More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2807 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
462 aa  952    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3212  amidophosphoribosyltransferase  71.43 
 
 
463 aa  704    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.903412  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  80.95 
 
 
462 aa  788    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2307  amidophosphoribosyltransferase  83.62 
 
 
467 aa  825    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  71.83 
 
 
461 aa  705    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0008  amidophosphoribosyltransferase  67.1 
 
 
467 aa  623  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  59.02 
 
 
487 aa  551  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0122  amidophosphoribosyltransferase  56 
 
 
467 aa  519  1e-146  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  53.83 
 
 
477 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  52.8 
 
 
468 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  53.83 
 
 
477 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  53.38 
 
 
474 aa  514  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  53.83 
 
 
466 aa  512  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  54.28 
 
 
467 aa  510  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  54.16 
 
 
475 aa  511  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  52.53 
 
 
469 aa  500  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  53.71 
 
 
474 aa  500  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  54.27 
 
 
466 aa  496  1e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  51.78 
 
 
488 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  53.44 
 
 
481 aa  485  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  53.44 
 
 
475 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  53.81 
 
 
465 aa  486  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  52 
 
 
482 aa  487  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  53.69 
 
 
476 aa  478  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  52.56 
 
 
494 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  52.56 
 
 
494 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4629  amidophosphoribosyltransferase  51.1 
 
 
500 aa  478  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691036  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  51.43 
 
 
472 aa  476  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  48.81 
 
 
487 aa  476  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  50.54 
 
 
480 aa  476  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5556  amidophosphoribosyltransferase  54.1 
 
 
511 aa  477  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  50.56 
 
 
471 aa  475  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  51.31 
 
 
470 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  49.66 
 
 
471 aa  474  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  49.66 
 
 
471 aa  472  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  49.66 
 
 
471 aa  472  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  49.66 
 
 
471 aa  472  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  49.66 
 
 
471 aa  472  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  49.12 
 
 
488 aa  473  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  49.66 
 
 
471 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  51.46 
 
 
478 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2599  amidophosphoribosyltransferase  50.88 
 
 
499 aa  473  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0391838  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  49.66 
 
 
471 aa  472  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1871  amidophosphoribosyltransferase  52.03 
 
 
451 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.10696  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  49.22 
 
 
471 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  50.67 
 
 
474 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3588  amidophosphoribosyltransferase  51.66 
 
 
503 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.51846 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  49.78 
 
 
475 aa  471  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4300  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
491 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal  0.0484415 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  49.22 
 
 
471 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3932  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
491 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.961822  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  51.42 
 
 
485 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2400  amidophosphoribosyltransferase  48.24 
 
 
514 aa  465  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  50.56 
 
 
496 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3699  amidophosphoribosyltransferase  51.44 
 
 
493 aa  467  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549743  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  49.22 
 
 
471 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4407  amidophosphoribosyltransferase  49.34 
 
 
491 aa  463  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  50.76 
 
 
474 aa  463  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2878  amidophosphoribosyltransferase  49.02 
 
 
517 aa  464  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.116336 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  50.98 
 
 
485 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  50.98 
 
 
485 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
470 aa  463  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  49.01 
 
 
495 aa  458  9.999999999999999e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0004  amidophosphoribosyltransferase  49.33 
 
 
493 aa  458  9.999999999999999e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.645305  normal  0.0907172 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1137  amidophosphoribosyltransferase  51.01 
 
 
445 aa  458  1e-127  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  48.88 
 
 
465 aa  457  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3487  amidophosphoribosyltransferase  49.01 
 
 
503 aa  457  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746658  normal  0.621078 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1147  amidophosphoribosyltransferase  48.58 
 
 
478 aa  454  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218005  normal  0.314166 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0174  amidophosphoribosyltransferase  48.99 
 
 
445 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.838457  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3894  amidophosphoribosyltransferase  48.23 
 
 
491 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0405  amidophosphoribosyltransferase  49.12 
 
 
493 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0997  amidophosphoribosyltransferase  49 
 
 
482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421996  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0051  amidophosphoribosyltransferase  48.16 
 
 
479 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2502  amidophosphoribosyltransferase  49.01 
 
 
500 aa  453  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2072  amidophosphoribosyltransferase  49.24 
 
 
506 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  48.21 
 
 
456 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0396  amidophosphoribosyltransferase  46.75 
 
 
459 aa  451  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3396  amidophosphoribosyltransferase  49.11 
 
 
492 aa  451  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  48.57 
 
 
503 aa  451  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2997  amidophosphoribosyltransferase  47.36 
 
 
514 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.807987  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1196  amidophosphoribosyltransferase  49.55 
 
 
472 aa  450  1e-125  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  50.11 
 
 
480 aa  449  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3787  amidophosphoribosyltransferase  48.89 
 
 
510 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1222  amidophosphoribosyltransferase  49.1 
 
 
472 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.433131  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1523  amidophosphoribosyltransferase  46.75 
 
 
459 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0119394  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0439  amidophosphoribosyltransferase  47.09 
 
 
459 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1205  amidophosphoribosyltransferase  49.55 
 
 
493 aa  445  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0299  amidophosphoribosyltransferase  47.53 
 
 
446 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0578  amidophosphoribosyltransferase  46.68 
 
 
486 aa  444  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1594  amidophosphoribosyltransferase  47.17 
 
 
464 aa  444  1e-123  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0292  amidophosphoribosyltransferase  47.66 
 
 
459 aa  444  1e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2452  amidophosphoribosyltransferase  47.8 
 
 
514 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2109  amidophosphoribosyltransferase  47.77 
 
 
475 aa  442  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3501  amidophosphoribosyltransferase  46.9 
 
 
509 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0674  amidophosphoribosyltransferase  46.53 
 
 
473 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0672  amidophosphoribosyltransferase  46.31 
 
 
473 aa  443  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1618  amidophosphoribosyltransferase  47.87 
 
 
506 aa  442  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  49.13 
 
 
484 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2311  amidophosphoribosyltransferase  48.89 
 
 
501 aa  444  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3637  amidophosphoribosyltransferase  48.78 
 
 
499 aa  441  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.811729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>