More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2740 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  73.76 
 
 		 427 aa  652    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  80.66 
 
 		 425 aa  732    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 424 aa  875    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  67.85 
 
 		 426 aa  615  1e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  68.72 
 
 		 424 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  62.09 
 
 		 427 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  61.65 
 
 		 422 aa  541  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  61.7 
 
 		 422 aa  542  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  61.47 
 
 		 424 aa  544  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  61.61 
 
 		 423 aa  543  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  59.34 
 
 		 424 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  63.27 
 
 		 423 aa  536  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  61.23 
 
 		 423 aa  536  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  60.76 
 
 		 422 aa  536  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  60.66 
 
 		 422 aa  534  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  59.57 
 
 		 427 aa  528  1e-149  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  60.66 
 
 		 422 aa  528  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  61.47 
 
 		 424 aa  528  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  60.38 
 
 		 424 aa  526  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  60.62 
 
 		 424 aa  527  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  60.62 
 
 		 424 aa  527  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  60.62 
 
 		 424 aa  527  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  60.62 
 
 		 424 aa  527  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  60.38 
 
 		 424 aa  526  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  60.14 
 
 		 424 aa  525  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  60.91 
 
 		 420 aa  528  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  60.62 
 
 		 424 aa  527  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  60.62 
 
 		 424 aa  526  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  60.38 
 
 		 424 aa  526  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  60.62 
 
 		 424 aa  527  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  56.4 
 
 		 423 aa  521  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  59.76 
 
 		 424 aa  522  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  58.89 
 
 		 423 aa  521  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  57.79 
 
 		 422 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  58.59 
 
 		 427 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  59 
 
 		 427 aa  515  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  57.82 
 
 		 423 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  60.61 
 
 		 423 aa  511  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  59.47 
 
 		 425 aa  511  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  57.61 
 
 		 432 aa  512  1e-144  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  57.92 
 
 		 427 aa  510  1e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  57.18 
 
 		 422 aa  509  1e-143  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  58.99 
 
 		 421 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  57.44 
 
 		 433 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  57.28 
 
 		 425 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  57.44 
 
 		 433 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  57.44 
 
 		 433 aa  503  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  57.44 
 
 		 433 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  56.64 
 
 		 423 aa  502  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  57.28 
 
 		 425 aa  504  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  57.44 
 
 		 433 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  57.21 
 
 		 433 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  57.92 
 
 		 425 aa  498  1e-140  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  56.98 
 
 		 433 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  56.98 
 
 		 433 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  56.98 
 
 		 433 aa  500  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  56.98 
 
 		 433 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  56.98 
 
 		 433 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  56.98 
 
 		 433 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  56.74 
 
 		 433 aa  500  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  56.98 
 
 		 433 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  56.98 
 
 		 433 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  58.16 
 
 		 425 aa  499  1e-140  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1666  seryl-tRNA synthetase  57.31 
 
 		 428 aa  498  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.746595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  57.28 
 
 		 427 aa  497  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  57.11 
 
 		 430 aa  496  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  56.02 
 
 		 438 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2145  seryl-tRNA synthetase  56.45 
 
 		 438 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0642  seryl-tRNA synthetase  55.61 
 
 		 432 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  55.32 
 
 		 434 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  56.31 
 
 		 431 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2315  seryl-tRNA synthetase  57.18 
 
 		 425 aa  492  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00701941  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  56.94 
 
 		 426 aa  493  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  56.84 
 
 		 424 aa  493  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849075 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1547  seryl-tRNA synthetase  57.45 
 
 		 424 aa  491  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  56 
 
 		 426 aa  488  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  56.22 
 
 		 438 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  57.45 
 
 		 425 aa  488  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3582  seryl-tRNA synthetase  56.24 
 
 		 426 aa  490  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0780205  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  55.84 
 
 		 431 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4000  seryl-tRNA synthetase  56.94 
 
 		 426 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.279963  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  54.8 
 
 		 428 aa  485  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3605  seryl-tRNA synthetase  56.71 
 
 		 426 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837669 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0695  seryl-tRNA synthetase  54.27 
 
 		 435 aa  485  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  56.6 
 
 		 423 aa  485  1e-136  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  54.61 
 
 		 428 aa  483  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  55.27 
 
 		 428 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  54.78 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1833  seryl-tRNA synthetase  56.71 
 
 		 426 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000844174 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2195  seryl-tRNA synthetase  55.27 
 
 		 428 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000518192  normal  0.265088 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3404  seryl-tRNA synthetase  56.47 
 
 		 426 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.25013 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  55.27 
 
 		 428 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  55.27 
 
 		 428 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  58.1 
 
 		 425 aa  479  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  55.04 
 
 		 428 aa  479  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1770  seryl-tRNA synthetase  57.11 
 
 		 423 aa  481  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  54.8 
 
 		 428 aa  480  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  54.8 
 
 		 428 aa  480  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02111  seryl-tRNA synthetase  56.05 
 
 		 430 aa  479  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000240259  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  54.8 
 
 		 428 aa  480  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>