42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2929 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2929  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 111 aa  212  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.814408 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2173  branched-chain amino acid transport  60.75 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1469  branched-chain amino acid transport  52.38 
 
 		 107 aa  103  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.656646  normal  0.0172198 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3054  branched-chain amino acid transport  50.94 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2569  branched-chain amino acid transport  48.86 
 
 		 95 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0159  hypothetical protein  53.27 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258263  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0522  branched-chain amino acid transport  39.81 
 
 		 116 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4093  hypothetical protein  36.27 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0257  branched-chain amino acid transport  36.84 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.751249  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0923  branched-chain amino acid transport  35.45 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.327368  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  45.16 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1600  hypothetical protein  34.95 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.532771  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1563  hypothetical protein  34.95 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.574296  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1552  hypothetical protein  34.95 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1723  hypothetical protein  34.95 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1773  hypothetical protein  34.95 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  45.16 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0195  branched-chain amino acid transport  38.46 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.392711 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0349  branched-chain amino acid transport  52.81 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1599  branched-chain amino acid transport  36.96 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.817749  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1796  hypothetical protein  33.98 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1851  hypothetical protein  37.5 
 
 		 103 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1242  branched chain amino acid ABC transporter  52.08 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1742  hypothetical protein  37.5 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3601  hypothetical protein  36.36 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  41.46 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01820  branched-chain amino acid transport  40 
 
 		 100 aa  53.5  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.300489  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2542  hypothetical protein  30.28 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2596  branched-chain amino acid transport  46.15 
 
 		 103 aa  50.4  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0011  hypothetical protein  26.61 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0011  hypothetical protein  26.61 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0494  hypothetical protein  45.16 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1604  branched-chain amino acid transport  31.34 
 
 		 102 aa  47.4  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0310  branched-chain amino acid transport  32.35 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  32.26 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1024  branched-chain amino acid transport  29.85 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0636348  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2350  branched-chain amino acid transport  38.95 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.771516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  38 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1743  hypothetical protein  29.03 
 
 		 108 aa  43.5  0.0009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00109007  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1392  branched-chain amino acid transport  35.64 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952567  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2050  hypothetical protein  32.41 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1478  branched-chain amino acid transport  42.11 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>