 
 
174 aa  235  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0413281  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1501  outer membrane protein X  70.69 
 
 
174 aa  235  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.02654e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2874  outer membrane protein X  66.86 
 
 
171 aa  230  9e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156851  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1588  outer membrane protein X  67.24 
 
 
171 aa  226  9e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000727095  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1484  outer membrane protein X  68.79 
 
 
172 aa  226  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2389  outer membrane protein X  66.86 
 
 
171 aa  221  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.44963  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2485  outer membrane protein X  65.7 
 
 
170 aa  214  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.114339  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0444  attachment invasion locus protein  43.02 
 
 
179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000196272  hitchhiker  0.00000073955 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1268  virulence-related outer membrane protein  43.02 
 
 
179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000000113528  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1160  attachment invasion locus protein  43.02 
 
 
179 aa  124  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.92969e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2061  virulence-related outer membrane protein  43.29 
 
 
179 aa  122  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.906515  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1951  Ail/Lom family protein  43.29 
 
 
179 aa  122  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2152  attachment invasion locus protein precursor  42.68 
 
 
179 aa  118  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.224676  normal  0.023578 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4206  virulence-related outer membrane protein  40.32 
 
 
182 aa  107  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2360  virulence-related outer membrane protein  34.21 
 
 
183 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2257  Ail/Lom family protein  33.68 
 
 
183 aa  104  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00208525  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2048  attachment invasion locus protein  33.16 
 
 
183 aa  103  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0054596  hitchhiker  0.00421914 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1363  virulence membrane protein PagC  35.83 
 
 
185 aa  101  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.232924  normal  0.546382 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4489  virulence-related outer membrane protein  36.56 
 
 
182 aa  101  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1349  virulence membrane protein PagC  35.83 
 
 
185 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0661499 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2120  virulence membrane protein PagC  35.83 
 
 
185 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119055 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0914  Ail/Lom family protein  34.33 
 
 
199 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1936  virulence membrane protein PagC  35.29 
 
 
185 aa  97.1  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.336016  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1333  outer membrane invasion protein  35.29 
 
 
185 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.670538 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1204  Ail/Lom family protein  33.83 
 
 
199 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0613402 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1475  Ail/Lom family protein  33.33 
 
 
199 aa  96.3  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0399  attachment invasion locus protein  40.13 
 
 
174 aa  95.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0017153  hitchhiker  0.0000619073 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0379  attachment invasion locus protein  40.13 
 
 
174 aa  95.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00107279  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0386  attachment invasion locus protein  40.13 
 
 
174 aa  95.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0188056  hitchhiker  0.00070272 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0377  attachment invasion locus protein  40.13 
 
 
174 aa  95.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.857663  hitchhiker  0.00813108 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0439  attachment invasion locus protein  39.49 
 
 
174 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000617037 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2110  virulence-related outer membrane protein  32.67 
 
 
199 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018608  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3136  virulence-related outer membrane protein  36.65 
 
 
187 aa  92  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1153  attachment/invasion protein  33.52 
 
 
174 aa  91.7  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1638  Ail/Lom family protein  32.67 
 
 
199 aa  90.9  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2231  Ail/Lom family protein  33.33 
 
 
199 aa  90.5  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000102188 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2166  Ail/Lom family protein  33.33 
 
 
199 aa  90.5  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.469806  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0879  Ail/Lom family protein  33.66 
 
 
199 aa  90.1  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5541  Ail/Lom family protein  33.33 
 
 
199 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2872  Ail/Lom family protein  33.33 
 
 
199 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.015622 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2761  Ail/Lom family protein  33.33 
 
 
199 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.308137  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1202  Ail/Lom family protein  32.34 
 
 
199 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1639  Ail/Lom family protein  32.34 
 
 
199 aa  89  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3119  Ail/Lom family protein  33.66 
 
 
199 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.116259 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4278  outer membrane invasion protein  34.27 
 
 
177 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0643904  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1879  Ail/Lom family protein  31.84 
 
 
199 aa  84.7  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0581032 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3187  Ail/Lom family protein  31.84 
 
 
199 aa  84.7  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000477 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1803  Ail/Lom family protein  32.67 
 
 
199 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.021538 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1418  attachment/invasion protein  32.05 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0141818 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00751  hypothetical protein  28.85 
 
 
206 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10055  outer host membrane  28.85 
 
 
206 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.782687  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3500  outer membrane protein Lom  29.09 
 
 
244 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.755187  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3201  outer membrane protein  30.43 
 
 
178 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.823229  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3187  outer membrane protein  30.43 
 
 
178 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3250  outer membrane protein  30.43 
 
 
178 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0628701  normal  0.157037 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3366  outer membrane protein  29.89 
 
 
178 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.617319  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3265  outer membrane protein  29.89 
 
 
178 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.45758 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1095  putative Ail/Lom protein  45.65 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1282  putative entero Ail/Lom protein  43.48 
 
 
81 aa  40.8  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>