235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2400 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2603  hypothetical protein  91.33 
 
 		 369 aa  680    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2400  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  729    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0930  hypothetical protein  76.15 
 
 		 369 aa  560  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0225684  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1866  hypothetical protein  47.97 
 
 		 374 aa  238  9e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0464995  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1861  hypothetical protein  33.52 
 
 		 357 aa  199  9e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1255  hypothetical protein  32.51 
 
 		 360 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129603 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2840  hypothetical protein  33.63 
 
 		 360 aa  167  4e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1808  hypothetical protein  31.67 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.846437  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  30.67 
 
 		 348 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2376  hypothetical protein  28.43 
 
 		 390 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  29.84 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  29.43 
 
 		 360 aa  109  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  29.43 
 
 		 360 aa  109  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  28.85 
 
 		 355 aa  109  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  29.17 
 
 		 354 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  27.7 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  28.34 
 
 		 337 aa  102  7e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2085  hypothetical protein  25.56 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230868  normal  0.137994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3720  hypothetical protein  27.18 
 
 		 416 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117489  normal  0.0352204 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0041  hypothetical protein  29.03 
 
 		 352 aa  99.4  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  28.01 
 
 		 324 aa  99.4  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4651  hypothetical protein  23.66 
 
 		 419 aa  98.6  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0719  hypothetical protein  30 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1597  hypothetical protein  31.32 
 
 		 375 aa  97.8  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2550  Uncharacterized protein family UPF0324  29.41 
 
 		 348 aa  98.2  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164306  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0261  hypothetical protein  29.5 
 
 		 347 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1628  hypothetical protein  28.71 
 
 		 442 aa  95.5  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0495232  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  27.78 
 
 		 359 aa  91.3  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3183  Uncharacterized protein family UPF0324  29.63 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0563  hypothetical protein  26.67 
 
 		 421 aa  90.9  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0497935  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4671  hypothetical protein  25.24 
 
 		 449 aa  90.9  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2707  hypothetical protein  27.27 
 
 		 423 aa  89.7  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000039594  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  27.18 
 
 		 339 aa  89.4  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  26.23 
 
 		 335 aa  87  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  27.03 
 
 		 343 aa  86.7  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51806  inner membrane protein  25.79 
 
 		 441 aa  86.3  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.959187  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  23.72 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3197  hypothetical protein  25.45 
 
 		 569 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2308  hypothetical protein  31.78 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2819  hypothetical protein  31.78 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.720965  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  26.74 
 
 		 329 aa  83.2  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0419  hypothetical protein  27.62 
 
 		 346 aa  82.8  0.000000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000120524  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  26.16 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1635  hypothetical protein  25.58 
 
 		 436 aa  82  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  27.96 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1881  hypothetical protein  30.51 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742427 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  27.63 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  26.14 
 
 		 335 aa  79.3  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  27.98 
 
 		 355 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  25.08 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2292  hypothetical protein  27.3 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1096  hypothetical protein  26.35 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.710069  normal  0.0961033 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0171  Uncharacterized protein family UPF0324  24.59 
 
 		 442 aa  78.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  24.66 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4668  hypothetical protein  25.18 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000013133  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  27.3 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  26.64 
 
 		 361 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  26.64 
 
 		 361 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  26.8 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2292  hypothetical protein  28.15 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5030  hypothetical protein  27.59 
 
 		 391 aa  76.3  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.995412  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0046  hypothetical protein  26.57 
 
 		 473 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  24.92 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2815  Uncharacterized protein family UPF0324  24.5 
 
 		 434 aa  75.9  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3152  hypothetical protein  25 
 
 		 445 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.378189  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3265  hypothetical protein  24.41 
 
 		 445 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0423  hypothetical protein  27.46 
 
 		 331 aa  75.9  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.198162 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3343  hypothetical protein  25.75 
 
 		 445 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  26.71 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3021  hypothetical protein  31.45 
 
 		 473 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01436  hypothetical protein  25.09 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  26.23 
 
 		 357 aa  74.7  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2281  hypothetical protein  25.65 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2170  hypothetical protein  28.53 
 
 		 593 aa  72  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1878  hypothetical protein  23.17 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0334  hypothetical protein  25.69 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  23.61 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  25.8 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2420  hypothetical protein  24.08 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1714  hypothetical protein  26.8 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2972  hypothetical protein  26.64 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  22.14 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5713  hypothetical protein  28.79 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304105 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  25.16 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  27.06 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  25.16 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0756  hypothetical protein  27.01 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.825014  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  25.48 
 
 		 340 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  24.84 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  24.84 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1657  hypothetical protein  27.24 
 
 		 343 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1657  hypothetical protein  27.24 
 
 		 358 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3539  hypothetical protein  28.52 
 
 		 582 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.892455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1279  hypothetical protein  23.33 
 
 		 369 aa  69.3  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  25.16 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  26.32 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4081  hypothetical protein  24.73 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5032  hypothetical protein  26.25 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.35937 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0341  membrane protein  27.1 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  24.44 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>