More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_3023 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008741  Dvul_3023  response regulator receiver protein  100 
 
 		 130 aa  260  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0715  response regulator receiver protein  47.93 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1521  response regulator receiver domain-containing protein  39.29 
 
 		 126 aa  87  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0063  response regulator receiver protein  43.27 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1780  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 130 aa  84  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.233106 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.8 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0634  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3071  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 304 aa  65.5  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000348024  unclonable  0.0000000210343 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  33.87 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2042  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3366  histidine kinase  35.25 
 
 		 580 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4788  histidine kinase  34.4 
 
 		 685 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  34.96 
 
 		 238 aa  63.9  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1059  two component transcriptional regulator  35.48 
 
 		 242 aa  63.5  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.346912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0413  putative transcriptional regulatory protein OmpR  34.96 
 
 		 238 aa  63.5  0.0000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0977  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.48 
 
 		 242 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3145  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 231 aa  63.5  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00258001  hitchhiker  0.000377263 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02230  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  34.17 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0710  two component transcriptional regulator  32.03 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1173  DNA-binding response regulator  32.77 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.423617  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3185  two component transcriptional regulator  33.06 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.729743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3382  two component transcriptional regulator  36.67 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98781 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2829  response regulator receiver protein  38.53 
 
 		 134 aa  62  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  32.26 
 
 		 229 aa  61.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.97 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4168  DNA-binding response regulator  32.77 
 
 		 234 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.45 
 
 		 237 aa  61.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0371836  normal  0.118342 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1275  DNA-binding response regulator  31.93 
 
 		 234 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.19 
 
 		 230 aa  61.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1773  DNA-binding response regulator  28.57 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.48 
 
 		 233 aa  61.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1884  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 244 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.365735  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1218  DNA-binding response regulator  32.77 
 
 		 234 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0203  response regulator receiver  28.81 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  28 
 
 		 227 aa  61.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1998  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 240 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0541046  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1018  response regulator  31.93 
 
 		 234 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.54503  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1040  DNA-binding response regulator  31.93 
 
 		 234 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1017  response regulator  31.93 
 
 		 234 aa  60.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0627963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1198  DNA-binding response regulator  31.93 
 
 		 234 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.885409 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1119  DNA-binding response regulator  31.93 
 
 		 234 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  31.09 
 
 		 234 aa  60.5  0.000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  31.2 
 
 		 229 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4347  two component transcriptional regulator  34.75 
 
 		 244 aa  60.1  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.215798  normal  0.0155623 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  31.97 
 
 		 248 aa  60.1  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1183  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.61 
 
 		 481 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1017  two component transcriptional regulator  38.66 
 
 		 229 aa  60.1  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.957911  normal  0.735899 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1023  two component transcriptional regulator  31.93 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3717  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  33.61 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1114  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.61 
 
 		 501 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0844  two component transcriptional regulator  31.93 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1601  DNA-binding response regulator ResD  30.08 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953648  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1637  DNA-binding response regulator ResD  30.08 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0246031  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1386  DNA-binding response regulator ResD  30.08 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1359  response regulator  30.08 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1358  response regulator  30.08 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1497  DNA-binding response regulator ResD  30.08 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862661  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1531  DNA-binding response regulator ResD  30.08 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1461  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.6 
 
 		 491 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.750458 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  32.52 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4253  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0509  two component transcriptional regulator  30.25 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  32.2 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.19 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2764  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 466 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1399  two component transcriptional regulator  30.08 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1493  two component transcriptional regulator  37.19 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.340507 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3814  DNA-binding response regulator ResD  30.08 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.95849e-16 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  33.9 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1569  DNA-binding response regulator ResD  30.08 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45334e-32 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2366  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 385 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000342445  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  34.15 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  34.15 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  31.36 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 390 aa  58.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  35.25 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.23 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.77 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0956  DNA-binding response regulator  27.73 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.504019  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1865  response regulator receiver  35.29 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5813  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548874 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  27.87 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0852  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 		 1055 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2351  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.11 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274912  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  31.93 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0653  two-component response regulator PhoB  32.2 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131558  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1055  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 481 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.874499  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1923  response regulator receiver domain-containing protein  32.93 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.45 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0826  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.19 
 
 		 235 aa  57.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.398179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  31.45 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2709  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.14 
 
 		 501 aa  57.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.710197  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  33.05 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23040  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  30.25 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.318653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  33.06 
 
 		 241 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0402  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.91 
 
 		 241 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4385  two-component response regulator VirG  29.06 
 
 		 241 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1105  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 475 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.926771  normal  0.835973 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3286  two component transcriptional regulator  30.58 
 
 		 253 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>