135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00442 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00442  predicted inner membrane protein  100 
 
 
259 aa  520  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0595  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  520  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0540  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  520  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3125  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  520  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0570  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  520  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00447  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  520  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3119  conserved hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  520  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0426  hypothetical protein  99.23 
 
 
259 aa  517  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0530  hypothetical protein  99.61 
 
 
259 aa  518  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0557  hypothetical protein  88.37 
 
 
259 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.711318  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0611  hypothetical protein  88.37 
 
 
259 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0567  hypothetical protein  88.37 
 
 
259 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0552  hypothetical protein  87.98 
 
 
259 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.417119  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0550  hypothetical protein  88.37 
 
 
259 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4666  hypothetical protein  82.1 
 
 
257 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A09  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  59.35 
 
 
251 aa  291  5e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  1.12109e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1627  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  58.94 
 
 
251 aa  286  2e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0934  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  58.54 
 
 
253 aa  279  4e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  7.94066e-09  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0689  hypothetical protein  50.39 
 
 
257 aa  260  1e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.393246  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0254  hypothetical protein  48.97 
 
 
251 aa  237  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  3.59378e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2529  hypothetical protein  46.28 
 
 
258 aa  224  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00951113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2480  hypothetical protein  46.28 
 
 
258 aa  224  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00188976  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2037  hypothetical protein  44.81 
 
 
258 aa  221  1e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.179883  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2859  hypothetical protein  42.56 
 
 
252 aa  179  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1171  hypothetical protein  39.22 
 
 
261 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.739375  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2323  ABC transporter, inner membrane subunit  30.8 
 
 
268 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1863  hypothetical protein  30.6 
 
 
268 aa  152  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00500964  normal  0.0941942 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4760  hypothetical protein  36.18 
 
 
264 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4653  hypothetical protein  34.96 
 
 
265 aa  149  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5050  hypothetical protein  34.96 
 
 
265 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5079  hypothetical protein  34.96 
 
 
265 aa  149  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5084  hypothetical protein  34.96 
 
 
265 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5081  hypothetical protein  34.96 
 
 
265 aa  149  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4673  hypothetical protein  34.96 
 
 
265 aa  149  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4303  hypothetical protein  34.94 
 
 
258 aa  148  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.121514 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5176  hypothetical protein  34.96 
 
 
265 aa  148  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4811  hypothetical protein  34.96 
 
 
265 aa  148  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1466  hypothetical protein  35.78 
 
 
243 aa  147  2e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000189703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0161  hypothetical protein  34.55 
 
 
265 aa  147  2e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4241  hypothetical protein  35.34 
 
 
258 aa  147  2e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0986  hypothetical protein  31.56 
 
 
268 aa  146  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0279  hypothetical protein  34.23 
 
 
260 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3461  hypothetical protein  31.47 
 
 
262 aa  142  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1807  hypothetical protein  36.25 
 
 
265 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162766  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1727  hypothetical protein  33.07 
 
 
265 aa  138  8e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1774  hypothetical protein  30.5 
 
 
267 aa  138  8e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.113625  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1799  hypothetical protein  30.5 
 
 
267 aa  138  8e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.551052 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6305  hypothetical protein  30.5 
 
 
267 aa  138  8e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1713  hypothetical protein  30.12 
 
 
267 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0755  hypothetical protein  34.14 
 
 
262 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  3.02353e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0731  hypothetical protein  34.14 
 
 
262 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  2.07096e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3518  hypothetical protein  35.2 
 
 
257 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000832658  normal  0.16619 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1685  hypothetical protein  30.12 
 
 
267 aa  136  3e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0698  hypothetical protein  28.89 
 
 
269 aa  136  3e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.645754  normal  0.217447 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2266  hypothetical protein  28.89 
 
 
272 aa  136  3e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.336185  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1176  hypothetical protein  33.48 
 
 
234 aa  136  3e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0900  hypothetical protein  35.46 
 
 
258 aa  135  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0342304 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2153  hypothetical protein  28.15 
 
 
272 aa  135  6e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5072  putative ABC transporter, inner membrane subunit  30.12 
 
 
267 aa  135  6e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362537  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1069  hypothetical protein  28.15 
 
 
272 aa  135  6e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.443958  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2321  hypothetical protein  28.15 
 
 
272 aa  135  6e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1798  hypothetical protein  28.15 
 
 
272 aa  135  6e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.539315  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2190  hypothetical protein  28.15 
 
 
272 aa  135  6e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1311  hypothetical protein  28.15 
 
 
272 aa  135  6e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0097  hypothetical protein  28.15 
 
 
272 aa  135  6e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401085  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1378  hypothetical protein  33.33 
 
 
242 aa  135  6e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0154277  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0534  hypothetical protein  33.6 
 
 
267 aa  135  7e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2632  hypothetical protein  33.77 
 
 
261 aa  134  1e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0680234  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1437  hypothetical protein  33.94 
 
 
264 aa  134  1e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318799  normal  0.0549134 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2510  hypothetical protein  31.76 
 
 
258 aa  134  1e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1497  hypothetical protein  29.34 
 
 
267 aa  133  2e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0286332 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2539  hypothetical protein  31.8 
 
 
266 aa  134  2e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0939059  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1139  hypothetical protein  33.2 
 
 
265 aa  132  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.529413 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0764  hypothetical protein  28.62 
 
 
269 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0571603 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0076  hypothetical protein  31.32 
 
 
269 aa  131  8e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0298659  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1504  hypothetical protein  34.54 
 
 
247 aa  130  1e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1073  hypothetical protein  30.64 
 
 
263 aa  131  1e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.780627  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1218  hypothetical protein  35.06 
 
 
258 aa  130  2e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1466  hypothetical protein  30.77 
 
 
274 aa  130  2e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0198  hypothetical protein  30.71 
 
 
268 aa  130  2e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.68555 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1087  hypothetical protein  30.5 
 
 
263 aa  130  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0779  hypothetical protein  34.94 
 
 
247 aa  129  4e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.683136  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1234  hypothetical protein  30.2 
 
 
261 aa  129  6e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7995  hypothetical protein  32.58 
 
 
263 aa  128  8e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.138428  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2239  hypothetical protein  32.58 
 
 
263 aa  128  8e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255232  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0767  hypothetical protein  33.21 
 
 
263 aa  128  9e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0250  hypothetical protein  35.78 
 
 
259 aa  128  9e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0426  hypothetical protein  35.78 
 
 
259 aa  128  9e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.320554  hitchhiker  5.3706e-09 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2020  hypothetical protein  31.49 
 
 
263 aa  127  1e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1309  hypothetical protein  33.47 
 
 
259 aa  128  1e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0748  hypothetical protein  29.18 
 
 
272 aa  127  1e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15630  conserved hypothetical protein TIGR00245  32.68 
 
 
260 aa  127  2e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1348  hypothetical protein  30 
 
 
264 aa  126  4e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2822  ABC transporter, inner membrane subunit  33.19 
 
 
262 aa  126  4e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.311883  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1835  hypothetical protein  30.68 
 
 
267 aa  126  4e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0121  hypothetical protein  31.95 
 
 
266 aa  123  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1804  hypothetical protein  29.67 
 
 
265 aa  123  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1171  hypothetical protein  33.33 
 
 
233 aa  122  4e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.937422 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2456  hypothetical protein  30.34 
 
 
261 aa  122  7e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal  0.509679 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1058  hypothetical protein  32.47 
 
 
261 aa  122  8e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>