More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2556 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2556  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 		 305 aa  625  1e-178  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.51858  normal  0.0789528 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0465  thioredoxin reductase  64 
 
 		 305 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1203  thioredoxin reductase  56.44 
 
 		 305 aa  333  2e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0940141  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.52 
 
 		 427 aa  236  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2750  thioredoxin-disulfide reductase  41.33 
 
 		 312 aa  231  9e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2436  thioredoxin-disulfide reductase  41.33 
 
 		 312 aa  231  9e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  39.53 
 
 		 304 aa  220  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  38.28 
 
 		 317 aa  219  5e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  38.28 
 
 		 317 aa  217  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  37.54 
 
 		 323 aa  208  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  38.08 
 
 		 304 aa  206  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  39.81 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.56 
 
 		 306 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  39.67 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  39.2 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  37.95 
 
 		 309 aa  199  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.84 
 
 		 407 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.02 
 
 		 555 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000005332  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  39.09 
 
 		 332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  36.54 
 
 		 308 aa  195  8.000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0477  alkyl hydroperoxide reductase F subunit  37.1 
 
 		 555 aa  193  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000501172  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  33.23 
 
 		 340 aa  191  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  38.78 
 
 		 323 aa  189  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  36.93 
 
 		 317 aa  188  8e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  37.9 
 
 		 361 aa  187  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  40.26 
 
 		 326 aa  186  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0855  thioredoxin reductase  36.63 
 
 		 316 aa  185  7e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0186179  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  38.76 
 
 		 312 aa  185  8e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  41.5 
 
 		 325 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  39.87 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  36.54 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  39.47 
 
 		 345 aa  182  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  39.09 
 
 		 319 aa  182  6e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  37.54 
 
 		 311 aa  182  8.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  37.54 
 
 		 311 aa  182  8.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  37.79 
 
 		 336 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0764  thioredoxin reductase  36.12 
 
 		 308 aa  180  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.080052  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  36.16 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  39.81 
 
 		 326 aa  179  4e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  39 
 
 		 320 aa  179  7e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  37.62 
 
 		 315 aa  178  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  37.29 
 
 		 318 aa  179  8e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  37.01 
 
 		 322 aa  179  8e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  37.82 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0785  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.08 
 
 		 556 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182954  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  37.54 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  37.62 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0525  thioredoxin-disulfide reductase  35.64 
 
 		 326 aa  177  3e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  38.19 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  34.09 
 
 		 409 aa  176  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  35.97 
 
 		 308 aa  175  9e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  39.55 
 
 		 324 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  35.67 
 
 		 316 aa  174  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  39.23 
 
 		 324 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  39.55 
 
 		 324 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  35.64 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  35.64 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  35.64 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  35.64 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  35.64 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  37.34 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  35.97 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  35.64 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  35.64 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  35.31 
 
 		 318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  33.11 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  36.81 
 
 		 331 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0907  Thioredoxin-disulfide reductase  35.08 
 
 		 547 aa  172  5e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000675051  normal  0.496773 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  38.28 
 
 		 325 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  35.22 
 
 		 310 aa  172  7.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  35.67 
 
 		 361 aa  172  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  35.86 
 
 		 309 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  35.31 
 
 		 302 aa  172  9e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  37.22 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  34.98 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0765  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.93 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.40354  normal  0.494294 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  34 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  36.69 
 
 		 359 aa  170  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  37.66 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  34.11 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  34.98 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  38.36 
 
 		 353 aa  170  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  33.89 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0101  thioredoxin reductase  37.75 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.386376  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  38.14 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18300  thioredoxin reductase  36.6 
 
 		 303 aa  169  4e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0720  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.44 
 
 		 394 aa  169  4e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  36.07 
 
 		 333 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  36.07 
 
 		 333 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  36.07 
 
 		 333 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  32.78 
 
 		 311 aa  169  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  36.81 
 
 		 456 aa  169  7e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1337  thioredoxin reductase  34.65 
 
 		 311 aa  169  7e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  37.99 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  37.13 
 
 		 335 aa  168  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  36.69 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  33.33 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  38.46 
 
 		 324 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1451  Alkyl hydroperoxide reductase, large subunit  34.42 
 
 		 569 aa  167  2.9999999999999998e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  37.21 
 
 		 334 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>