31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2272 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2272  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  634    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2667  hypothetical protein  72.19 
 
 		 323 aa  428  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2939  hypothetical protein  59.37 
 
 		 319 aa  388  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0036  nucleoside recognition domain protein  58.68 
 
 		 329 aa  335  7e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2421  hypothetical protein  45.89 
 
 		 316 aa  268  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3102  hypothetical protein  38.98 
 
 		 378 aa  176  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2309  hypothetical protein  40.65 
 
 		 362 aa  169  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.145713 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2642  hypothetical protein  36.62 
 
 		 457 aa  159  6e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0416  putative transporter  27.61 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1500  nucleoside recognition domain-containing protein  32.28 
 
 		 318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.879771  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1132  nucleoside recognition domain-containing protein  31.85 
 
 		 319 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.765619  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0477  hypothetical protein  27.33 
 
 		 397 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0005  nucleoside recognition domain-containing protein  22.38 
 
 		 331 aa  85.9  9e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.540211  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0818  nucleoside recognition domain-containing protein  24.74 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.307616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1099  nucleoside recognition domain-containing protein  23.55 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.379741  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0106  nucleoside recognition domain-containing protein  22.73 
 
 		 323 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.153  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0605  nucleoside recognition domain-containing protein  22.34 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0772602  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1779  nucleoside recognition domain-containing protein  22.34 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.344331  hitchhiker  0.000321752 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0884  nucleoside recognition domain-containing protein  22.22 
 
 		 317 aa  79  0.00000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0410  nucleoside recognition domain-containing protein  24.04 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3528  hypothetical protein  23 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.976665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2938  hypothetical protein  53.03 
 
 		 81 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2936  hypothetical protein  56.9 
 
 		 90 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1285  nucleoside recognition  19.03 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.242231  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2937  hypothetical protein  62.79 
 
 		 62 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1669  nucleoside recognition domain protein  27.04 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0151875  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0505  nucleoside recognition domain-containing protein  18.63 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0234  nucleoside recognition domain-containing protein  29.37 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.918857 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0047  hypothetical protein  25.25 
 
 		 302 aa  53.1  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.369746  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0368  nucleoside recognition domain-containing protein  26.35 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0980587  normal  0.268222 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0236  nucleoside recognition domain-containing protein  26.43 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>