More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2500 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  473  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011769  DvMF_1517  transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 		 372 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 239 aa  143  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 227 aa  135  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0468  Transcriptional regulator TetR  34.48 
 
 		 219 aa  123  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1086  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 219 aa  122  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.535417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  37.81 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 244 aa  111  9e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0392  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  32.21 
 
 		 235 aa  95.5  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0813  AcrR/TetR family transcription regulator  28.43 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1870  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 220 aa  85.1  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3899  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0449568  normal  0.0930409 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.05 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.05 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4065  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  27.14 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  31.2 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  26.71 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3284  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5974  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0426648  hitchhiker  0.00085933 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5058  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.29 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  42.05 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  31.82 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
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NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
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NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  31.82 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
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NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  50.91 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  50.91 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  42.05 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1118  regulatory protein TetR  22.45 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3282  regulatory protein, TetR  49.09 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003766  predicted transcriptional regulator for fatty acid degradation FadQ TetR family  39.24 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2064  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2413  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3508  transcriptional regulator PsrA  49.09 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2863  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  36.36 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1072  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0604431  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_1600  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0652187  normal  0.362821 
 
 
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NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_02639  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
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NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
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