More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2808 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2808  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 		 331 aa  656    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2308  KpsF/GutQ family protein  83.33 
 
 		 333 aa  533  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0335  KpsF/GutQ family protein  67.56 
 
 		 334 aa  436  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00223142  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0322  KpsF/GutQ family protein  62.23 
 
 		 340 aa  394  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3213  KpsF/GutQ family protein  60.99 
 
 		 331 aa  376  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0006  KpsF/GutQ family protein  49.06 
 
 		 357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  51.46 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2110  KpsF/GutQ family protein  48.32 
 
 		 332 aa  296  4e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613072  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  43.95 
 
 		 315 aa  293  2e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  47.32 
 
 		 321 aa  294  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0213  KpsF/GutQ  42.59 
 
 		 320 aa  293  2e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1747  KpsF/GutQ  48.73 
 
 		 326 aa  292  5e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  49.68 
 
 		 339 aa  291  7e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0334  KpsF/GutQ family protein  44.31 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0401  KpsF/GutQ family protein  45.08 
 
 		 326 aa  290  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  46.11 
 
 		 323 aa  290  3e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  46.48 
 
 		 329 aa  289  6e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  46.37 
 
 		 321 aa  287  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  47 
 
 		 321 aa  286  4e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  47.48 
 
 		 333 aa  286  4e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0436  KpsF/GutQ family protein  46.6 
 
 		 326 aa  286  4e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  47.32 
 
 		 321 aa  286  5e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0731  Arabinose-5-phosphate isomerase  49.07 
 
 		 325 aa  285  5.999999999999999e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  43.53 
 
 		 320 aa  285  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  43.53 
 
 		 320 aa  285  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0438  KpsF/GutQ family protein  45.4 
 
 		 326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.181851 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  46.88 
 
 		 320 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  45.14 
 
 		 326 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  44.06 
 
 		 324 aa  284  2.0000000000000002e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  47.32 
 
 		 326 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  48.87 
 
 		 333 aa  282  5.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2225  KpsF/GutQ family protein  50.32 
 
 		 341 aa  282  5.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.574714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  44.58 
 
 		 345 aa  282  6.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  44.58 
 
 		 345 aa  282  7.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  47.63 
 
 		 322 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  46.54 
 
 		 322 aa  281  8.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  43.75 
 
 		 324 aa  281  8.000000000000001e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  46.23 
 
 		 322 aa  281  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  42.95 
 
 		 323 aa  281  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0467  KpsF/GutQ  44.55 
 
 		 328 aa  280  2e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0529  KpsF/GutQ family protein  49.22 
 
 		 327 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.64598  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  48.06 
 
 		 330 aa  280  3e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2797  KpsF/GutQ family protein  48.6 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.154837 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5294  KpsF/GutQ family protein  47.76 
 
 		 332 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.14 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.14 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.14 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6116  KpsF/GutQ family sugar isomerase  48.29 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  46.3 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.14 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.14 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0137  KpsF/GutQ family protein  49.52 
 
 		 335 aa  276  4e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0922  sugar isomerase  42.9 
 
 		 330 aa  275  7e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  46.47 
 
 		 333 aa  275  7e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0601  KpsF/GutQ family protein  47.98 
 
 		 327 aa  275  8e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0442241 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2172  KpsF/GutQ family protein  48.29 
 
 		 327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3372  KpsF/GutQ family protein  41.61 
 
 		 325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.600625  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2786  KpsF/GutQ family protein  48.29 
 
 		 327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258492  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1612  KpsF/GutQ family protein  46.69 
 
 		 330 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.2 
 
 		 328 aa  273  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0491  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  47.98 
 
 		 327 aa  273  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566737  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  45 
 
 		 331 aa  273  3e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2704  KpsF/GutQ family protein  48.29 
 
 		 327 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0680644 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1492  KpsF/GutQ family protein  42.59 
 
 		 330 aa  273  4.0000000000000004e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  47.76 
 
 		 333 aa  272  5.000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  43.75 
 
 		 344 aa  272  6e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.89 
 
 		 328 aa  272  7e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.83 
 
 		 328 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  44.83 
 
 		 328 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.83 
 
 		 328 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.83 
 
 		 328 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  44.83 
 
 		 328 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.83 
 
 		 328 aa  271  8.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.83 
 
 		 328 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1749  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  42.01 
 
 		 319 aa  271  8.000000000000001e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.83 
 
 		 328 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4117  KpsF/GutQ  47.66 
 
 		 327 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.83 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  46.06 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3339  KpsF/GutQ family protein  49.07 
 
 		 326 aa  270  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  41.96 
 
 		 321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2788  sugar phosphate isomerase  46.52 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000495576  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  46.18 
 
 		 335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1058  KpsF/GutQ family protein  44.94 
 
 		 338 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.335757 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0071  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  47.04 
 
 		 327 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3102  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  47.04 
 
 		 327 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0770  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  47.04 
 
 		 327 aa  269  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2947  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  47.04 
 
 		 327 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  42.86 
 
 		 324 aa  269  4e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1519  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  47.04 
 
 		 327 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0602  KpsF/GutQ family sugar isomerase  47.04 
 
 		 327 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2846  KpsF/GutQ family protein  47.98 
 
 		 327 aa  269  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0064  KpsF/GutQ family protein  42.27 
 
 		 321 aa  269  5e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  43.61 
 
 		 323 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0404  KpsF/GutQ family protein  43.41 
 
 		 323 aa  268  1e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.126623 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3910  KpsF/GutQ family protein  45.02 
 
 		 310 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0586  KpsF/GutQ family sugar isomerase  46.73 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0331  KpsF/GutQ family protein  47.04 
 
 		 346 aa  267  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.69 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0918  polysialic acid capsule expression protein, KpsF/GutQ family protein  43.87 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>