186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2575 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  100 
 
 		 232 aa  479  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  45.73 
 
 		 244 aa  222  4e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  42.66 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  48.3 
 
 		 227 aa  141  7e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  43.35 
 
 		 221 aa  136  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  44.59 
 
 		 153 aa  135  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  41.62 
 
 		 221 aa  135  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  43.84 
 
 		 148 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  39.2 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  41.03 
 
 		 206 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  40.24 
 
 		 171 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  44.85 
 
 		 182 aa  127  2.0000000000000002e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  45.33 
 
 		 175 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  45.11 
 
 		 153 aa  119  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  36.76 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  44.85 
 
 		 171 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  41.67 
 
 		 157 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  40.99 
 
 		 162 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  37.35 
 
 		 175 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  36.75 
 
 		 175 aa  116  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  42.11 
 
 		 196 aa  115  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  37.89 
 
 		 156 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  35.54 
 
 		 175 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  41.01 
 
 		 169 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  34.81 
 
 		 174 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  35 
 
 		 183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  32.76 
 
 		 187 aa  112  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  33.93 
 
 		 153 aa  112  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  33.71 
 
 		 180 aa  111  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  38.52 
 
 		 150 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  37.58 
 
 		 179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  39.16 
 
 		 161 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  42.86 
 
 		 193 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  40 
 
 		 192 aa  108  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  32.58 
 
 		 169 aa  106  3e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  36.55 
 
 		 158 aa  105  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  37.27 
 
 		 153 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  37.13 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  36.69 
 
 		 166 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  41.91 
 
 		 153 aa  102  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  36.88 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  36.13 
 
 		 228 aa  99.4  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2219  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 205 aa  98.6  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  37.68 
 
 		 185 aa  98.2  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  36.65 
 
 		 164 aa  98.2  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  35.38 
 
 		 185 aa  97.4  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  33.91 
 
 		 199 aa  97.1  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  43.61 
 
 		 208 aa  96.7  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  36.78 
 
 		 194 aa  96.7  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2368  nuclease (SNase domain protein)  33.87 
 
 		 122 aa  95.9  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  39.16 
 
 		 169 aa  95.5  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  36.17 
 
 		 187 aa  95.1  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  38.26 
 
 		 179 aa  95.1  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  34.87 
 
 		 185 aa  94  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  37.12 
 
 		 138 aa  93.2  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  35.29 
 
 		 175 aa  92.4  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  36.03 
 
 		 191 aa  92  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  38.69 
 
 		 162 aa  92  7e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  39.52 
 
 		 171 aa  91.3  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  36.03 
 
 		 205 aa  90.5  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  33.53 
 
 		 171 aa  89.7  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  34.64 
 
 		 167 aa  89.4  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  29.96 
 
 		 271 aa  86.7  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1584  nuclease (SNase domain protein)  38.81 
 
 		 134 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.231891  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  34.03 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  32.41 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  32.55 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  38 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  32.55 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  33.55 
 
 		 166 aa  78.2  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  33.78 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  28.21 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  30.12 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  31.36 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  31.55 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  30.92 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  32.64 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  35.88 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  30.92 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0502  hypothetical protein  51.72 
 
 		 77 aa  71.2  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  32.47 
 
 		 171 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  32.47 
 
 		 171 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  33.09 
 
 		 155 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2235  nuclease (SNase domain protein)  32.24 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.197015 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  35.66 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  31.18 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  26.82 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  33.08 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  31.3 
 
 		 388 aa  68.6  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  30.65 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  30.88 
 
 		 157 aa  67.8  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  35.77 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  36.15 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2029  nuclease (SNase-like)  37.12 
 
 		 161 aa  64.3  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  29.53 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  34.11 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  35.33 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  32.03 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  28.57 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  33.8 
 
 		 189 aa  61.6  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>