287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2933 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2933  hydantoinase/oxoprolinase  100 
 
 		 570 aa  1117    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.714431 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0092  hydantoinase/oxoprolinase family protein  53.73 
 
 		 575 aa  520  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0187  Hydantoinase/oxoprolinase  47.26 
 
 		 553 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2177  Hydantoinase/oxoprolinase  51.06 
 
 		 665 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0817  hydantoinase/oxoprolinase  33.05 
 
 		 638 aa  265  2e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.391568  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2491  hydantoinase  32.09 
 
 		 701 aa  254  3e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0899  hydantoinase/oxoprolinase  31.1 
 
 		 643 aa  253  9.000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.742994  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1734  Hydantoinase/oxoprolinase  33.68 
 
 		 658 aa  251  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1067  hydantoinase  32.18 
 
 		 671 aa  246  8e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1134  hydantoinase/oxoprolinase  30.99 
 
 		 645 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.187357  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2490  hydantoinase  31.9 
 
 		 636 aa  239  9e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1967  hydantoinase/oxoprolinase  31.08 
 
 		 639 aa  239  9e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3269  hydantoinase/oxoprolinase  35.85 
 
 		 667 aa  236  6e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1068  hydantoinase  30.72 
 
 		 642 aa  230  5e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3293  hydantoinase/oxoprolinase  37.77 
 
 		 675 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.220696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0900  hydantoinase/oxoprolinase  30.17 
 
 		 641 aa  226  7e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.409671  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3607  hypothetical protein  37.4 
 
 		 675 aa  226  8e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2805  hydantoinase/oxoprolinase  33.5 
 
 		 668 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0141  hydantoinase  30.57 
 
 		 644 aa  213  7e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.456007 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1547  hydantoinase/oxoprolinase  33.99 
 
 		 515 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0836  Hydantoinase/oxoprolinase  32.11 
 
 		 583 aa  145  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0997414 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3586  Hydantoinase/oxoprolinase  31.37 
 
 		 519 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0167077  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1002  hydantoinase/oxoprolinase  32.4 
 
 		 550 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2933  hydantoinase/oxoprolinase  30 
 
 		 570 aa  137  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2282  hydantoinase/oxoprolinase family protein  32.78 
 
 		 550 aa  137  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4059  hydantoinase/oxoprolinase  31.11 
 
 		 566 aa  137  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1727  Hydantoinase/oxoprolinase  32.32 
 
 		 522 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.666608  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0779  Hydantoinase/oxoprolinase  32.14 
 
 		 553 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1963  hydantoinase/oxoprolinase  31.56 
 
 		 516 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1995  Hydantoinase/oxoprolinase  31.77 
 
 		 522 aa  130  9.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22450  N-methylhydantoinase (ATP-hydrolyzing)  32.35 
 
 		 579 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1404  hydantoinase/oxoprolinase  33.06 
 
 		 560 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0652  Hydantoinase/oxoprolinase  32.96 
 
 		 516 aa  126  9e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0481682 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0999  Hydantoinase/oxoprolinase  31.79 
 
 		 564 aa  125  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3162  hydantoinase/oxoprolinase  30 
 
 		 572 aa  125  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3064  Hydantoinase/oxoprolinase  32.88 
 
 		 526 aa  124  5e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0222  Hydantoinase/oxoprolinase  32.34 
 
 		 557 aa  124  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134992 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0422  hydantoinase/oxoprolinase  28.61 
 
 		 715 aa  121  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2142  Hydantoinase/oxoprolinase  32.51 
 
 		 693 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4697  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.07 
 
 		 692 aa  118  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0161  Hydantoinase/oxoprolinase  29.1 
 
 		 715 aa  117  3.9999999999999997e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  29.55 
 
 		 983 aa  114  3e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4112  hydantoinase/oxoprolinase  29.33 
 
 		 538 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0574  Hydantoinase/oxoprolinase  30.05 
 
 		 708 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000997997  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1851  hydantoinase/oxoprolinase  31.67 
 
 		 518 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51976  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0095  hydantoinase/oxoprolinase  32.12 
 
 		 517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3384  Hydantoinase/oxoprolinase  32.49 
 
