More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2360 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  100 
 
 		 173 aa  340  5.999999999999999e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  79.22 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  61.54 
 
 		 161 aa  191  6e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  64.14 
 
 		 161 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  60.54 
 
 		 164 aa  187  8e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  58.11 
 
 		 157 aa  182  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  56 
 
 		 163 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  58.75 
 
 		 163 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  56.13 
 
 		 178 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  55.49 
 
 		 162 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  54.94 
 
 		 167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  54.25 
 
 		 164 aa  178  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  54.19 
 
 		 164 aa  175  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  53.59 
 
 		 164 aa  175  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  55.7 
 
 		 169 aa  174  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  52.87 
 
 		 164 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  53.74 
 
 		 164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  53.06 
 
 		 164 aa  171  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  50.68 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  47.24 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  46.63 
 
 		 185 aa  150  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  51.7 
 
 		 167 aa  150  8.999999999999999e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  47.53 
 
 		 185 aa  147  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  45.83 
 
 		 181 aa  147  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  45.96 
 
 		 160 aa  144  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  47.71 
 
 		 179 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  46.58 
 
 		 179 aa  141  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  44.51 
 
 		 194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  45.89 
 
 		 192 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  45.21 
 
 		 194 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  43.05 
 
 		 169 aa  135  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  45.16 
 
 		 185 aa  135  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  48.25 
 
 		 184 aa  134  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  48.95 
 
 		 179 aa  132  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  43.14 
 
 		 187 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0620  CheW protein  45.33 
 
 		 212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0159929 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  42.95 
 
 		 176 aa  125  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  41.22 
 
 		 178 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  44.74 
 
 		 194 aa  124  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  42.07 
 
 		 194 aa  121  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7835  chemotaxis protein cheW  39.63 
 
 		 162 aa  121  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  42.07 
 
 		 194 aa  121  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1400  CheW protein  39.44 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04752  chemotaxis protein  44.06 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  43.36 
 
 		 169 aa  119  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  39.44 
 
 		 162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  43.75 
 
 		 169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0613  CheW protein  43.88 
 
 		 175 aa  117  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  38.41 
 
 		 180 aa  117  9.999999999999999e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0143  CheW protein  39.07 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.699834  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  37.58 
 
 		 165 aa  114  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  42.76 
 
 		 167 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4311  chemotaxis protein  37.66 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6732  CheW protein  38.89 
 
 		 165 aa  111  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0258565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4670  CheW protein  35.71 
 
 		 159 aa  111  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913092  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  39.49 
 
 		 163 aa  108  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  37.67 
 
 		 175 aa  107  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  39.33 
 
 		 174 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  40.56 
 
 		 174 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  34.97 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  36.42 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  36.42 
 
 		 163 aa  105  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  37.41 
 
 		 159 aa  104  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  37.09 
 
 		 158 aa  104  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1402  CheW protein  33.33 
 
 		 179 aa  103  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.713319  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  36.62 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  39.02 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  35.76 
 
 		 163 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6736  CheW protein  35.97 
 
 		 156 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  32.68 
 
 		 169 aa  102  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1529  CheW protein  39.04 
 
 		 183 aa  101  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.205941 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  39.42 
 
 		 163 aa  101  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  35.33 
 
 		 159 aa  101  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  36.36 
 
 		 148 aa  101  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  39.02 
 
 		 158 aa  101  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5778  CheW protein  35.15 
 
 		 162 aa  100  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0235487  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3558  CheW protein  33.77 
 
 		 160 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.911694  normal  0.981486 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  36.91 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3259  CheW protein  34.42 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105416  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  39.02 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  35.66 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  32.39 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7838  CheW protein  35.97 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  0.68736 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4818  CheW protein  36.96 
 
 		 157 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  hitchhiker  0.00835574 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  36.59 
 
 		 163 aa  99.8  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  36.05 
 
 		 164 aa  99.8  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  36.67 
 
 		 163 aa  99.8  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  34.46 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  33.12 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  35.33 
 
 		 165 aa  99.8  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  35.33 
 
 		 165 aa  99.8  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  36.54 
 
 		 160 aa  99  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  36.71 
 
 		 163 aa  99  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0144  CheW protein  35.25 
 
 		 156 aa  99  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.675367  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  34.97 
 
 		 168 aa  99  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  36.71 
 
 		 163 aa  99  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  36.3 
 
 		 164 aa  99  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  37.76 
 
 		 165 aa  98.6  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  36 
 
 		 156 aa  98.6  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  35.76 
 
 		 166 aa  98.6  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>