More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00486 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  100 
 
 		 387 aa  790    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  84.75 
 
 		 387 aa  690    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  790    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  85.27 
 
 		 387 aa  691    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  72.49 
 
 		 387 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  61.9 
 
 		 387 aa  498  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  61.24 
 
 		 387 aa  483  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  59.84 
 
 		 384 aa  477  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  71.38 
 
 		 324 aa  463  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  54.11 
 
 		 386 aa  424  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  40.44 
 
 		 349 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  39.02 
 
 		 369 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  39.02 
 
 		 369 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  39.02 
 
 		 369 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  39.02 
 
 		 369 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  38.59 
 
 		 369 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  35.56 
 
 		 338 aa  225  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  36.81 
 
 		 341 aa  225  1e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  35.81 
 
 		 276 aa  203  5e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  33.33 
 
 		 359 aa  133  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  27.03 
 
 		 367 aa  133  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  29.33 
 
 		 343 aa  129  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  33.19 
 
 		 353 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  28.23 
 
 		 354 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  28.23 
 
 		 354 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  38.65 
 
 		 172 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  36.71 
 
 		 159 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  29.57 
 
 		 251 aa  104  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6626  putative prophage integrase  26.12 
 
 		 386 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351385 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  24.75 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  30.54 
 
 		 404 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  29.18 
 
 		 429 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  28.21 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  36.13 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  26.15 
 
 		 402 aa  94.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0335  phage integrase family protein  27.84 
 
 		 356 aa  94  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1723  prophage DLP12 integrase  50 
 
 		 128 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.241784  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1546  prophage DLP12 integrase  50 
 
 		 128 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  26.67 
 
 		 337 aa  93.6  6e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  28.72 
 
 		 374 aa  92  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  28 
 
 		 421 aa  90.9  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  28.01 
 
 		 374 aa  90.9  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3904  phage integrase family site specific recombinase  60.94 
 
 		 122 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.908319  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2312  hypothetical protein  25.07 
 
 		 364 aa  90.1  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1111  phage integrase family protein  25.5 
 
 		 329 aa  90.1  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0292  phage integrase family protein  23.68 
 
 		 354 aa  89.4  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1525  phage integrase family site specific recombinase  46.53 
 
 		 132 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  27.63 
 
 		 401 aa  88.6  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  32.11 
 
 		 275 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  27.06 
 
 		 397 aa  87.4  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  25.27 
 
 		 337 aa  87  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  37.16 
 
 		 188 aa  85.5  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  28.01 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  31.53 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  26.43 
 
 		 334 aa  82.4  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  25.96 
 
 		 425 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  23.86 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  24.16 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  27.31 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  26.24 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  30.74 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0194  phage integrase  24.08 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334318  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  30 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3903  phage integrase family site specific recombinase  50.72 
 
 		 99 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.823274  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  30 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2847  phage integrase  27.8 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  29.54 
 
 		 388 aa  79.7  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  27.19 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  26.87 
 
 		 338 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  25.18 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6923  integrase family protein  27.78 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  29.28 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  24.81 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  29.52 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  28.96 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  26.61 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  26.55 
 
 		 335 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  24.41 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  26.85 
 
 		 339 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  26.1 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1633  phage integrase  26.06 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  23.54 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  28.12 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  24.76 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6962  integrase family protein  29.53 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  29.78 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  24.21 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  28.15 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  26.91 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  27.23 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  27.88 
 
 		 339 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3514  phage integrase family protein  26.67 
 
 		 336 aa  72.4  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123025  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  27.57 
 
 		 370 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  24.55 
 
 		 387 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2157  phage integrase  30.26 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0421336  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2998  hypothetical protein  30.17 
 
 		 212 aa  72.4  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  26.05 
 
 		 327 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2307  integrase family protein  28.38 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109793  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  29.13 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  28.64 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>