53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2732 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2732  dual specificity protein phosphatase  100 
 
 
369 aa  736    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2186  dual specificity protein phosphatase  56.77 
 
 
500 aa  297  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0605  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  42.21 
 
 
419 aa  257  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1987  dual specificity protein phosphatase  41.16 
 
 
346 aa  241  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0099  dual specificity protein phosphatase  33.06 
 
 
370 aa  204  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01681  hypothetical protein  27.73 
 
 
545 aa  68.6  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0558  dual specificity protein phosphatase  30.22 
 
 
162 aa  65.1  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0112118 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2275  dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 
189 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2186  dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 
189 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0255  hypothetical protein  31.4 
 
 
581 aa  59.3  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  37.37 
 
 
189 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3916  Dual specificity protein phosphatase  32.89 
 
 
197 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.426927 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1671  dual specificity protein phosphatase  32.46 
 
 
189 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00163756  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3611  dual specificity protein phosphatase  32.14 
 
 
152 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478238 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  32.08 
 
 
560 aa  56.2  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43165  predicted protein  30.1 
 
 
269 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1365  dual specificity protein phosphatase  35.25 
 
 
147 aa  54.3  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13871  hypothetical protein  31.45 
 
 
148 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.947237  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0369  ABC transporter related  38.64 
 
 
478 aa  54.7  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  25.85 
 
 
565 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  25.85 
 
 
565 aa  54.3  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3710  hypothetical protein  28.8 
 
 
547 aa  53.9  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  24.07 
 
 
563 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  25.85 
 
 
565 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2935  hypothetical protein  25 
 
 
563 aa  53.1  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6332  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  29.91 
 
 
568 aa  53.1  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1445  hypothetical protein  25 
 
 
563 aa  53.1  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  32.69 
 
 
550 aa  51.6  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0265  ADP-ribosylation/crystallin J1  41.43 
 
 
539 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1595  ABC transporter related  30.08 
 
 
507 aa  51.2  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4088  hypothetical protein  33.33 
 
 
540 aa  50.8  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0242  hypothetical protein  26.28 
 
 
533 aa  50.4  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513795  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001937  methylglyoxal synthase  31.11 
 
 
552 aa  50.1  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1089  protein of unknown function UPF0153  34.62 
 
 
173 aa  49.7  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0684639  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1448  dual specificity protein phosphatase  31.67 
 
 
171 aa  49.3  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3344  dual specificity protein phosphatase  29.66 
 
 
151 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1760  dual specificity protein phosphatase  25.47 
 
 
169 aa  48.9  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1966  dual specificity protein phosphatase  27.38 
 
 
197 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1926  phosphatase family protein, putative  28.81 
 
 
167 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1435  hypothetical protein  42.5 
 
 
175 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0261108  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1730  Dual specificity protein phosphatase  31.09 
 
 
246 aa  47.4  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3638  phosphatase  27.1 
 
 
168 aa  47  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2580  dual specificity protein phosphatase  31.91 
 
 
183 aa  47.4  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254118  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1068  dual specificity protein phosphatase  27.87 
 
 
180 aa  46.6  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1399  protein of unknown function UPF0153  41.27 
 
 
169 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000886998 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  30.94 
 
 
165 aa  45.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  32.35 
 
 
179 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1139  dual specificity protein phosphatase  27.78 
 
 
140 aa  44.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2781  membrane-associated phospholipid phosphatase  27.72 
 
 
478 aa  44.3  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000634589  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2811  protein of unknown function UPF0153  52.5 
 
 
169 aa  43.9  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284403  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4265  hypothetical protein  39.73 
 
 
194 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2133  dual specificity protein phosphatase  28.89 
 
 
186 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.215956  normal  0.306582 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3959  dual specificity protein phosphatase  36.76 
 
 
197 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>