219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2521 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2521  cation transporter  100 
 
 
445 aa  880    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0493111  normal  0.0380202 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1540  H(+)-transporting two-sector ATPase  63.22 
 
 
454 aa  525  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0567  TrkH family potassium uptake protein  58.82 
 
 
443 aa  491  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1352  H(+)-transporting two-sector ATPase  52.46 
 
 
448 aa  431  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1794  H(+)-transporting two-sector ATPase  48.78 
 
 
453 aa  379  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0629  H(+)-transporting two-sector ATPase  47.25 
 
 
457 aa  338  9e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.64184  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0086  TrkH family potassium uptake protein  42.54 
 
 
457 aa  298  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329525  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1067  potassium uptake protein, TrkH family  41.23 
 
 
445 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0338  H(+)-transporting two-sector ATPase  41.03 
 
 
456 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.029372  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11710  potassium uptake protein, TrkH family  39.38 
 
 
446 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000213719  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0248  potassium uptake protein, TrkH family  38.74 
 
 
451 aa  281  1e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000139888  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0431  potassium uptake protein, TrkH family  39.42 
 
 
446 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000154787  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3602  cation transporter  41.91 
 
 
457 aa  271  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1755  K+ transporter Trk  41.8 
 
 
443 aa  270  4e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000259228  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0013  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.36 
 
 
442 aa  270  5e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1583  K+ transporter Trk  39.69 
 
 
458 aa  266  5.999999999999999e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3556  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.84 
 
 
453 aa  260  4e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1584  potassium uptake protein, TrkH family  38.65 
 
 
446 aa  260  4e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2080  potassium uptake protein, TrkH family  38.51 
 
 
447 aa  256  6e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000161963  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11700  potassium uptake protein, TrkH family  36.08 
 
 
441 aa  256  7e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00105837  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1548  potassium uptake protein, TrkH family  36.69 
 
 
447 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0388885  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1115  TrkH family potassium uptake protein  37.99 
 
 
447 aa  254  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1442  potassium uptake protein, TrkH family  36.47 
 
 
447 aa  254  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3901  potassium uptake protein, TrkH family  36.69 
 
 
447 aa  253  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1509  TrkH family potassium uptake protein  36.47 
 
 
447 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.556551  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1274  potassium/sodium uptake protein  36.24 
 
 
447 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1275  potassium/sodium uptake protein  36.24 
 
 
447 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185636  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1301  TrkH family potassium uptake protein  36.02 
 
 
447 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0881391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1409  TrkH family potassium uptake protein  36.02 
 
 
447 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.49277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1480  potassium uptake protein, TrkH family  36.02 
 
 
447 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2640  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.32 
 
 
584 aa  251  2e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1312  TrkH family potassium uptake protein  36.4 
 
 
447 aa  250  4e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.03643  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5257  potassium uptake protein, TrkH family  39.41 
 
 
443 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0320519  normal  0.460261 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0140  TrkH family potassium uptake protein  38.89 
 
 
447 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000106231  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1616  TrkH family potassium uptake protein  39.24 
 
 
444 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000038325  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0312  TrkH family potassium uptake protein  35.53 
 
 
574 aa  245  9.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00568204  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0268  potassium uptake protein, TrkH family  38.65 
 
 
456 aa  244  3e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3549  K+ transporter Trk  39.24 
 
 
449 aa  243  3.9999999999999997e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.840794  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1927  H(+)-transporting two-sector ATPase  38.02 
 
 
430 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0121  potassium uptake protein, TrkH family  38.75 
 
 
449 aa  243  5e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000217077  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1834  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.85 
 
 
633 aa  242  1e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3208  potassium uptake protein, TrkH family  39.2 
 
 
443 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1835  cation transporter  34.85 
 
 
586 aa  237  4e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.120084  normal  0.898069 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1607  K+ uptake transporter, KtrB subunit  35.06 
 
 
586 aa  236  6e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00112335  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2143  TrkH family potassium uptake protein  36.61 
 
 
446 aa  236  6e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00831138  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3883  TrkH family potassium uptake protein  35.44 
 
 
443 aa  236  7e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00920835 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0727  potassium uptake protein, TrkH family  41.53 
 
 
429 aa  236  9e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.157517  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1855  TrkH family potassium uptake protein  36.61 
 
