More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2421 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2421  flagellar hook-associated protein 3  100 
 
 
523 aa  1062    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.303682 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2525  flagellar hook-associated protein 3  56.41 
 
 
507 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3151  flagellar hook-associated protein FlgL, putative  56.21 
 
 
504 aa  569  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2000  flagellar hook-associated protein 3  42.61 
 
 
512 aa  410  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1620  flagellar hook-associated protein 3  36.19 
 
 
497 aa  273  6e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2402  flagellar hook-associated protein 3  40.54 
 
 
594 aa  230  5e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2235  flagellar hook-associated protein 3  40 
 
 
328 aa  116  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208019 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  34.86 
 
 
305 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  38.89 
 
 
297 aa  107  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1674  flagellar hook-associated protein FlgL  37.24 
 
 
315 aa  106  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0249  flagellar hook-associated protein FlgL  34.95 
 
 
296 aa  106  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  37.24 
 
 
297 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  34.81 
 
 
301 aa  101  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3721  flagellar hook-associated protein FlgL  36.49 
 
 
524 aa  96.7  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0096  flagellar hook-associated protein FlgL  34.51 
 
 
309 aa  94.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4194  flagellar hook-associated protein 3  35.57 
 
 
327 aa  92.8  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0770  flagellar hook-associated protein 3  35.14 
 
 
305 aa  92.4  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  34.23 
 
 
400 aa  90.1  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2242  flagellar hook-associated protein FlgL  40.57 
 
 
302 aa  89.4  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  35.81 
 
 
408 aa  89.4  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  29.96 
 
 
433 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  31.62 
 
 
402 aa  87.4  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2435  flagellar hook-associated protein 3  29.78 
 
 
438 aa  87.4  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0193  flagellin-like protein  29.73 
 
 
870 aa  87  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  33.11 
 
 
410 aa  87  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0307  flagellar hook-associated protein 3  33.8 
 
 
514 aa  86.7  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0021  flagellar hook-associated protein 3  31.03 
 
 
301 aa  86.7  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  29.35 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17130  flagellar hook-associated protein 3  32.19 
 
 
301 aa  85.9  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0666  flagellin domain protein  30.82 
 
 
1008 aa  85.5  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  30.77 
 
 
402 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  32.43 
 
 
562 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  32.43 
 
 
400 aa  83.6  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0392  flagellar hook-associated protein 3  30.22 
 
 
298 aa  83.2  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  30.41 
 
 
439 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0831  flagellar hook-associated protein 3  33.33 
 
 
298 aa  82.8  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.795766  normal  0.995497 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  31.03 
 
 
298 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1535  flagellar hook-associated protein 3  32.3 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  32.19 
 
 
404 aa  80.5  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0329  flagellar hook-associated protein 3  31.76 
 
 
295 aa  79.7  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  32.89 
 
 
404 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3274  flagellar hook-associated protein 3  32.19 
 
 
299 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1475  flagellar hook-associated protein FlgL  31.76 
 
 
521 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649013  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0990  flagellar hook-associated protein 3  30.43 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0842  flagellar hook-associated protein 3  30.43 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0865  flagellar hook-associated protein 3  30.43 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3001  flagellar hook-associated protein 3  34.03 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00024747 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  28.8 
 
 
401 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4098  flagellar hook-associated protein 3  32.41 
 
 
298 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  32.19 
 
 
317 aa  76.3  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1171  flagellar hook-associated protein FlgL  31.43 
 
 
401 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  30.82 
 
 
305 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2042  flagellar hook-associated protein 3  29.93 
 
 
305 aa  75.5  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.75647 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1650  flagellar hook-associated protein 3  29.86 
 
 
297 aa  75.5  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3754  flagellar hook-associated protein 3  31.03 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  29.45 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  31.76 
 
 
412 aa  73.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3033  flagellar hook-associated protein FlgL  32.19 
 
 
411 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0439  flagellin-like  28.38 
 
 
294 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1313  flagellar hook-associated protein FlgL  31.54 
 
 
400 aa  72  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2400  flagellar hook-associated protein FlgL  32.19 
 
 
411 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3014  flagellar hook-associated protein FlgL  32.19 
 
 
411 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481401  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  29.25 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  29.25 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2203  flagellin-like protein  30.46 
 
 
532 aa  71.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  30.14 
 
 
302 aa  72  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3458  flagellar hook-associated protein 3  29.05 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3783  flagellar hook-associated protein FlgL  30.82 
 
 
407 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0151  flagellar hook-associated protein FlgL  30.82 
 
 
407 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.838516 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  29.73 
 
 
521 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2931  flagellin-like  33.62 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.763262  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1787  flagellar hook-associated protein 3  28.57 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  29.53 
 
 
317 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  29.53 
 
 
317 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  29.53 
 
 
317 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3641  flagellin-like protein  31.29 
 
 
305 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3961  flagellar hook-associated protein 3  29.05 
 
 
305 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  29.53 
 
 
317 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3838  flagellar hook-associated protein 3  27.62 
 
 
306 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0146959 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  30.14 
 
 
317 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  28.38 
 
 
416 aa  69.3  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  30.14 
 
 
317 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3456  flagellar hook-associated protein 3  27.59 
 
 
295 aa  69.3  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  31.08 
 
 
292 aa  68.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  29.53 
 
 
317 aa  69.3  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  30.14 
 
 
317 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  30.14 
 
 
317 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  30.14 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  28.08 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  30.14 
 
 
317 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  30.14 
 
 
317 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1355  flagellar hook-associated protein FlgL  30.87 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  33.56 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  30.14 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2959  flagellar hook-associated protein FlgL  31.51 
 
 
406 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1352  flagellar hook-associated protein FlgL  31.09 
 
 
287 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1234  flagellar hook-associated protein FlgL  30 
 
 
411 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2587  flagellar hook-associated protein FlgL  28.04 
 
 
403 aa  66.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1968  flagellar hook-associated protein FlgL  29.45 
 
 
410 aa  66.2  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  30.82 
 
 
304 aa  65.9  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>