273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00318 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  100 
 
 		 283 aa  585  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  585  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  100 
 
 		 283 aa  585  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  100 
 
 		 283 aa  585  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  99.65 
 
 		 283 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  99.65 
 
 		 283 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  99.65 
 
 		 283 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  99.29 
 
 		 283 aa  581  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  90.11 
 
 		 283 aa  535  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  82.27 
 
 		 282 aa  486  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  76.51 
 
 		 282 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  76.51 
 
 		 282 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  76.51 
 
 		 282 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  61.09 
 
 		 277 aa  358  7e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  60.36 
 
 		 277 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  61.09 
 
 		 277 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  61.09 
 
 		 291 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  59.21 
 
 		 280 aa  347  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  60.36 
 
 		 277 aa  342  4e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  59.64 
 
 		 277 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  53.62 
 
 		 277 aa  300  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  51.81 
 
 		 277 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  51.81 
 
 		 277 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  51.81 
 
 		 335 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  47.29 
 
 		 272 aa  249  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  44 
 
 		 285 aa  238  9e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  44.41 
 
 		 304 aa  235  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02787  hypothetical protein  43.38 
 
 		 314 aa  231  7.000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4158  taurine dioxygenase  41.67 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5823  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  43.86 
 
 		 295 aa  228  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  42.5 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  42.61 
 
 		 295 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  40.58 
 
 		 278 aa  223  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  42.96 
 
 		 307 aa  222  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  42.45 
 
 		 306 aa  221  9e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4409  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  42.09 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425898  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  40.93 
 
 		 305 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4542  taurine dioxygenase  38.28 
 
 		 301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0422287  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  43.12 
 
 		 282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4383  Taurine dioxygenase  41.09 
 
 		 281 aa  213  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  44.41 
 
 		 322 aa  211  9e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  42.51 
 
 		 321 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3666  Taurine dioxygenase  39.86 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  41.37 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  41.24 
 
 		 308 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  40.15 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  40.34 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  40.48 
 
 		 315 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  41.24 
 
 		 318 aa  199  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  40.93 
 
 		 273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3847  taurine dioxygenase  40.69 
 
 		 282 aa  198  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4704  taurine dioxygenase  40 
 
 		 282 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  39.45 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0021  taurine dioxygenase  38.91 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  39.37 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1546  taurine dioxygenase  40.57 
 
 		 316 aa  196  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7176  taurine dioxygenase  40.48 
 
 		 282 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  39.86 
 
 		 302 aa  195  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6251  taurine dioxygenase  38.62 
 
 		 308 aa  195  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6536  taurine dioxygenase  38.62 
 
 		 308 aa  195  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0720  taurine dioxygenase  40.07 
 
 		 309 aa  195  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  40.73 
 
 		 293 aa  195  9e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  38.75 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  39.58 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5119  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA (2-oxoglutarate-dependent)  39.1 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  37.37 
 
 		 287 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  39.86 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.93116 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04108  conserved hypothetical protein  39.86 
 
 		 363 aa  193  3e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  38.97 
 
 		 298 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2819  taurine dioxygenase  40.14 
 
 		 282 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373247 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  39.72 
 
 		 298 aa  192  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  38.41 
 
 		 315 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5751  Taurine dioxygenase  38.32 
 
 		 309 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  38.68 
 
 		 305 aa  192  6e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1366  putative taurine dioxygenase, 2-oxoglutarate-dependent  39.18 
 
 		 308 aa  192  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0715055 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  38.54 
 
 		 315 aa  192  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2012  taurine dioxygenase  39.32 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6587  taurine dioxygenase  37.59 
 
 		 308 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5054  taurine dioxygenase  37.28 
 
 		 280 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1245  taurine dioxygenase  37.59 
 
 		 308 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0169  TauD/TfdA family dioxygenase  37.98 
 
 		 299 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2006  taurine dioxygenase  38.75 
 
 		 282 aa  189  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0190  taurine dioxygenase  37.63 
 
 		 299 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0252  taurine dioxygenase  40.07 
 
 		 308 aa  189  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2676  taurine dioxygenase  39.79 
 
 		 282 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3417  taurine dioxygenase  38.77 
 
 		 318 aa  188  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5058  taurine dioxygenase  38.06 
 
 		 299 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3924  taurine dioxygenase  38.77 
 
 		 317 aa  188  9e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134883  normal  0.401271 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1665  taurine dioxygenase  36.99 
 
 		 303 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3507  taurine dioxygenase  38.06 
 
 		 315 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220581 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  38.06 
 
 		 315 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4633  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  38.36 
 
 		 280 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  38.78 
 
 		 276 aa  186  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2770  taurine dioxygenase  40.21 
 
 		 323 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22330  taurine dioxygenase protein  37.32 
 
 		 304 aa  186  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0188  taurine dioxygenase  37.63 
 
 		 299 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354503 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  38.14 
 
 		 295 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6191  taurine dioxygenase  36.55 
 
 		 308 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4018  taurine dioxygenase  38.41 
 
 		 317 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02420  hypothetical protein  38.13 
 
 		 300 aa  185  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>