More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2890 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 386 aa  764    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  72.21 
 
 		 481 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  64.08 
 
 		 385 aa  476  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  63.31 
 
 		 426 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  54.35 
 
 		 412 aa  390  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  53.11 
 
 		 425 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  50.91 
 
 		 397 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  49.09 
 
 		 384 aa  338  7e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  44.31 
 
 		 389 aa  300  3e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  43.98 
 
 		 385 aa  298  1e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  49.1 
 
 		 409 aa  297  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  42.31 
 
 		 391 aa  294  2e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  50 
 
 		 418 aa  292  7e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  45.48 
 
 		 410 aa  291  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  49.74 
 
 		 418 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  50.39 
 
 		 399 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  41.39 
 
 		 390 aa  288  1e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  40.73 
 
 		 390 aa  288  1e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  49.48 
 
 		 418 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  41.45 
 
 		 408 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  40.36 
 
 		 409 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  49.55 
 
 		 419 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  48.94 
 
 		 419 aa  283  5.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  43.9 
 
 		 408 aa  283  5.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  40.83 
 
 		 407 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  47.52 
 
 		 380 aa  282  6.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  39.95 
 
 		 393 aa  280  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  43.86 
 
 		 408 aa  278  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  43.38 
 
 		 399 aa  276  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  45.91 
 
 		 402 aa  277  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  40.97 
 
 		 360 aa  276  5e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  43.64 
 
 		 406 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  46.53 
 
 		 363 aa  273  5.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1679  DNA polymerase IV  38.52 
 
 		 385 aa  271  1e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  48.51 
 
 		 424 aa  270  4e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  45.13 
 
 		 422 aa  269  8e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  42.75 
 
 		 415 aa  268  8e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  47.2 
 
 		 369 aa  268  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  43.46 
 
 		 395 aa  268  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  37.05 
 
 		 409 aa  268  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  37.14 
 
 		 409 aa  267  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  42.09 
 
 		 359 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  36.5 
 
 		 410 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  44.07 
 
 		 430 aa  266  5e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  45.67 
 
 		 356 aa  265  1e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  41.15 
 
 		 425 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  47.48 
 
 		 355 aa  265  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  48.05 
 
 		 420 aa  264  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  36.88 
 
 		 409 aa  264  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  43.57 
 
 		 430 aa  263  4e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  43.95 
 
 		 375 aa  263  4.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  48.14 
 
 		 360 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  45.54 
 
 		 359 aa  262  6e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  44.09 
 
 		 415 aa  262  8.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  39.22 
 
 		 410 aa  261  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  43.45 
 
 		 373 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  44.01 
 
 		 378 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  42.82 
 
 		 413 aa  260  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  44.57 
 
 		 410 aa  260  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  45.24 
 
 		 354 aa  260  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  45.51 
 
 		 378 aa  259  6e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  46.59 
 
 		 356 aa  258  8e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  43.11 
 
 		 363 aa  258  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  43.99 
 
 		 359 aa  257  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  38.34 
 
 		 413 aa  256  5e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6871  DNA-directed DNA polymerase  37.89 
 
 		 404 aa  256  6e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  37.4 
 
 		 408 aa  256  7e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  43.24 
 
 		 371 aa  253  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  41.89 
 
 		 359 aa  253  3e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  42.65 
 
 		 365 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  43.14 
 
 		 381 aa  252  8.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  41.34 
 
 		 414 aa  252  9.000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  42.69 
 
 		 359 aa  251  2e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  43.08 
 
 		 417 aa  250  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1494  DNA polymerase IV  41.88 
 
 		 418 aa  250  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  42.22 
 
 		 417 aa  250  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02810  DNA polymerase IV  40.83 
 
 		 368 aa  249  4e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.495536  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  43.08 
 
 		 449 aa  249  5e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  41 
 
 		 358 aa  249  8e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0662  DNA-directed DNA polymerase  41.02 
 
 		 353 aa  248  9e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2975  DNA polymerase IV  46.52 
 
 		 443 aa  246  6e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.949481  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3857  DNA polymerase IV  43.81 
 
 		 432 aa  245  9e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  41.45 
 
 		 385 aa  245  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1566  DNA polymerase IV  44.79 
 
 		 369 aa  245  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0682981  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  40.11 
 
 		 354 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  41.07 
 
 		 369 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2097  DNA-directed DNA polymerase  45.27 
 
 		 373 aa  244  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7420  DNA polymerase IV  42.59 
 
 		 429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108606  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4721  DNA polymerase IV  41.53 
 
 		 425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  42.3 
 
 		 417 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  42.51 
 
 		 396 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4326  DNA-directed DNA polymerase  46.29 
 
 		 463 aa  243  5e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49996  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6682  DNA polymerase IV  43.12 
 
 		 435 aa  243  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  43.15 
 
 		 376 aa  242  6e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  42.48 
 
 		 378 aa  242  6e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  42.48 
 
 		 378 aa  242  6e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  43.95 
 
 		 360 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  35.55 
 
 		 411 aa  242  9e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  40.99 
 
 		 423 aa  241  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  39.95 
 
 		 417 aa  241  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>