More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2447 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  100 
 
 		 389 aa  781    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1715  aminotransferase class V  76.35 
 
 		 389 aa  610  1e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  69.41 
 
 		 391 aa  551  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0804  aminotransferase class V  68.12 
 
 		 394 aa  523  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3126  aminotransferase class V  63.35 
 
 		 390 aa  444  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  59.32 
 
 		 395 aa  442  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  43.56 
 
 		 380 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  40.71 
 
 		 379 aa  297  2e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  41.83 
 
 		 384 aa  294  2e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  42.11 
 
 		 384 aa  293  3e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  42.11 
 
 		 380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  41.18 
 
 		 379 aa  279  7e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  42.47 
 
 		 384 aa  277  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  41.11 
 
 		 379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  39.23 
 
 		 385 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  39.84 
 
 		 380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  40.66 
 
 		 400 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  41.33 
 
 		 379 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  37.12 
 
 		 382 aa  269  7e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  37.94 
 
 		 382 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  37.94 
 
 		 382 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  39.66 
 
 		 379 aa  265  1e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  39.94 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  42.27 
 
 		 383 aa  264  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  39.94 
 
 		 362 aa  262  6.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  36.41 
 
 		 363 aa  262  8e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  37.4 
 
 		 383 aa  261  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  39.11 
 
 		 362 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  37.67 
 
 		 384 aa  258  9e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  35.9 
 
 		 385 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  36.26 
 
 		 386 aa  251  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0114  L-aspartate aminotransferase / phosphoserine aminotransferase  39.04 
 
 		 395 aa  251  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  35.29 
 
 		 387 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  38.08 
 
 		 385 aa  250  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  40.06 
 
 		 382 aa  249  4e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1762  aminotransferase class V  41.6 
 
 		 412 aa  249  5e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.0159311 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  34.9 
 
 		 387 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  39.73 
 
 		 388 aa  245  8e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  34.35 
 
 		 387 aa  245  9e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  37.64 
 
 		 386 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  37.75 
 
 		 360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  38.15 
 
 		 385 aa  241  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  35.54 
 
 		 382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  33.79 
 
 		 384 aa  239  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  33.79 
 
 		 384 aa  239  8e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  34.76 
 
 		 384 aa  238  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  36.1 
 
 		 397 aa  236  4e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  34.77 
 
 		 360 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0969  aminotransferase class V  34.05 
 
 		 374 aa  232  7.000000000000001e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.716227  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  35.77 
 
 		 382 aa  232  1e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  33.88 
 
 		 381 aa  230  4e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  35.84 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  31.93 
 
 		 387 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  35.01 
 
 		 382 aa  223  3e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  35.17 
 
 		 383 aa  217  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  32.49 
 
 		 382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  33.06 
 
 		 387 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  32.49 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  31.93 
 
 		 382 aa  209  5e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.68 
 
 		 383 aa  207  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  31.09 
 
 		 382 aa  206  7e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  37.1 
 
 		 375 aa  205  8e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1929  aminotransferase class V  35.75 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  36.26 
 
 		 381 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.24 
 
 		 380 aa  196  6e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  31.22 
 
 		 381 aa  196  7e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  33.78 
 
 		 377 aa  195  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  31.27 
 
 		 385 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  31.27 
 
 		 385 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  31.75 
 
 		 391 aa  193  5e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  36.19 
 
 		 401 aa  193  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0073  aminotransferase, class V  35.16 
 
 		 370 aa  192  6e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0909  aminotransferase class V  37.06 
 
 		 377 aa  192  9e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.520093  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  32.7 
 
 		 387 aa  191  1e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  30.52 
 
 		 391 aa  190  4e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0056  aminotransferase, class V  35.22 
 
 		 376 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2387  aminotransferase class V  36.74 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.271517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  33.8 
 
 		 398 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  35.18 
 
 		 402 aa  187  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1287  aminotransferase, class V  31.66 
 
 		 387 aa  186  4e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17916  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  34.6 
 
 		 376 aa  186  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0174  aminotransferase class V  36.49 
 
 		 360 aa  186  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  34.22 
 
 		 415 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  32.09 
 
 		 402 aa  184  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  34.5 
 
 		 399 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  33.14 
 
 		 415 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  35.18 
 
 		 401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  33.14 
 
 		 398 aa  180  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  30.81 
 
 		 396 aa  180  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  31.11 
 
 		 396 aa  180  4.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  32.48 
 
 		 402 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  32.19 
 
 		 402 aa  179  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  33.42 
 
 		 406 aa  179  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  35.18 
 
 		 391 aa  178  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  35.18 
 
 		 391 aa  178  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  32.36 
 
 		 396 aa  177  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  31.03 
 
 		 417 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  31.79 
 
 		 417 aa  177  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  33.24 
 
 		 406 aa  176  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  31.62 
 
 		 402 aa  176  8e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>