247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2628 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2628  DNA-3-methyladenine glycosylase I  100 
 
 		 167 aa  336  8e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1888  DNA-3-methyladenine glycosylase I  68.48 
 
 		 200 aa  238  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3518  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.68 
 
 		 202 aa  209  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104093  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3701  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.64 
 
 		 197 aa  205  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0857  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.12 
 
 		 198 aa  204  6e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.671236  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.02 
 
 		 194 aa  200  8e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3094  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.79 
 
 		 198 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1181  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.39 
 
 		 198 aa  197  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.6 
 
 		 190 aa  196  9e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.25 
 
 		 191 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.83 
 
 		 194 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.96 
 
 		 186 aa  194  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  52.15 
 
 		 189 aa  194  5.000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.51 
 
 		 191 aa  192  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.64 
 
 		 199 aa  192  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.82 
 
 		 208 aa  191  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0050  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.24 
 
 		 190 aa  191  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.184428  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.94 
 
 		 208 aa  191  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0057  methyladenine glycosylase  50.9 
 
 		 196 aa  190  7e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.49 
 
 		 208 aa  189  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0211  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.88 
 
 		 210 aa  189  1e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1887  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.76 
 
 		 196 aa  188  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4020  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.27 
 
 		 208 aa  189  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0570  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.43 
 
 		 183 aa  188  2e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.890211 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3581  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.36 
 
 		 191 aa  188  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3988  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.09 
 
 		 221 aa  189  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.138626  decreased coverage  0.000983487 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1101  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.29 
 
 		 198 aa  187  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0590  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.19 
 
 		 193 aa  187  8e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.444252  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.81 
 
 		 198 aa  185  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.76 
 
 		 196 aa  185  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4680  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.28 
 
 		 185 aa  184  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.651754  normal  0.992066 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0555  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.48 
 
 		 214 aa  184  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870987  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0358  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.76 
 
 		 191 aa  184  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1176  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.9 
 
 		 207 aa  184  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.734996  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2725  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.44 
 
 		 187 aa  184  7e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.87 
 
 		 186 aa  183  8e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4822  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.29 
 
 		 213 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3064  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  55.09 
 
 		 189 aa  181  6e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1237  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.37 
 
 		 217 aa  180  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0491  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.12 
 
 		 202 aa  179  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.902381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0794  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.96 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0672  hypothetical protein  49.69 
 
 		 190 aa  179  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0656  hypothetical protein  49.69 
 
 		 190 aa  179  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3347  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.22 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1255  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.81 
 
 		 218 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2351  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.59 
 
 		 194 aa  178  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4683  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.77 
 
 		 187 aa  178  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.22 
 
 		 200 aa  176  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2862  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.22 
 
 		 200 aa  176  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.22 
 
 		 200 aa  176  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1991  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.32 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0957402  normal  0.0568343 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.61 
 
 		 200 aa  174  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.951839 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4364  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.6 
 
 		 195 aa  175  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0493  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.37 
 
 		 204 aa  174  4e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000244091  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0158  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.01 
 
 		 201 aa  174  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.598967  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0171  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.01 
 
 		 201 aa  174  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2464  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.69 
 
 		 192 aa  174  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1686  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.37 
 
 		 212 aa  174  5e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00244866  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4105  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.29 
 
 		 192 aa  174  6e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4305  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.7 
 
 		 209 aa  173  8e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4674  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.1 
 
 		 209 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.818815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0018  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 		 191 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000168083 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.38 
 
 		 200 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1116  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.8 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6706  methyladenine glycosylase  56.02 
 
 		 222 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535788  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0088  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.61 
 
 		 202 aa  171  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3867  DNA-3-methyladenine glycosidase I  53.61 
 
 		 202 aa  171  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3948  DNA-3-methyladenine glycosidase I  53.61 
 
 		 202 aa  171  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.857416  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0495  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.5 
 
 		 195 aa  170  6.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.77 
 
 		 200 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.39 
 
 		 190 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602981 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.77 
 
 		 198 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.39 
 
 		 191 aa  170  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0810  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.4 
 
 		 192 aa  170  7.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0581984  hitchhiker  0.00269095 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4452  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 		 187 aa  170  9e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.748727  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.5 
 
 		 223 aa  169  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.801121 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0016  DNA-3-methyladenine glycosidase I  49.39 
 
 		 191 aa  169  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2871  DNA-3-methyladenine glycosidase I  53.01 
 
 		 202 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.96 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00154604  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3446  DNA-3-methyladenine glycosidase I  53.01 
 
 		 202 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.183324  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1673  DNA-3-methyladenine glycosidase I  53.01 
 
 		 202 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3104  DNA-3-methyladenine glycosidase I  53.01 
 
 		 202 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248756  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2291  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.04 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3477  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.8 
 
 		 188 aa  168  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.112409 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4549  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.8 
 
 		 188 aa  168  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0040  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.57 
 
 		 186 aa  168  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.15 
 
 		 200 aa  168  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0016  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.5 
 
 		 196 aa  167  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0666  DNA-3-methyladenine glycosylase I protein  53.5 
 
 		 190 aa  167  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3559  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.41 
 
 		 187 aa  167  8e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.15 
 
 		 204 aa  167  9e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0064  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.32 
 
 		 187 aa  166  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6187  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.22 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.85 
 
 		 191 aa  165  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2985  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.19 
 
 		 198 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233863 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4170  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.47 
 
 		 187 aa  164  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0744  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.1 
 
 		 195 aa  164  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2400  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.1 
 
 		 215 aa  164  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.385566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3837  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  46.88 
 
 		 193 aa  164  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.25 
 
 		 186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>