More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_3073 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  67.95 
 
 
883 aa  1169    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
886 aa  1740    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  42.21 
 
 
886 aa  575  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  31.97 
 
 
864 aa  347  7e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  30.57 
 
 
884 aa  343  5e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  30.09 
 
 
884 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  28.55 
 
 
860 aa  332  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  29.54 
 
 
883 aa  318  4e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  29.72 
 
 
882 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  29.38 
 
 
882 aa  300  6e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  23.76 
 
 
934 aa  145  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.11 
 
 
1676 aa  135  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 
931 aa  132  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  25.17 
 
 
929 aa  119  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  23.73 
 
 
729 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 
878 aa  110  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 
952 aa  106  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.11 
 
 
810 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  23.55 
 
 
1069 aa  103  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2579  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.67 
 
 
786 aa  99.8  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.87 
 
 
927 aa  99.4  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 
4079 aa  97.1  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.27 
 
 
1694 aa  97.4  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  22.59 
 
 
1067 aa  96.3  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  25.78 
 
 
935 aa  95.1  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.52 
 
 
1056 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.29 
 
 
2240 aa  92.4  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  22.79 
 
 
923 aa  91.7  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 
729 aa  90.9  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.87 
 
 
689 aa  89.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 
505 aa  86.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 
944 aa  86.3  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.13 
 
 
1056 aa  85.5  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  23.25 
 
 
1421 aa  85.5  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  24.55 
 
 
924 aa  84.3  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1011  TPR repeat-containing protein  24.93 
 
 
800 aa  84  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926102  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  23.39 
 
 
1276 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 
955 aa  83.2  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 
792 aa  81.6  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  26.33 
 
 
1138 aa  81.3  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 
900 aa  80.9  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.43 
 
 
3035 aa  80.5  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.43 
 
 
1022 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.58 
 
 
1979 aa  79.7  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 
448 aa  80.1  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  21.94 
 
 
632 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  23.44 
 
 
733 aa  77.8  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 
1406 aa  77.4  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 
762 aa  76.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  22.15 
 
 
722 aa  76.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  26.09 
 
 
1013 aa  75.5  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.34 
 
 
582 aa  75.1  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 
3145 aa  75.1  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.76 
 
 
632 aa  74.7  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.24 
 
 
557 aa  74.3  0.000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2252  TPR repeat-containing protein  23.78 
 
 
954 aa  73.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.8 
 
 
553 aa  73.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.15 
 
 
725 aa  74.3  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  21.81 
 
 
767 aa  73.6  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  22.52 
 
 
643 aa  73.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  22.74 
 
 
462 aa  73.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  27.8 
 
 
603 aa  73.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  21.17 
 
 
3172 aa  73.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  20.28 
 
 
448 aa  73.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  24.08 
 
 
566 aa  72.4  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1530  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 
873 aa  72.4  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0304158  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 
543 aa  71.6  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4615  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.62 
 
 
1402 aa  71.6  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.31 
 
 
818 aa  71.2  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 
808 aa  71.2  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.26 
 
 
571 aa  70.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  20.14 
 
 
1297 aa  70.5  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0310  TPR domain-containing protein  20.84 
 
 
892 aa  69.7  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.5 
 
 
639 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  25.08 
 
 
607 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2838  tetratricopeptide TPR_2  22.46 
 
 
940 aa  70.1  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  19.87 
 
 
2059 aa  70.1  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  23.63 
 
 
565 aa  69.3  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 
935 aa  69.3  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  19.77 
 
 
750 aa  68.9  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  22.61 
 
 
567 aa  68.9  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1444  TPR repeat-containing protein  21.41 
 
 
420 aa  68.2  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 
927 aa  68.2  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0528  TPR domain-containing protein  23.03 
 
 
917 aa  67.8  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1429  TPR domain-containing protein  21.79 
 
 
420 aa  67.8  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 
827 aa  67.8  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1541  TPR domain-containing protein  21.79 
 
 
420 aa  67.8  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  23.98 
 
 
562 aa  67.4  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  21.12 
 
 
676 aa  67.4  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  23.57 
 
 
265 aa  66.6  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1575  TPR domain protein  21.86 
 
 
420 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.21 
 
 
620 aa  67  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1682  TPR domain protein  21.79 
 
 
420 aa  67  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327391  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  19.52 
 
 
1486 aa  66.6  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  19.19 
 
 
887 aa  67  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3925  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 
1180 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3770  TPR domain protein  21.86 
 
 
420 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1401  TPR repeat-containing protein  23.34 
 
 
420 aa  65.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1401  TPR repeat-containing protein  21.79 
 
 
420 aa  66.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0553383  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1628  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  25.69 
 
 
924 aa  66.2  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>