More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2927 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
288 aa  585  1e-166  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  71.14 
 
 
267 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  52.67 
 
 
270 aa  275  5e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  54.89 
 
 
276 aa  271  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  34.08 
 
 
348 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  33.52 
 
 
349 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  35.64 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  34.08 
 
 
349 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  36.11 
 
 
354 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  39.64 
 
 
876 aa  108  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  37.5 
 
 
671 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 
671 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  33.5 
 
 
335 aa  107  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  36.47 
 
 
671 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  28.84 
 
 
263 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  35.12 
 
 
182 aa  102  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  34.73 
 
 
664 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  28.33 
 
 
248 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  27.31 
 
 
249 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  34.05 
 
 
273 aa  99.4  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  34.05 
 
 
276 aa  99  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  30.16 
 
 
339 aa  97.1  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  28.72 
 
 
265 aa  93.6  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  33.71 
 
 
241 aa  93.2  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  28.04 
 
 
262 aa  90.9  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2358  DSBA oxidoreductase  32.73 
 
 
179 aa  90.5  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147165  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  27.51 
 
 
263 aa  90.1  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
307 aa  89  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  31.46 
 
 
629 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  33.77 
 
 
624 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1905  DSBA oxidoreductase  31.98 
 
 
296 aa  86.7  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  28.11 
 
 
293 aa  86.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  30.61 
 
 
313 aa  85.9  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  31.21 
 
 
230 aa  85.9  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  30.41 
 
 
173 aa  85.9  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  29.47 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  32.79 
 
 
241 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  29.67 
 
 
251 aa  85.1  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0894  DSBA oxidoreductase  37.8 
 
 
188 aa  84.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  29.78 
 
 
259 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  29.13 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  29.78 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  35.71 
 
 
652 aa  83.6  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4951  DSBA oxidoreductase  32.52 
 
 
262 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120355  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1824  DSBA oxidoreductase  30.17 
 
 
306 aa  84  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  normal  0.303967 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  34.1 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  28.89 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  28.95 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  31.9 
 
 
211 aa  81.6  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  31.71 
 
 
268 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  31.61 
 
 
600 aa  80.9  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  32.5 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  27.8 
 
 
248 aa  81.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  33.66 
 
 
652 aa  80.1  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  26.06 
 
 
240 aa  79.7  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  31.21 
 
 
553 aa  79.7  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  30.46 
 
 
281 aa  79.3  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  35.57 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1312  DsbA-like disulfide oxidoreductase  23.21 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0500823  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  32.91 
 
 
173 aa  79  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  26.15 
 
 
254 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  32.73 
 
 
172 aa  78.2  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  28.68 
 
 
238 aa  79  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  31.61 
 
 
616 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  29.73 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.88 
 
 
253 aa  77  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  29.09 
 
 
222 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1627  DSBA oxidoreductase  27.95 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  28.74 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  28.44 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  29.52 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  28.74 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  26.45 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  28.44 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  29.07 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  32.78 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  26.91 
 
 
268 aa  75.5  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  27.75 
 
 
210 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  29.38 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2981  putative protein-disulfide isomerase  27.51 
 
 
247 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241141  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  28.32 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  28.29 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  27.89 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  26.98 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  30.14 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  32.37 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  30.26 
 
 
617 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  32.78 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  28.7 
 
 
311 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  29.73 
 
 
242 aa  73.6  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1440  DsbA oxidoreductase  27.4 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  25.84 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  28.83 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  26.98 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  28.48 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  27.35 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  26.92 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  31.07 
 
 
211 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3248  DSBA oxidoreductase  28.42 
 
 
226 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0322461  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  33.1 
 
 
235 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>