47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2318 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2318  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  744    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575561 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1718  hypothetical protein  31.05 
 
 		 371 aa  171  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0679747  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1631  hypothetical protein  33.07 
 
 		 378 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.83823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0251  protein of unknown function DUF342  30 
 
 		 381 aa  144  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0226778 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1256  protein of unknown function DUF342  29.48 
 
 		 378 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.912515  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1305  protein of unknown function DUF342  29.37 
 
 		 530 aa  91.7  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.431943  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0879  hypothetical protein  24.26 
 
 		 467 aa  91.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00425584  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2143  protein of unknown function DUF342  23.98 
 
 		 461 aa  88.6  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0160634  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16620  predicted polymerase, contains PALM domain, HD hydrolase domain and Zn-ribbon domain  24.25 
 
 		 611 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0498  hypothetical protein  25 
 
 		 542 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.578621  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1231  hypothetical protein  27.05 
 
 		 462 aa  83.6  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2682  hypothetical protein  23.12 
 
 		 656 aa  77.8  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254687  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2021  protein of unknown function DUF342  22.58 
 
 		 463 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0194  hypothetical protein  30.2 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2684  hypothetical protein  23.77 
 
 		 532 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1423  protein of unknown function DUF342  24.45 
 
 		 622 aa  70.9  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000579847  normal  0.370296 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0671  protein of unknown function DUF342  23.69 
 
 		 545 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.38243e-32 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1534  hypothetical protein  23.89 
 
 		 456 aa  66.6  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.196772  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1511  hypothetical protein  24.44 
 
 		 527 aa  66.6  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1398  hypothetical protein  24.14 
 
 		 728 aa  65.9  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2455  hypothetical protein  28.49 
 
 		 538 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0192  hypothetical protein  27.85 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0872  hypothetical protein  28.89 
 
 		 541 aa  63.2  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0262539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0881  hypothetical protein  22.22 
 
 		 462 aa  62  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000540176  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0176  protein of unknown function DUF342  23.5 
 
 		 660 aa  55.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000513292  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1709  hypothetical protein  26.42 
 
 		 534 aa  53.9  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0512  hypothetical protein  23.72 
 
 		 546 aa  53.1  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0219  protein of unknown function DUF342  25.71 
 
 		 501 aa  53.1  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.102298  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1361  polymerase  23.95 
 
 		 653 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0273  hypothetical protein  23.23 
 
 		 634 aa  51.6  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3178  hypothetical protein  23.5 
 
 		 529 aa  50.4  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0539  hypothetical protein  25.53 
 
 		 555 aa  50.1  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3642  hypothetical protein  22.42 
 
 		 544 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000393022  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2246  protein of unknown function DUF342  25.37 
 
 		 520 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0826  hypothetical protein  23.63 
 
 		 563 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2410  hypothetical protein  24.87 
 
 		 530 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0090  protein of unknown function DUF342  24.51 
 
 		 565 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3979  hypothetical protein  24.67 
 
 		 556 aa  47.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0568  hypothetical protein  24.43 
 
 		 556 aa  47.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4141  hypothetical protein  22.13 
 
 		 556 aa  47  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.5265 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0674  hypothetical protein  25 
 
 		 563 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0199689 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0389  protein of unknown function DUF342  29.37 
 
 		 578 aa  45.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3273  hypothetical protein  25 
 
 		 563 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3451  hypothetical protein  25 
 
 		 563 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0113855 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0473  hypothetical protein  25.97 
 
 		 467 aa  44.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3165  hypothetical protein  24.24 
 
 		 562 aa  44.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0657  hypothetical protein  21.54 
 
 		 509 aa  43.9  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>