 
446 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4092  potassium uptake protein, TrkH family  37.5 
 
 
454 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.407165  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4053  potassium uptake protein, TrkH family  37.5 
 
 
454 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1080  K+ transporter Trk  37.87 
 
 
447 aa  233  4.0000000000000004e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642094 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4805  K+ transporter Trk  37 
 
 
422 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36680  Trk-type K+ transport system, membrane component  40.54 
 
 
432 aa  231  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0226532  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0138  potassium uptake protein, TrkH family  45.89 
 
 
474 aa  230  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3464  potassium uptake protein, TrkH family  38.57 
 
 
444 aa  230  4e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2829  potassium uptake protein, TrkH family  37.58 
 
 
453 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0462619 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0545  TrkH family potassium uptake protein  39.4 
 
 
458 aa  227  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2065  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.83 
 
 
435 aa  227  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.403223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2102  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.83 
 
 
435 aa  227  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0464809  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0103  potassium uptake protein, TrkH family  36.42 
 
 
443 aa  227  4e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000278363  decreased coverage  8.777620000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0065  Trk-type K+ transport systems, membrane component  34.87 
 
 
467 aa  226  6e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4282  potassium uptake protein KtrB  35.67 
 
 
454 aa  225  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2635  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.63 
 
 
616 aa  222  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01408  potassium uptake protein  35.59 
 
 
455 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1641  cation transport protein, putative  35.47 
 
 
442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1658  TrkH family potassium uptake protein  36.09 
 
 
450 aa  221  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.552595  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0953  potassium uptake protein, TrkH family  38.5 
 
 
442 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004054  potassium uptake protein integral membrane component KtrB  36.6 
 
 
455 aa  219  6e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0408977  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1558  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.07 
 
 
447 aa  219  7.999999999999999e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.206556  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001289  potassium uptake protein integral membrane component KtrB  36.85 
 
 
454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0628  H(+)-transporting two-sector ATPase  38.46 
 
 
417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0415  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.35 
 
 
455 aa  216  5e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000197091  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4248  H(+)-transporting two-sector ATPase  38.2 
 
 
443 aa  215  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0806  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.41 
 
 
582 aa  214  1.9999999999999998e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.580888  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0049  TrkH family potassium uptake protein  36.14 
 
 
453 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330667 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0049  TrkH family potassium uptake protein  35.93 
 
 
453 aa  212  9e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0749  TrkH family potassium uptake protein  34.83 
 
 
441 aa  212  9e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.313509 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0215  cation transporter  37.14 
 
 
443 aa  212  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0057  TrkH family potassium uptake protein  36.14 
 
 
453 aa  211  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000278373 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14850  potassium uptake protein, TrkH family  38.5 
 
 
431 aa  211  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.599997  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4041  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.75 
 
 
709 aa  211  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.707053 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0054  TrkH family potassium uptake protein  35.47 
 
 
453 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000122698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1512  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.64 
 
 
454 aa  210  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1132  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.32 
 
 
584 aa  209  6e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.856603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2842  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.3 
 
 
446 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115847  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3573  H(+)-transporting two-sector ATPase  38.93 
 
 
442 aa  208  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.250788 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0397  cation transporter  37.72 
 
 
443 aa  207  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0376  cation transport protein  33.26 
 
 
439 aa  207  3e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0138  TRK system potassium uptake protein TrkB, putative  35.94 
 
 
447 aa  207  4e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7572  cation transporter  37.67 
 
 
444 aa  207  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.807634  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1037  TrkH family potassium uptake protein  35.03 
 
 
439 aa  206  5e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146152  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0053  potassium uptake protein, TrkH family  36.04 
 
 
454 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0695  Na+-transporting ATP synthase  38.26 
 
 
471 aa  206  7e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000433945  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4305  TrkH family potassium uptake protein  35.81 
 
 
454 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0672228  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02551  putative sodium transporter, Trk family  34.62 
 
 
467 aa  206  9e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1630  sodium transport family protein  35.7 
 
 
459 aa  205  1e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0051  TrkH family potassium uptake protein  34.52 
 
 
453 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243033 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0748  K+ transport protein  32.95 
 
 
440 aa  205  1e-51  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.894633  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0458  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.16 
 
 
444 aa  204  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0518  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.19 
 
 
457 aa  203  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.32097  normal  0.402385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>