More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00745 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  99.56 
 
 
225 aa  461  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  2.43352e-08  normal  0.051363 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  100 
 
 
225 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  4.76961e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  4.75745e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  99.56 
 
 
225 aa  461  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  7.24623e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  100 
 
 
225 aa  462  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  98.67 
 
 
225 aa  458  1e-128  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.00914e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  99.11 
 
 
225 aa  458  1e-128  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.01687e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  98.67 
 
 
225 aa  456  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  4.15248e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  98.67 
 
 
225 aa  456  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.68609e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  75.56 
 
 
228 aa  356  2e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  2.83218e-06  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  75.56 
 
 
228 aa  355  2e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  75.11 
 
 
230 aa  354  6e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.08766e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  75.56 
 
 
228 aa  353  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  75.11 
 
 
230 aa  352  3e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  74.89 
 
 
238 aa  352  3e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  76 
 
 
226 aa  350  9e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  72.89 
 
 
227 aa  334  8e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  71.74 
 
 
240 aa  333  1e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  71.3 
 
 
240 aa  331  5e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  70.87 
 
 
245 aa  328  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  71.11 
 
 
226 aa  328  6e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  6.63248e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  71.11 
 
 
227 aa  321  6e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  70.67 
 
 
226 aa  317  8e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  2.13384e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0249  dithiobiotin synthetase  58.22 
 
 
225 aa  253  2e-66  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01810  dithiobiotin synthetase  53.15 
 
 
227 aa  233  1e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0857  dithiobiotin synthetase  50.9 
 
 
227 aa  233  2e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1667  putative dithiobiotin synthetase  51.56 
 
 
231 aa  225  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2037  putative dithiobiotin synthetase  51.56 
 
 
231 aa  225  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003868  dethiobiotin synthetase  52.7 
 
 
228 aa  226  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0874118  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2302  putative dithiobiotin synthetase  51.56 
 
 
231 aa  225  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0414413 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01562  predicted dethiobiotin synthetase  51.56 
 
 
231 aa  225  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01552  hypothetical protein  51.56 
 
 
231 aa  225  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2050  dethiobiotin synthase  51.56 
 
 
231 aa  225  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.583234  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1778  putative dithiobiotin synthetase  51.56 
 
 
231 aa  224  6e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1608  putative dithiobiotin synthetase  51.56 
 
 
231 aa  224  6e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1799  putative dithiobiotin synthetase  51.56 
 
 
231 aa  224  6e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1850  putative dithiobiotin synthetase  50.22 
 
 
231 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1895  putative dithiobiotin synthetase  54.22 
 
 
221 aa  223  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1600  putative dithiobiotin synthetase  50.22 
 
 
231 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1591  putative dithiobiotin synthetase  50.22 
 
 
231 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0571345 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1683  putative dithiobiotin synthetase  50.22 
 
 
231 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.809322  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1659  putative dithiobiotin synthetase  50.22 
 
 
231 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2132  putative dithiobiotin synthetase  52.91 
 
 
223 aa  219  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2045  putative dithiobiotin synthetase  53.36 
 
 
221 aa  218  5e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.154785  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1920  putative dithiobiotin synthetase  50.22 
 
 
231 aa  218  5e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2284  dethiobiotin synthase  51.11 
 
 
223 aa  217  9e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.165561 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45930  dithiobiotin synthetase  51.79 
 
 
231 aa  217  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2346  putative dithiobiotin synthetase  52.47 
 
 
221 aa  215  3e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.237745  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1868  putative dithiobiotin synthetase  52.25 
 
 
222 aa  214  6e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218738  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1980  putative dithiobiotin synthetase  52.25 
 
 
222 aa  214  6e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0633  dithiobiotin synthetase  48.44 
 
 
238 aa  212  4e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.00922e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4683  dithiobiotin synthetase  50.22 
 
 
226 aa  208  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.462604  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0498  dethiobiotin synthetase  49.78 
 
 
226 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5172  dithiobiotin synthetase  51.92 
 
 
226 aa  206  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0206613  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2554  dethiobiotin synthase  49.57 
 
 
287 aa  206  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0309873  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  49.31 
 
 
243 aa  205  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1921  dethiobiotin synthase  47.51 
 
 
235 aa  205  6e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0147663  decreased coverage  0.00139462 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0396  dithiobiotin synthetase  47.35 
 
 
226 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0392  dithiobiotin synthetase  46.46 
 
 
226 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4836  dithiobiotin synthetase  46.9 
 
 
226 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.519377 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4084  dithiobiotin synthetase  50 
 
 
228 aa  199  2e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610971  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0366  dithiobiotin synthetase  46.02 
 
 
226 aa  199  2e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.55843  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1804  dethiobiotin synthase  49.51 
 
 
221 aa  196  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511205  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1798  dithiobiotin synthetase  46.96 
 
 
246 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121118  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  48.51 
 
 
230 aa  192  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  2.24118e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3135  histidinol dehydrogenase  47.22 
 
 
230 aa  189  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2356  dithiobiotin synthetase  49.55 
 
 
231 aa  189  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  1.68324e-06 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3453  dethiobiotin synthase  46.6 
 
 
225 aa  188  7e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2773  dethiobiotin synthase  46.64 
 
 
226 aa  187  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0046697  hitchhiker  0.00857242 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2428  dithiobiotin synthetase  49.09 
 
 
231 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0142166 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1722  dethiobiotin synthase  47.01 
 
 
237 aa  186  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  1.92281e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2516  dithiobiotin synthetase  48.86 
 
 
231 aa  186  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.38987e-08 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  44.24 
 
 
221 aa  184  9e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2524  dithiobiotin synthetase  46.61 
 
 
246 aa  182  4e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.161209  normal  0.3539 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2737  dithiobiotin synthetase  47.79 
 
 
231 aa  182  5e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1761  dithiobiotin synthetase  46.61 
 
 
246 aa  181  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  47.03 
 
 
228 aa  181  7e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2342  dithiobiotin synthetase  47.39 
 
 
247 aa  181  7e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1754  dithiobiotin synthetase  46.96 
 
 
246 aa  181  9e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.235022  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0292  dethiobiotin synthase  49.01 
 
 
237 aa  177  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0765643  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1869  dethiobiotin synthase  44.8 
 
 
222 aa  176  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  3.32608e-05  decreased coverage  2.81099e-07 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1163  dethiobiotin synthase  44.35 
 
 
237 aa  176  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  44.09 
 
 
266 aa  175  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  48.78 
 
 
248 aa  175  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02208  cobyrinic acid a,c-diamide synthase:dethiobiotin synthase  45.58 
 
 
233 aa  174  1e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.020926  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06570  dithiobiotin synthetase  49.77 
 
 
228 aa  173  2e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803425  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  46.76 
 
 
233 aa  171  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  42.65 
 
 
242 aa  171  9e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2753  dithiobiotin synthetase  45.26 
 
 
234 aa  171  9e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0604  dithiobiotin synthetase  50.49 
 
 
228 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3643  dethiobiotin synthase  45.02 
 
 
236 aa  167  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0529  dethiobiotin synthase  47.34 
 
 
237 aa  163  2e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.256581  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1661  dithiobiotin synthetase  42.42 
 
 
231 aa  163  2e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1441  dithiobiotin synthetase  46.51 
 
 
230 aa  162  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00254947  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  47.76 
 
 
232 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1478  dithiobiotin synthetase  43.29 
 
 
236 aa  160  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  41.59 
 
 
254 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  43.96 
 
 
226 aa  159  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  45.58 
 
 
239 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  40.55 
 
 
238 aa  157  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>