 		 735 aa  110  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637442  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2141  Hydantoinase/oxoprolinase  33.53 
 
 		 519 aa  110  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0444045 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1886  hydantoinase/oxoprolinase  29.56 
 
 		 560 aa  110  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2368  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30 
 
 		 680 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.773275  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2452  Hydantoinase/oxoprolinase  27.17 
 
 		 513 aa  108  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.79439  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2126  Hydantoinase/oxoprolinase  27.35 
 
 		 556 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.031039  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4028  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.76 
 
 		 711 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3664  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30 
 
 		 691 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00438442 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0975  hydantoinase/oxoprolinase  27.93 
 
 		 559 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2018  Hydantoinase/oxoprolinase  31.18 
 
 		 707 aa  109  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1032  Hydantoinase/oxoprolinase  24.78 
 
 		 546 aa  108  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3766  hydantoinase/oxoprolinase  27.76 
 
 		 710 aa  108  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2949  hydantoinase/oxoprolinase  31.83 
 
 		 519 aa  107  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0427  hydantoinase/oxoprolinase  31.01 
 
 		 519 aa  107  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0645976  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0990  hydantoinase/oxoprolinase  29.4 
 
 		 557 aa  106  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.454811 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1913  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.23 
 
 		 684 aa  104  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0388506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2529  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.69 
 
 		 685 aa  104  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413249  normal  0.693617 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5243  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30 
 
 		 765 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6536  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.12 
 
 		 678 aa  103  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.234426 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9128  hydantoin utilization protein  28.61 
 
 		 680 aa  103  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4047  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.82 
 
 		 676 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0166577  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4110  Hydantoinase/oxoprolinase  31.56 
 
 		 522 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.571056  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5342  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.79 
 
 		 699 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3731  hydantoinase/oxoprolinase  30.46 
 
 		 692 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6263  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.03 
 
 		 673 aa  102  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1825  hydantoinase/oxoprolinase  28.89 
 
 		 523 aa  102  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2226  5-oxoprolinase  29.62 
 
 		 680 aa  101  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460045  normal  0.133433 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5474  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.42 
 
 		 692 aa  101  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8176  hydantoin utilization protein  28.8 
 
 		 681 aa  100  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0371  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.68 
 
 		 707 aa  101  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2647  hydantoinase/oxoprolinase  28.5 
 
 		 678 aa  100  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5622  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.23 
 
 		 706 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.49803 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2513  Hydantoinase/oxoprolinase  30.52 
 
 		 734 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0865  Hydantoinase/oxoprolinase  28.39 
 
 		 518 aa  100  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.235208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5378  hydantoinase  28.81 
 
 		 517 aa  100  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3103  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  29.89 
 
 		 660 aa  99.8  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.133099  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3115  Hydantoinase/oxoprolinase  30.89 
 
 		 686 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00009  hypothetical N-methylhydantoinase (Eurofung)  29.69 
 
 		 1362 aa  99.4  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000169521 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0654  hydantoinase/oxoprolinase  26.15 
 
 		 708 aa  99.4  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3601  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.3 
 
 		 682 aa  99  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2860  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.23 
 
 		 684 aa  98.6  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01100  hypothetical 5-oxoprolinase (Eurofung)  28.72 
 
 		 1355 aa  98.6  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0381114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2942  5-oxoprolinase  31.98 
 
 		 669 aa  98.6  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6223  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.1 
 
 		 690 aa  98.2  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220681  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0475  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.95 
 
 		 680 aa  98.2  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5632  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.27 
 
 		 698 aa  97.8  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0796839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4426  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.69 
 
 		 692 aa  97.8  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3649  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.27 
 
 		 721 aa  97.4  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.495656  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0079  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.46 
 
 		 687 aa  97.4  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3366  N-methylhydantoinase A, beta-subunit (ATP- hydrolyzing)  32.94 
 
 		 507 aa  96.7  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.712496  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0176  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.05 
 
 		 682 aa  96.3  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1063  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.39 
 
 		 663 aa  96.3  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.39661  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2734  Hydantoinase/oxoprolinase  26.53 
 
 		 559 aa  96.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2447  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.24 
 
 		 683 aa  95.5  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>