More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2187 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  62.33 
 
 		 602 aa  797    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  77.57 
 
 		 755 aa  988    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  63.13 
 
 		 640 aa  792    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2187  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 595 aa  1224    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  53.37 
 
 		 597 aa  632  1e-180  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  51.96 
 
 		 600 aa  619  1e-176  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  38.09 
 
 		 639 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  39.08 
 
 		 646 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  38.22 
 
 		 634 aa  410  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  37.65 
 
 		 647 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  36.78 
 
 		 643 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  37.65 
 
 		 645 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  37.46 
 
 		 642 aa  395  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  37.7 
 
 		 619 aa  386  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  35.96 
 
 		 636 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  36.4 
 
 		 609 aa  376  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  37.57 
 
 		 611 aa  362  1e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  36.61 
 
 		 640 aa  361  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  36.03 
 
 		 602 aa  353  5e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  36.03 
 
 		 602 aa  353  5e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  35.24 
 
 		 628 aa  352  8.999999999999999e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  34.87 
 
 		 647 aa  350  4e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  36.18 
 
 		 678 aa  349  8e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  35.03 
 
 		 648 aa  349  1e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  35.03 
 
 		 648 aa  349  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  34.69 
 
 		 648 aa  347  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  36.09 
 
 		 681 aa  347  5e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  35.97 
 
 		 619 aa  346  8.999999999999999e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  36.72 
 
 		 586 aa  345  1e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0661  penicillin-binding protein 2  32.61 
 
 		 608 aa  345  2e-93  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.5709  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  34.29 
 
 		 637 aa  342  2e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  35.05 
 
 		 630 aa  341  2.9999999999999998e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  34.07 
 
 		 633 aa  340  4e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  34.58 
 
 		 630 aa  340  5e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  35.05 
 
 		 645 aa  339  9.999999999999999e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  34.47 
 
 		 610 aa  336  7e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  33.56 
 
 		 574 aa  335  1e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  32.52 
 
 		 648 aa  334  3e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0755  penicillin-binding protein 2  32.99 
 
 		 599 aa  332  2e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0670  penicillin-binding protein 2  33.67 
 
 		 607 aa  332  2e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.265055  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  34.18 
 
 		 643 aa  330  4e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  33.96 
 
 		 629 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0680  penicillin-binding protein 2  32.99 
 
 		 601 aa  329  7e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.104007  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  33.67 
 
 		 673 aa  329  9e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  33.96 
 
 		 629 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  33.22 
 
 		 629 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  32.78 
 
 		 638 aa  327  3e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  33.16 
 
 		 662 aa  327  3e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1347  penicillin-binding protein 2  33.16 
 
 		 601 aa  327  4.0000000000000003e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  33.86 
 
 		 646 aa  326  7e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  33.62 
 
 		 629 aa  326  9e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  33.63 
 
 		 646 aa  326  9e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0580  penicillin-binding protein 2  34.41 
 
 		 634 aa  325  1e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39479  hitchhiker  0.00000000000028844 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3648  peptidoglycan glycosyltransferase  34.98 
 
 		 649 aa  325  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783266 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  34.18 
 
 		 627 aa  325  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  33.56 
 
 		 662 aa  325  2e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  33.28 
 
 		 618 aa  324  3e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  33.28 
 
 		 618 aa  324  3e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  34.38 
 
 		 631 aa  323  4e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  32.52 
 
 		 636 aa  324  4e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0309  penicillin-binding protein 2  33.39 
 
 		 608 aa  323  4e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.244318  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  32.66 
 
 		 691 aa  323  5e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  32.61 
 
 		 624 aa  323  6e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  33.28 
 
 		 618 aa  323  6e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08390  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.88 
 
 		 640 aa  323  6e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.630549  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  33.28 
 
 		 610 aa  323  7e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  34.55 
 
 		 631 aa  323  8e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  33.45 
 
 		 618 aa  322  8e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  34.03 
 
 		 626 aa  322  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  32.95 
 
 		 618 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  34.31 
 
 		 631 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  33.28 
 
 		 631 aa  321  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  32.94 
 
 		 618 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  34.8 
 
 		 630 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  31.58 
 
 		 628 aa  321  1.9999999999999998e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  32.35 
 
 		 689 aa  321  3e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  33.67 
 
 		 618 aa  321  3e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1182  penicillin-binding protein 2  33.78 
 
 		 602 aa  321  3e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 		 664 aa  320  3.9999999999999996e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  33.71 
 
 		 767 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  34.13 
 
 		 681 aa  320  5e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  32.72 
 
 		 641 aa  320  6e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  32.83 
 
 		 703 aa  319  7e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  32.56 
 
 		 801 aa  318  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.74 
 
 		 618 aa  319  1e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  35.01 
 
 		 630 aa  319  1e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1995  penicillin-binding protein 2  34.01 
 
 		 607 aa  318  2e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  33.72 
 
 		 800 aa  318  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  33.06 
 
 		 634 aa  318  2e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  33.39 
 
 		 771 aa  317  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1715  penicillin-binding protein  33.55 
 
 		 652 aa  317  6e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0450  penicillin-binding protein 2  33.61 
 
 		 609 aa  316  6e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  32.88 
 
 		 630 aa  316  7e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0473  penicillin-binding protein 2  33.95 
 
 		 638 aa  316  8e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0538731  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  33.44 
 
 		 803 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  34.73 
 
 		 655 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  34.56 
 
 		 667 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  34.49 
 
 		 646 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0176  peptidoglycan glycosyltransferase  33.61 
 
 		 683 aa  315  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  34.13 
 
 		 629 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>