63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2324 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2324  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  100 
 
 
528 aa  1062    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.578416  unclonable  0.0000207214 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2632  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  61.28 
 
 
596 aa  647    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3122  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  57.8 
 
 
531 aa  601  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0865073  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0323  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  48.77 
 
 
528 aa  456  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3107  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  40.87 
 
 
518 aa  375  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  26.72 
 
 
487 aa  181  4e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1518  glycosyl transferase family 39  25.88 
 
 
506 aa  166  1.0000000000000001e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  27.22 
 
 
498 aa  113  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0066  glycosyl transferase family 39  20.83 
 
 
512 aa  105  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.545213  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1307  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.11 
 
 
496 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.794979  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 
526 aa  103  8e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  25.81 
 
 
812 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4699  hypothetical protein  28.37 
 
 
527 aa  90.1  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3206  putative 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.45 
 
 
488 aa  89  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24072  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  34.12 
 
 
636 aa  86.7  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0325  putative glycosyltransferase protein  30.67 
 
 
473 aa  86.7  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.368248  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0294  hypothetical protein  28.35 
 
 
473 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.717495 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  22.06 
 
 
465 aa  86.7  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  29.2 
 
 
509 aa  84.7  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1292  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  42.36 
 
 
505 aa  84.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4304  hypothetical protein  26.29 
 
 
494 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1776  hypothetical protein  30.74 
 
 
480 aa  82.4  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108123  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3657  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 
496 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1393  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  44.14 
 
 
502 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3021  hypothetical protein  27.93 
 
 
582 aa  81.3  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289694  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  24.78 
 
 
553 aa  80.5  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.72 
 
 
864 aa  79  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3478  hypothetical protein  28.09 
 
 
506 aa  77.4  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2556  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  45.05 
 
 
505 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2597  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 
498 aa  75.1  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1358  hypothetical protein  27.69 
 
 
461 aa  72.8  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1362  hypothetical protein  27.69 
 
 
461 aa  73.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5296  hypothetical protein  27.52 
 
 
505 aa  72.4  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.067873 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1646  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 
496 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358752  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1801  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
497 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2194  hypothetical protein  28.35 
 
 
498 aa  67.4  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4007  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  26.36 
 
 
550 aa  63.9  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3962  putative glycosyl transferase  26.36 
 
 
550 aa  63.9  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1903  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 
476 aa  62  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3742  glycosyl transferase family protein  25.44 
 
 
513 aa  60.1  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00121597  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02435  hypothetical protein  25.75 
 
 
622 aa  59.3  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.940814  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2246  hypothetical protein  24.71 
 
 
520 aa  59.7  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000470204  normal  0.439852 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1743  glycosyltransferase  24 
 
 
513 aa  58.2  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0865  hypothetical protein  27.66 
 
 
611 aa  57  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 
553 aa  53.9  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1026  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  21.12 
 
 
557 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227195  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3006  hypothetical protein  26.78 
 
 
475 aa  51.2  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
554 aa  49.7  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  28.05 
 
 
323 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7373  hypothetical protein  25.35 
 
 
534 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.59 
 
 
553 aa  47.4  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  26.39 
 
 
575 aa  47.4  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3477  glycosyl transferase family protein  25.2 
 
 
564 aa  47  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3624  glycosyltransferase  32.53 
 
 
587 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174163 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1790  glycosyl transferase family 39  22.52 
 
 
565 aa  46.2  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0176335  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1008  hypothetical protein  26.82 
 
 
503 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.807875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1006  hypothetical protein  23.44 
 
 
489 aa  44.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.122487 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  30.68 
 
 
553 aa  44.7  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4228  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.18 
 
 
552 aa  44.7  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0867  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 
505 aa  43.9  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.955407  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0809  hypothetical protein  30.53 
 
 
580 aa  43.9  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4028  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
520 aa  43.5  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.278954  normal  0.62016 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2758  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 
534 aa  43.5  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>