More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2905 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2905  putative CheW protein  100 
 
 
317 aa  648    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2021  response regulator receiver modulated CheW protein  88.25 
 
 
316 aa  565  1e-160  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0391  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  83.91 
 
 
318 aa  553  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2084  response regulator receiver modulated CheW protein  71.87 
 
 
336 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.364681  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3100  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  55.97 
 
 
312 aa  340  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1997  putative CheW protein  53.31 
 
 
320 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.151796  normal  0.289179 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2308  putative CheW protein  53.14 
 
 
316 aa  328  6e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2939  response regulator receiver modulated CheW protein  56.6 
 
 
323 aa  328  9e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112041 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1493  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  52.2 
 
 
318 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000176679  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2643  response regulator receiver modulated CheW protein  45.74 
 
 
390 aa  310  2e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0147  response regulator receiver modulated CheW protein  50.16 
 
 
321 aa  301  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0197  response regulator receiver modulated CheW protein  47.42 
 
 
346 aa  292  5e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3068  CheW protein  43.77 
 
 
315 aa  259  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.591629  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1207  chemotaxis protein CheV  39.03 
 
 
328 aa  256  4e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0176167  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3188  putative CheW protein  40.38 
 
 
326 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1179  response regulator receiver modulated CheW protein  40.38 
 
 
326 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3194  putative CheW protein  40.38 
 
 
326 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3332  putative CheW protein  40.38 
 
 
326 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2798  putative CheW protein  39.37 
 
 
326 aa  248  7e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000281  chemotaxis protein CheV  39.16 
 
 
342 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.261322  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05890  hypothetical protein  38.46 
 
 
326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4442  response regulator receiver modulated CheW protein  38.98 
 
 
324 aa  235  6e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0508  putative CheW protein  36.62 
 
 
326 aa  231  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  41.69 
 
 
301 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2739  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  41.12 
 
 
312 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0066  response regulator receiver modulated CheW protein  43.42 
 
 
308 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000119617  hitchhiker  0.00287896 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0724  response regulator receiver modulated CheW protein  39.62 
 
 
313 aa  217  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.95273e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0879  chemotaxis protein CheV  38.94 
 
 
312 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.877082  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0712  response regulator receiver modulated CheW protein  39.87 
 
 
313 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2548  response regulator receiver modulated CheW protein  39.12 
 
 
312 aa  205  9e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000602434  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1583  response regulator receiver modulated CheW protein  37.78 
 
 
316 aa  204  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000416178  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1284  putative CheW protein  35.85 
 
 
314 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1723  chemotaxis protein CheV  37.06 
 
 
302 aa  196  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3623  chemotaxis protein CheV  37.06 
 
 
302 aa  196  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1777  chemotaxis protein CheV  36.74 
 
 
302 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.782238  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2045  chemotaxis signal transduction protein, CheV-like  37.66 
 
 
324 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.85794e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1544  chemotaxis protein  37.38 
 
 
302 aa  196  6e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0242489  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1533  chemotaxis protein  37.38 
 
 
302 aa  196  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1832  chemotaxis protein CheV  36.74 
 
 
302 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1754  chemotaxis protein CheV  37.38 
 
 
302 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1573  response regulator receiver modulated CheW protein  37.06 
 
 
302 aa  195  7e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2843  response regulator receiver modulated CheW protein  37.3 
 
 
302 aa  195  7e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1369  putative CheW protein  36.31 
 
 
302 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000715462  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1572  response regulator receiver modulated CheW protein  36 
 
 
301 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1656  ATP synthase gamma chain (ATP synthase F1 sector gammasubunit)  35.11 
 
 
317 aa  179  4e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.184709  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0333  chemotaxis protein CheV  35.86 
 
 
318 aa  178  1e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1686  chemotaxis protein CheV  35.86 
 
 
318 aa  178  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.468174  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0311  chemotaxis protein CheV  35.86 
 
 
318 aa  178  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0204  CheW domain protein  35.22 
 
 
316 aa  177  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000487468  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1370  chemotaxis protein CheV  36.21 
 
 
317 aa  176  4e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  33.22 
 
 
311 aa  176  4e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1579  chemotaxis protein CheV  34.49 
 
 
317 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.184882  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1531  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  36.33 
 
 
313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.577848  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0196  response regulator receiver modulated CheW protein  36.81 
 
 
346 aa  172  5e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.031176  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0330  chemotaxis protein CheV  33.96 
 
 
318 aa  169  7e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3225  response regulator receiver modulated CheW protein  33.44 
 
 
322 aa  169  8e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185014  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  32.97 
 
 
308 aa  157  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  33.44 
 
 
308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0734  response regulator receiver:CheW-like protein  31.91 
 
 
322 aa  152  8e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  33.11 
 
 
319 aa  152  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  33.89 
 
 
308 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  32.98 
 
 
309 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  33.22 
 
 
312 aa  149  5e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  32.8 
 
 
309 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  30.97 
 
 
310 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  30.95 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  30.87 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  31.29 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3501  response regulator receiver modulated CheW protein  30.82 
 
 
316 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4573  response regulator receiver modulated CheW protein  30.82 
 
 
316 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  31.65 
 
 
306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  31.65 
 
 
306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  31.65 
 
 
306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  31.65 
 
 
306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  30.82 
 
 
306 aa  146  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  33.57 
 
 
310 aa  146  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0735  response regulator receiver:CheW-like protein  32.57 
 
 
311 aa  146  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2613  response regulator receiver modulated CheW protein  32.89 
 
 
325 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  31.29 
 
 
310 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  32.5 
 
 
311 aa  145  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  30.61 
 
 
306 aa  144  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2470  response regulator receiver modulated CheW protein  31.15 
 
 
324 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  30.82 
 
 
306 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  30.82 
 
 
306 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  31.15 
 
 
310 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  30.27 
 
 
306 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  30.49 
 
 
313 aa  143  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1838  response regulator receiver modulated CheW protein  29.93 
 
 
321 aa  144  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.230108  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  30.48 
 
 
306 aa  143  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  31.83 
 
 
309 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1449  response regulator receiver modulated CheW protein  29.8 
 
 
321 aa  143  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.199084  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  31.83 
 
 
309 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  32.56 
 
 
309 aa  142  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  31.83 
 
 
309 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  31.09 
 
 
308 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  31.09 
 
 
308 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2819  putative CheW protein  32.03 
 
 
330 aa  142  9e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  33.46 
 
 
310 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  29.59 
 
 
306 aa  140  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  31.39 
 
 
306 aa  139  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>