More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00293 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  100 
 
 
219 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  100 
 
 
219 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  100 
 
 
219 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  100 
 
 
219 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  100 
 
 
219 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3267  Carbonate dehydratase  99.54 
 
 
219 aa  449  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  99.09 
 
 
219 aa  447  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3093  carbonate dehydratase  80.57 
 
 
219 aa  364  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  79 
 
 
219 aa  362  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  78.08 
 
 
219 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  78.08 
 
 
219 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  78.08 
 
 
219 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2146  Carbonate dehydratase  75.8 
 
 
219 aa  358  4e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1534  carbonate dehydratase  76.89 
 
 
217 aa  353  2e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223898  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5945  carbonate dehydratase  75.94 
 
 
223 aa  348  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.255507 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5701  carbonate dehydratase  75.94 
 
 
219 aa  348  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.182609 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  73.52 
 
 
219 aa  338  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  73.06 
 
 
219 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3322  carbonic anhydrases  73.06 
 
 
219 aa  334  5e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2465  carbonic anhydrase  73.06 
 
 
219 aa  334  5e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1244  carbonic anhydrases  73.06 
 
 
219 aa  334  5e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858637  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0384  carbonic anhydrases  73.06 
 
 
219 aa  334  5e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  72.9 
 
 
234 aa  331  6e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3371  carbonate dehydratase  71.56 
 
 
219 aa  328  3e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  69.05 
 
 
211 aa  322  4e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6589  carbonate dehydratase  67.91 
 
 
219 aa  318  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.022636  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2731  carbonate dehydratase  67.44 
 
 
219 aa  317  6e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657946  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3235  carbonate dehydratase  69.67 
 
 
220 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7283  carbonate dehydratase  69.42 
 
 
239 aa  310  6.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  67.77 
 
 
220 aa  308  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1173  Carbonate dehydratase  66.83 
 
 
211 aa  303  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  67.62 
 
 
216 aa  303  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  66.83 
 
 
211 aa  299  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1256  carbonate dehydratase  63.51 
 
 
211 aa  298  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471436  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  65.38 
 
 
211 aa  291  4e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5353  Carbonate dehydratase  61.14 
 
 
211 aa  291  6e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.599954 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  53.67 
 
 
239 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  52.75 
 
 
239 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  52.75 
 
 
239 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  52.75 
 
 
239 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  53.2 
 
 
221 aa  231  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  52.22 
 
 
246 aa  230  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  50.45 
 
 
243 aa  227  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  52.17 
 
 
242 aa  227  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  49.77 
 
 
242 aa  225  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  51.69 
 
 
242 aa  224  6e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4860  Carbonate dehydratase  53.54 
 
 
202 aa  218  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  48.39 
 
 
248 aa  214  9e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2617  carbonate dehydratase  48 
 
 
230 aa  208  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0962521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2233  carbonate dehydratase  49.76 
 
 
229 aa  208  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  49.76 
 
 
225 aa  206  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  47.6 
 
 
230 aa  204  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  46.85 
 
 
235 aa  202  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  41.82 
 
 
236 aa  203  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1176  carbonate dehydratase  51.49 
 
 
234 aa  202  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532221  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  46.04 
 
 
267 aa  201  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  46.04 
 
 
267 aa  201  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  46.08 
 
 
218 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  45.05 
 
 
251 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  47.5 
 
 
231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  45.27 
 
 
217 aa  196  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1923  Carbonic anhydrase protein  44.54 
 
 
234 aa  193  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.764692  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  44.75 
 
 
258 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  45.54 
 
 
278 aa  191  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0612  carbonate dehydratase  45.96 
 
 
227 aa  191  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  44.33 
 
 
224 aa  181  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3284  Carbonate dehydratase  42.57 
 
 
227 aa  181  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  43.46 
 
 
272 aa  179  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1895  hypothetical protein  38.69 
 
 
356 aa  176  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3608  Carbonate dehydratase  42.36 
 
 
284 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.418746  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  40.1 
 
 
211 aa  170  1e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  40.1 
 
 
211 aa  170  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  40.1 
 
 
211 aa  170  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  40.89 
 
 
210 aa  169  3e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  38.73 
 
 
210 aa  167  1e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1736  carbonic anhydrase  40.2 
 
 
222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  40.59 
 
 
225 aa  161  8.000000000000001e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0748  Carbonate dehydratase  40.29 
 
 
207 aa  159  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942941  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  38.76 
 
 
213 aa  155  3e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  39.22 
 
 
214 aa  155  6e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  38.94 
 
 
218 aa  155  6e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  34.83 
 
 
207 aa  154  8e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5185  carbonic anhydrase  38.21 
 
 
225 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.239383 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  41.1 
 
 
230 aa  153  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  35.86 
 
 
200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  40.49 
 
 
214 aa  152  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1679  Carbonate dehydratase  39.22 
 
 
754 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0161033  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  35.84 
 
 
244 aa  144  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00785  carbonic anhydrase  43.79 
 
 
182 aa  144  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0203446  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  38.24 
 
 
787 aa  142  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  33.18 
 
 
216 aa  142  4e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0432  Carbonate dehydratase  41.29 
 
 
225 aa  142  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0441  carbonate dehydratase  41.29 
 
 
225 aa  142  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295258  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  35.07 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  37.38 
 
 
230 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  38.97 
 
 
230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  33.82 
 
 
233 aa  139  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  39.37 
 
 
877 aa  139  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  34.65 
 
 
213 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>