More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2811 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2811  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 323 aa  640    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.612924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1966  thiamine-monophosphate kinase  54.4 
 
 		 365 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3570  thiamine-monophosphate kinase  52.51 
 
 		 339 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0070  thiamine-monophosphate kinase  50.3 
 
 		 356 aa  299  4e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2006  thiamine-monophosphate kinase  46.42 
 
 		 329 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  40.43 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  38.34 
 
 		 329 aa  146  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  36.42 
 
 		 327 aa  142  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  35.08 
 
 		 300 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  35.28 
 
 		 344 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  36.73 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  39.02 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  37.65 
 
 		 323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  37.54 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  36.86 
 
 		 328 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  34.91 
 
 		 315 aa  135  8e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  35.61 
 
 		 318 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  42.11 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  37.11 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  30.98 
 
 		 306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  36.82 
 
 		 327 aa  133  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  34.76 
 
 		 332 aa  132  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  31.58 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  36.81 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1597  thiamine-monophosphate kinase  35.45 
 
 		 346 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  35.05 
 
 		 329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  35.06 
 
 		 329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  35 
 
 		 318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  34.66 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  32.21 
 
 		 369 aa  130  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  34.74 
 
 		 329 aa  130  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  31.44 
 
 		 305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3206  thiamine-monophosphate kinase  34.6 
 
 		 361 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  35.08 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  33.09 
 
 		 334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004260  thiamine-monophosphate kinase  33.64 
 
 		 321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0240227  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  34.67 
 
 		 318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01171  thiamine monophosphate kinase  32 
 
 		 321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  34.17 
 
 		 337 aa  129  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  34.41 
 
 		 329 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  33.84 
 
 		 330 aa  129  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  34.23 
 
 		 318 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  37.16 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  34.16 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3919  thiamine-monophosphate kinase  37.21 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  33.93 
 
 		 323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  34.97 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  33.93 
 
 		 318 aa  127  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  32.6 
 
 		 332 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  35.29 
 
 		 321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3665  thiamine-monophosphate kinase  36.58 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  33.53 
 
 		 318 aa  126  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 		 323 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  33.04 
 
 		 323 aa  125  9e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  33.73 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  34.52 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1856  thiamine monophosphate kinase  30.77 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0710389  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0711  thiamine-monophosphate kinase  36.7 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  33.04 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1597  thiamine-phosphate kinase  35.28 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  35.24 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0487  thiamine-monophosphate kinase  34.89 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  33.99 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  32.2 
 
 		 319 aa  123  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  30.86 
 
 		 332 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  32.74 
 
 		 323 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  36.11 
 
 		 326 aa  122  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  34.98 
 
 		 375 aa  122  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  33.85 
 
 		 314 aa  122  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  33.64 
 
 		 320 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  32.5 
 
 		 319 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  35.99 
 
 		 317 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1050  thiamine monophosphate kinase  35.62 
 
 		 322 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  33.64 
 
 		 341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  29.03 
 
 		 336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0565  thiamine monophosphate kinase  37.1 
 
 		 322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  36.69 
 
 		 334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  35.91 
 
 		 317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  34.02 
 
 		 326 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  31.71 
 
 		 354 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8038  thiamine-monophosphate kinase  41.24 
 
 		 370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11460  thiamine monophosphate kinase  35.83 
 
 		 322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0770171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  33.43 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  32.3 
 
 		 321 aa  119  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  36.17 
 
 		 324 aa  119  6e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0554  thiamine monophosphate kinase  36.77 
 
 		 322 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  33.68 
 
 		 333 aa  119  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  34.02 
 
 		 326 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  34.02 
 
 		 326 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 		 334 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  36.7 
 
 		 332 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  32.34 
 
 		 346 aa  119  7.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  34.02 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  32.91 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2581  thiamine-monophosphate kinase  36.94 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  31.16 
 
 		 335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  32.56 
 
 		 331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  33.73 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  33.43 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  36.98 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>