283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00386 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00386  regulator of penicillin binding proteins and beta lactamase transcription (morphogene)  100 
 
 
105 aa  218  2e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  3.27919e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0520  transcriptional regulator BolA  100 
 
 
105 aa  218  2e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  2.66564e-08  normal  0.439753 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0357  transcriptional regulator BolA  100 
 
 
105 aa  218  2e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.55602e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00390  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  218  2e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  3.4736e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0477  transcriptional regulator BolA  100 
 
 
105 aa  218  2e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  4.13477e-08  normal  0.673316 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3198  transcriptional regulator BolA  100 
 
 
105 aa  218  2e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  7.54579e-07  hitchhiker  7.47363e-05 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0470  transcriptional regulator BolA  100 
 
 
105 aa  218  2e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.63176e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0511  transcriptional regulator BolA  100 
 
 
105 aa  218  2e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.01904e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3174  BolA family protein  100 
 
 
104 aa  216  8e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.07281e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0902  transcriptional regulator BolA  93.33 
 
 
105 aa  208  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000592891  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0495  transcriptional regulator BolA  92.38 
 
 
105 aa  206  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  9.73663e-05  hitchhiker  0.000766926 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0549  transcriptional regulator BolA  92.38 
 
 
105 aa  206  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0191216  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0486  transcriptional regulator BolA  92.38 
 
 
105 aa  206  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  3.29176e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0488  transcriptional regulator BolA  92.38 
 
 
105 aa  206  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000439461  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0505  transcriptional regulator BolA  92.38 
 
 
105 aa  206  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  3.05516e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1093  transcriptional regulator BolA  83.65 
 
 
104 aa  184  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.77187e-06  hitchhiker  2.75713e-06 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3094  transcriptional regulator BolA  72.38 
 
 
106 aa  165  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.83213e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3056  transcriptional regulator BolA  72.38 
 
 
106 aa  165  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.09706e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3237  transcriptional regulator BolA  72.38 
 
 
106 aa  165  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00596017  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1046  transcriptional regulator BolA  71.29 
 
 
104 aa  161  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00201353  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3266  transcriptional regulator BolA  71.29 
 
 
104 aa  158  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0394815  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3070  BolA family protein  69.31 
 
 
104 aa  148  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0107558  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2879  BolA family protein  69.31 
 
 
104 aa  144  4e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.294183  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03276  hypothetical protein  57.43 
 
 
102 aa  130  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002706  cell division protein BolA  55.45 
 
 
102 aa  127  5e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0214945  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0449  BolA-like protein  57.43 
 
 
104 aa  127  7e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0948  BolA protein  52.94 
 
 
104 aa  119  1e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2545  putative cell division protein BolA  55 
 
 
99 aa  118  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.754994 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1885  bolA protein  53.47 
 
 
106 aa  116  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0166011  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0710  BolA-like protein  56.44 
 
 
105 aa  114  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0712  bolA protein  53.4 
 
 
104 aa  114  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.375659  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03668  BolA protein  52.48 
 
 
106 aa  112  1e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1311  transcriptional regulator BolA  50.5 
 
 
103 aa  108  2e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.662079  normal  0.161621 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0945  BolA family protein  49 
 
 
99 aa  107  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0936  BolA family protein  55.32 
 
 
106 aa  105  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.526813  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2224  BolA family protein  46.53 
 
 
104 aa  105  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0934  transcriptional regulator BolA  50.51 
 
 
106 aa  104  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.150947  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0932  transcriptional regulator BolA  50.51 
 
 
106 aa  103  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0202581  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0970  transcriptional regulator BolA  50 
 
 
106 aa  103  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0255275  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2237  BolA family protein  49.5 
 
 
106 aa  103  7e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.629925  normal  0.18735 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3567  BolA family protein  50 
 
 
106 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3370  BolA family protein  50 
 
 
106 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1099  bolA protein  51.04 
 
 
97 aa  103  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3105  BolA family protein  48 
 
 
99 aa  103  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0920  BolA family protein  52.13 
 
 
97 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3442  BolA family protein  50 
 
 
106 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1880  hypothetical protein  45.54 
 
 
105 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1891  hypothetical protein  45.54 
 
 
105 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0980  BolA-like protein  51 
 
 
99 aa  99.8  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.308718  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2528  BolA family protein  48.51 
 
 
127 aa  99  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2994  transcriptional regulator BolA  48.54 
 
 
103 aa  99  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00410783  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1694  transcriptional regulator BolA  45.1 
 
 
118 aa  98.6  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3433  BolA family protein  45 
 
