More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00607 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  100 
 
 
203 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  100 
 
 
203 aa  422  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  99.51 
 
 
203 aa  419  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  99.51 
 
 
203 aa  419  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  98.52 
 
 
203 aa  414  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  96.55 
 
 
203 aa  410  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  97.04 
 
 
203 aa  411  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  76.26 
 
 
202 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  75.25 
 
 
213 aa  324  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  75.76 
 
 
202 aa  323  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  75.25 
 
 
202 aa  322  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  75.25 
 
 
202 aa  320  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 
214 aa  109  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.46 
 
 
200 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.46 
 
 
200 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  30.46 
 
 
200 aa  102  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  29.38 
 
 
196 aa  99.4  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  29.67 
 
 
213 aa  98.2  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  34.36 
 
 
212 aa  96.7  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  32.75 
 
 
195 aa  97.1  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  29.53 
 
 
210 aa  94.7  7e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  32.18 
 
 
214 aa  94  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  29.9 
 
 
209 aa  93.2  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  28.87 
 
 
200 aa  93.2  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 
200 aa  92.8  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 
194 aa  92  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 
208 aa  92  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  32.79 
 
 
190 aa  92  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  29.89 
 
 
197 aa  91.3  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 
256 aa  90.5  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  36.05 
 
 
194 aa  90.1  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 
205 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 
241 aa  88.6  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  32.95 
 
 
214 aa  88.6  6e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  32.34 
 
 
203 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 
200 aa  87.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  32.95 
 
 
214 aa  87.4  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 
209 aa  87  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  31.74 
 
 
203 aa  86.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.12 
 
 
191 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  31.74 
 
 
205 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  29.57 
 
 
204 aa  85.9  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  29.08 
 
 
191 aa  85.9  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  25.77 
 
 
212 aa  85.5  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  31.74 
 
 
203 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  25.77 
 
 
212 aa  85.5  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  29.32 
 
 
378 aa  85.5  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  29.23 
 
 
213 aa  85.5  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1760  phosphoglycerate mutase family protein  30.3 
 
 
199 aa  85.5  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000115709  normal  0.449804 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  31.14 
 
 
203 aa  85.1  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.69 
 
 
190 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 
215 aa  85.1  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  31.64 
 
 
194 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  31.35 
 
 
189 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33040  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase protein  32.95 
 
 
189 aa  84.7  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.011687  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.72 
 
 
442 aa  84.7  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  32.2 
 
 
188 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  32.93 
 
 
203 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  26.99 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  32.2 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.17 
 
 
442 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  29.9 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  31.43 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  31.43 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  29.38 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  31.64 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 
209 aa  83.2  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  28.87 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  30.54 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  27.72 
 
 
447 aa  82.4  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  29.89 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  30.54 
 
 
203 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  27.81 
 
 
370 aa  82  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  30.54 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.63 
 
 
442 aa  81.3  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  29.31 
 
 
214 aa  81.3  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 
218 aa  81.3  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  27.46 
 
 
207 aa  81.3  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  27.55 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  29.73 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  27.72 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0651  phosphoglycerate mutase  32.49 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00089207  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 
440 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  31.12 
 
 
193 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.72 
 
 
442 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  32.29 
 
 
198 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  33.55 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1758  phosphoglycerate mutase  32.95 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0909512  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.28 
 
 
443 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  26.7 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  33.55 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1926  phosphoglycerate mutase  28.21 
 
 
196 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00641926  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  32.31 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>