39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_3060 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008741  Dvul_3060  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 489 aa  958    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.329641  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0678  polysaccharide biosynthesis protein  68.18 
 
 		 499 aa  626  1e-178  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2211  polysaccharide biosynthesis protein  44.74 
 
 		 494 aa  419  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167884  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3093  O-antigen and teichoic acid-like export protein  30.02 
 
 		 507 aa  123  9e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  27.18 
 
 		 504 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 504 aa  99.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0962  virulence factor MviN family protein  20.51 
 
 		 511 aa  96.3  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3669  polysaccharide biosynthesis protein  22.76 
 
 		 501 aa  95.9  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.44 
 
 		 499 aa  93.6  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1814  polysaccharide biosynthesis protein  27.61 
 
 		 468 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0827  polysaccharide biosynthesis protein  22.65 
 
 		 522 aa  69.3  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.769454  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0958  polysaccharide biosynthesis protein  23.45 
 
 		 517 aa  58.2  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.393592  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2096  polysaccharide biosynthesis protein  22.99 
 
 		 511 aa  56.2  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0954  polysaccharide biosynthesis protein  22.08 
 
 		 514 aa  53.9  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.861474  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  26.13 
 
 		 482 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 		 429 aa  51.6  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1344  polysaccharide biosynthesis protein  24.54 
 
 		 488 aa  50.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  24.07 
 
 		 478 aa  48.5  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0361  polysaccharide biosynthesis protein  22.88 
 
 		 519 aa  47.4  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.602182  normal  0.0588594 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02859  predicted inner membrane protein  24.81 
 
 		 449 aa  47.4  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3268  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.81 
 
 		 449 aa  47.4  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.809539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0710  polysaccharide biosynthesis protein  24.81 
 
 		 449 aa  47  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1219  polysaccharide biosynthesis protein  22.59 
 
 		 505 aa  47  0.0009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  19.51 
 
 		 421 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1803  O-antigen and teichoic acid export protein  19.62 
 
 		 506 aa  46.6  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3450  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.81 
 
 		 449 aa  46.6  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0545  polysaccharide biosynthesis family protein  31.43 
 
 		 484 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3163  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.71 
 
 		 449 aa  45.8  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  31.43 
 
 		 484 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2428  polysaccharide biosynthesis protein  31.43 
 
 		 484 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1873  polysaccharide biosynthesis family protein  31.43 
 
 		 484 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1665  polysaccharide biosynthesis family protein  31.43 
 
 		 484 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702931  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0694  polysaccharide biosynthesis family protein  32.38 
 
 		 488 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731179  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0753  polysaccharide biosynthesis family protein  31.43 
 
 		 488 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1706  polysaccharide biosynthesis family protein  31.43 
 
 		 488 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974383  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4609  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 488 aa  44.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286147  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0117  polysaccharide transport protein, putative  20.33 
 
 		 512 aa  43.9  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000854887 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1606  polysaccharide biosynthesis protein  23.64 
 
 		 412 aa  43.5  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0714758  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0778  polysaccharide biosynthesis protein  23.14 
 
 		 442 aa  43.5  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.699251  normal  0.0159711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>