177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2477 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2477  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 		 266 aa  535  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0102873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1751  fructose-bisphosphate aldolase  88.3 
 
 		 265 aa  480  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3489  fructose-bisphosphate aldolase  82.58 
 
 		 271 aa  456  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0114  fructose-bisphosphate aldolase  70.34 
 
 		 267 aa  401  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3490  fructose-bisphosphate aldolase  72.24 
 
 		 267 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0338  fructose-bisphosphate aldolase  68.3 
 
 		 265 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2807  fructose-bisphosphate aldolase  65.28 
 
 		 268 aa  380  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0103202  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1952  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  60.54 
 
 		 270 aa  332  3e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1586  fructose-bisphosphate aldolase  59 
 
 		 267 aa  328  5.0000000000000004e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0116446  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0201  fructose-bisphosphate aldolase  57.14 
 
 		 272 aa  321  8e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1710  fructose-bisphosphate aldolase  57.53 
 
 		 272 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.547035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0890  fructose-bisphosphate aldolase  56.76 
 
 		 270 aa  319  3e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0753  fructose-bisphosphate aldolase  57.42 
 
 		 268 aa  315  5e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00617024 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1506  fructose-bisphosphate aldolase  55.6 
 
 		 272 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276432  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0917  fructose-bisphosphate aldolase  56.37 
 
 		 263 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0914  fructose-bisphosphate aldolase  55.81 
 
 		 267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000266803  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1312  fructose-bisphosphate aldolase  55.89 
 
 		 268 aa  306  3e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2001  fructose-bisphosphate aldolase  55.04 
 
 		 285 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183812  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0920  fructose-bisphosphate aldolase  56.76 
 
 		 265 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0316  fructose-bisphosphate aldolase  53.05 
 
 		 271 aa  301  7.000000000000001e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0532  fructose-bisphosphate aldolase  57.2 
 
 		 265 aa  297  1e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1654  fructose-bisphosphate aldolase  56.03 
 
 		 264 aa  295  7e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000168998 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0617  fructose-bisphosphate aldolase  53.99 
 
 		 267 aa  293  1e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3187  fructose-bisphosphate aldolase  55.82 
 
 		 267 aa  286  2e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.171061  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1303  fructose-bisphosphate aldolase  55.38 
 
 		 263 aa  285  4e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.852372  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0600  fructose-bisphosphate aldolase  54.23 
 
 		 265 aa  278  7e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0194744  normal  0.0293794 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2611  fructose-bisphosphate aldolase  54.58 
 
 		 265 aa  276  3e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.870869  normal  0.699 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1557  fructose-bisphosphate aldolase  54.02 
 
 		 262 aa  275  4e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2610  fructose-bisphosphate aldolase  53.2 
 
 		 260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1036  fructose-bisphosphate aldolase  55.42 
 
 		 266 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0462563  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1558  fructose-bisphosphate aldolase  51.16 
 
 		 260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1302  fructose-bisphosphate aldolase  50.6 
 
 		 261 aa  262  4e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295464  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1035  fructose-bisphosphate aldolase  49.8 
 
 		 257 aa  249  3e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120812  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0553  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  45.91 
 
 		 260 aa  242  5e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.633374 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3036  fructose-bisphosphate aldolase  45.15 
 
 		 268 aa  223  4e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.152041 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2373  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  42.05 
 
 		 267 aa  222  4e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0853  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  45.21 
 
 		 265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1178  fructose-bisphosphate aldolase  45.49 
 
 		 264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.298775  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2815  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  46.53 
 
 		 267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1274  fructose-bisphosphate aldolase  44.7 
 
 		 263 aa  219  5e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3110  Fructose-bisphosphate aldolase  43.78 
 
 		 253 aa  208  8e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4205  2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase  44.06 
 
 		 278 aa  206  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3085  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  44.06 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.997362  unclonable  0.00000947187 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2454  Fructose-bisphosphate aldolase  45.2 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6861  fructose-bisphosphate aldolase  41.13 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2070  2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase  41.49 
 
 		 272 aa  189  5e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3502  fructose-bisphosphate aldolase  37.94 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0474  fructose-bisphosphate aldolase  34.59 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1287  fructose-bisphosphate aldolase  33.21 
 
 		 270 aa  168  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.673267 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1648  fructose-bisphosphate aldolase  37.64 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00227658  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2741  Fructose-bisphosphate aldolase  32.18 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.122813 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0962  Fructose-bisphosphate aldolase  33.7 
 
 		 272 aa  155  9e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188927  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0837  fructose-bisphosphate aldolase  35.98 
 
 		 258 aa  150  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1259  fructose-bisphosphate aldolase  33.85 
 
 		 280 aa  148  8e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000570698  decreased coverage  0.000000000291501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3141  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  35.32 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5219  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  32.96 
 
 		 266 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.639725 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5482  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  32.59 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.231333 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2456  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  33.58 
 
 		 279 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000207717  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0237  fructose-bisphosphate aldolase  30.85 
 
 		 271 aa  133  3e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.239509 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2720  aldolase  31.56 
 
 		 260 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2776  aldolase  31.58 
 
 		 260 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.21432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2259  aldolase  31.94 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0573247 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2771  aldolase  31.2 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2700  aldolase  31.58 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2982  aldolase  31.2 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2983  aldolase  31.94 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3021  aldolase  31.2 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2979  aldolase  31.2 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139976 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3019  aldolase  31.56 
 
 		 260 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0228115  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1897  aldolase  30.74 
 
 		 294 aa  124  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.160076  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1078  fructose-bisphosphate aldolase  28.46 
 
 		 331 aa  124  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2002  aldolase  31.78 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0256357  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2464  aldolase  30.74 
 
 		 293 aa  122  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.548218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1971  aldolase  32.3 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132065  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1197  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  29.39 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.352827 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2459  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  28.74 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1641  aldolase  31.4 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1606  aldolase  31.44 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2413  aldolase  30.38 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2008  aldolase  30.89 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3654  aldolase  30 
 
 		 291 aa  119  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0411  aldolase  32.43 
 
 		 293 aa  119  6e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3525  aldolase  30 
 
 		 291 aa  119  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0862  aldolase  30 
 
 		 291 aa  119  7e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2312  Fructose-bisphosphate aldolase  27.71 
 
 		 264 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0194  aldolase  30.74 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1655  aldolase  28.96 
 
 		 291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2745  aldolase  30.74 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3532  aldolase  28.9 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0399  aldolase  31.66 
 
 		 293 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1166  Fructose-bisphosphate aldolase  28 
 
 		 264 aa  115  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2129  Fructose-bisphosphate aldolase  28.96 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.635781  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01474  hypothetical protein  28.96 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2141  aldolase  28.96 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01485  hypothetical protein  28.96 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1599  aldolase  28.96 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1717  aldolase  28.96 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2130  aldolase  28.57 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2335  aldolase  31.27 
 
 		 293 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0055  aldolase  28.63 
 
 		 292 aa  112  5e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.471008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>