 
99 aa  95.5  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3622  BolA family protein  44 
 
 
99 aa  94.7  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.358741  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0745  BolA family protein  46.08 
 
 
103 aa  93.6  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2883  BolA family protein  40 
 
 
99 aa  89  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.665541  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1364  BolA family protein  44.12 
 
 
99 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164868  normal  0.935715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1757  BolA family protein  44.12 
 
 
98 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0775498  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3957  BolA family protein  44.12 
 
 
98 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533041  normal  0.0136089 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0548  BolA-like protein  44.55 
 
 
101 aa  86.3  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.708138  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3659  BolA-like protein  46.53 
 
 
97 aa  84  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1348  BolA family protein  42.16 
 
 
98 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686436  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1692  transcriptional regulator BolA  46 
 
 
97 aa  83.2  1e-15  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.702172  normal  0.256803 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4662  morphogene protein BolA  48.51 
 
 
101 aa  82.4  2e-15  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130147  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53190  morphogene protein BolA  46.53 
 
 
101 aa  81.3  4e-15  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14849  predicted protein  39.42 
 
 
127 aa  79.7  1e-14  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1733  bolA protein  45.45 
 
 
95 aa  78.6  2e-14  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.79487  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4091  transcriptional regulator BolA  45.54 
 
 
99 aa  77.8  5e-14  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34860  BolA-like protein  46.39 
 
 
102 aa  76.3  1e-13  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786664  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2063  BolA-like protein  43.96 
 
 
114 aa  75.5  2e-13  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00668109  normal  0.394391 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0538  BolA-like protein  50.62 
 
 
89 aa  75.9  2e-13  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1784  transcriptional regulator BolA  43.96 
 
 
114 aa  75.1  3e-13  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0211  BolA family protein  38.32 
 
 
110 aa  74.7  4e-13  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  6.29362e-12  normal  0.330407 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0291  BolA-like protein  46.91 
 
 
101 aa  72.4  2e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0535  BolA-like protein  44.44 
 
 
91 aa  71.2  4e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291649  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0400  BolA-like protein  41.11 
 
 
91 aa  68.6  3e-11  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.486388 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00875  morphogene BolA protein  37.5 
 
 
107 aa  68.6  3e-11  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220108  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0495  BolA-like protein  42.7 
 
 
98 aa  68.2  3e-11  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0502  BolA family protein  46.91 
 
 
89 aa  68.2  4e-11  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.922441  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1715  BolA family protein  43.18 
 
 
92 aa  67.8  5e-11  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.23123 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0031  BolA family protein  42.86 
 
 
102 aa  66.6  1e-10  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29161  predicted protein  45.35 
 
 
98 aa  66.6  1e-10  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.427878  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2687  BolA family protein  41.67 
 
 
91 aa  66.2  1e-10  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1862  transcriptional regulator BolA  43.82 
 
 
86 aa  65.5  2e-10  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.020215 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2113  BolA-like protein  38.64 
 
 
91 aa  64.7  4e-10  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  1.71225e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3593  BolA family protein  45.12 
 
 
93 aa  63.9  6e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703664  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1203  BolA family protein  41.98 
 
 
85 aa  63.5  9e-10  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.704892  normal  0.962968 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2030  BolA family protein  41.25 
 
 
92 aa  63.5  9e-10  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1674  transcriptional regulator BolA  41.25 
 
 
92 aa  63.5  9e-10  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.205869  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4050  stress induced morphogen  41.46 
 
 
98 aa  62.8  1e-09  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830681  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0320  BolA family protein  41.46 
 
 
108 aa  63.2  1e-09  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2398  BolA-like protein  38.46 
 
 
97 aa  63.2  1e-09  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0850633  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3886  BolA family protein  43.9 
 
 
94 aa  63.2  1e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.784426  normal  0.0137165 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1552  BolA family protein  40.7 
 
 
96 aa  62.8  2e-09  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.15156  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1609  morphogene BolA protein  40.7 
 
 
106 aa  61.6  3e-09  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.980085  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2277  transcriptional regulator BolA  43.37 
 
 
89 aa  61.2  5e-09  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3429  BolA family protein  36.36 
 
 
101 aa  60.5  8e-09  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.719936  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1765  BolA-like protein  42.5 
 
 
105 aa  60.1  9e-09  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.082138 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0715  BolA family protein  39.24 
 
 
90 aa  60.1  1e-08  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.157845  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39406  predicted protein  37.93 
 
 
109 aa  58.9  2e-08  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0761319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>