56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2434 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2434  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  198  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.211063  normal  0.524123 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2512  protein of unknown function DUF503  82.29 
 
 
102 aa  166  8e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3163  hypothetical protein  72.92 
 
 
116 aa  152  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0058  protein of unknown function DUF503  72.92 
 
 
105 aa  147  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2415  protein of unknown function DUF503  55.79 
 
 
95 aa  110  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64376  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0494  protein of unknown function DUF503  50 
 
 
95 aa  99  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.750456  normal  0.915938 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1275  hypothetical protein  34.41 
 
 
93 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1229  hypothetical protein  36.9 
 
 
90 aa  62.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.172595  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4216  hypothetical protein  43.28 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.472071  normal  0.0308507 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1881  hypothetical protein  40.51 
 
 
96 aa  57  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000640284  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1704  Adenosylcobinamide-phosphate guanylyltransferase  40.96 
 
 
280 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0884  hypothetical protein  35.42 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.577222  hitchhiker  0.00486437 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4087  hypothetical protein  34.38 
 
 
94 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.283841 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2320  protein of unknown function DUF503  32.53 
 
 
94 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0422608 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0887  hypothetical protein  35.48 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1260  protein of unknown function DUF503  32.56 
 
 
93 aa  51.2  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873275  normal  0.807487 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0859  hypothetical protein  36.49 
 
 
96 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0859  protein of unknown function DUF503  32.5 
 
 
92 aa  50.4  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1837  protein of unknown function DUF503  28.21 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1209  protein of unknown function DUF503  30.11 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00247478  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1705  hypothetical protein  38.1 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000331281  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0968  hypothetical protein  35.14 
 
 
98 aa  47  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1142  hypothetical protein  36.99 
 
 
136 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0433815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2411  hypothetical protein  38.46 
 
 
93 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137349  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1163  protein of unknown function DUF503  32.98 
 
 
151 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.517252  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2992  protein of unknown function DUF503  30.77 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2048  protein of unknown function DUF503  24.39 
 
 
92 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1231  protein of unknown function DUF503  32.98 
 
 
151 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0180533  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1103  hypothetical protein  32.98 
 
 
151 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1556  hypothetical protein  30.11 
 
 
95 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278609  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15590  hypothetical protein  28.79 
 
 
93 aa  43.9  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1142  hypothetical protein  28.21 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1180  hypothetical protein  28.21 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3603  protein of unknown function DUF503  34.67 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1545  hypothetical protein  32.05 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000254696  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3704  hypothetical protein  27.71 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.349544  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3583  hypothetical protein  28.57 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1452  hypothetical protein  36.78 
 
 
93 aa  42  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.454919  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_841  hypothetical protein  31.08 
 
 
98 aa  41.6  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0394209  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0361  protein of unknown function DUF503  24.1 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3034  hypothetical protein  25.81 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00080988  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1177  hypothetical protein  37.25 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3850  hypothetical protein  25.81 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3859  hypothetical protein  25.81 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000276858  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3663  hypothetical protein  25.81 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.394752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3553  hypothetical protein  25.81 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3571  hypothetical protein  25.81 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3949  hypothetical protein  25.81 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0584  hypothetical protein  30.77 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3634  hypothetical protein  28.92 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0542706  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2730  protein of unknown function DUF503  34.15 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3910  hypothetical protein  28.92 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.359011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1334  hypothetical protein  25.81 
 
 
93 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0659089  hitchhiker  0.00140554 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1743  protein of unknown function DUF503  28.24 
 
 
99 aa  40.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2065  hypothetical protein  27.78 
 
 
96 aa  40.4  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2358  hypothetical protein  27.78 
 
 
96 aa  40.4  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>