More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2140 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2889  aspartate aminotransferase  78.01 
 
 		 394 aa  641    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.425013 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2140  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 393 aa  795    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1103  aspartate aminotransferase  73.4 
 
 		 461 aa  595  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2089  aspartate aminotransferase  68.02 
 
 		 398 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3303  aspartate aminotransferase  65.64 
 
 		 397 aa  534  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.597513  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2027  aspartate aminotransferase  60.71 
 
 		 396 aa  495  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277317  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0565  aspartate aminotransferase  56.78 
 
 		 398 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0081  aspartate aminotransferase  52.19 
 
 		 395 aa  412  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0248669  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0562  aspartate aminotransferase  56.78 
 
 		 398 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1171  aspartate aminotransferase  50.77 
 
 		 396 aa  406  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0533  aspartate aminotransferase  56.4 
 
 		 400 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.865322  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2600  aspartate aminotransferase  47.55 
 
 		 397 aa  381  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00026488  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1046  aspartate aminotransferase  44.09 
 
 		 398 aa  362  6e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1888  aspartate aminotransferase  44.96 
 
 		 396 aa  360  2e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000042706  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3354  aspartate aminotransferase  45.08 
 
 		 396 aa  358  8e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2093  aspartate aminotransferase  45.34 
 
 		 393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1148  aspartate aminotransferase  44.24 
 
 		 395 aa  354  1e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000148908  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1965  aspartate aminotransferase  44.7 
 
 		 393 aa  352  7e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1061  aspartate aminotransferase  44.56 
 
 		 398 aa  350  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0613658  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3287  aspartate aminotransferase  44.36 
 
 		 397 aa  350  3e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0961  aspartate aminotransferase  43.83 
 
 		 397 aa  345  7e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.173671 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0580  aspartate aminotransferase  41.49 
 
 		 397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1313  aspartate aminotransferase  43.26 
 
 		 397 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211162 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0732  aspartate aminotransferase  43.15 
 
 		 397 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3530  aspartate aminotransferase  40.46 
 
 		 395 aa  312  5.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2311  aspartate aminotransferase  40.05 
 
 		 398 aa  299  6e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000726355  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02010  aspartate aminotransferase  39.04 
 
 		 393 aa  274  3e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.951604 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27170  aspartate aminotransferase  40.74 
 
 		 393 aa  270  4e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01850  aspartate aminotransferase  36.83 
 
 		 395 aa  264  2e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0108  aspartate aminotransferase  36.27 
 
 		 394 aa  256  5e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.301084 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0522  aspartate aminotransferase  35.99 
 
 		 396 aa  254  3e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.138181  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0186  aspartate aminotransferase  38.14 
 
 		 393 aa  248  9e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1558  aminotransferase class I and II  37.6 
 
 		 389 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3157  aminotransferase  36.69 
 
 		 405 aa  208  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5530  aminotransferase class I and II  34.62 
 
 		 397 aa  205  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1633  aminotransferase class I and II  37.05 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2315  aminotransferase  37.05 
 
 		 389 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2832  aminotransferase class I and II  35.93 
 
 		 404 aa  200  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642914 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3525  aminotransferase  29.31 
 
 		 403 aa  182  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  33.07 
 
 		 389 aa  172  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  33.78 
 
 		 392 aa  169  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  32.23 
 
 		 396 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  35.11 
 
 		 397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3530  aminotransferase class I and II  32.65 
 
 		 373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.903245  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  32.04 
 
 		 396 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  31.62 
 
 		 396 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  34.59 
 
 		 377 aa  160  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  34.59 
 
 		 377 aa  160  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  31.36 
 
 		 396 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  31.62 
 
 		 396 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  31.62 
 
 		 396 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  31.62 
 
 		 396 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  31.62 
 
 		 396 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  30.67 
 
 		 370 aa  159  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  31.71 
 
 		 396 aa  160  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  32.46 
 
 		 367 aa  160  5e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  31.36 
 
 		 396 aa  159  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0784  aminotransferase  30.63 
 
 		 403 aa  158  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0364994 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  32.18 
 
 		 385 aa  158  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  30.95 
 
 		 396 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  33.06 
 
 		 396 aa  156  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1427  hypothetical protein  29.08 
 
 		 402 aa  155  8e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  30.89 
 
 		 373 aa  155  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  27.44 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  29.81 
 
 		 395 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  30.03 
 
 		 395 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  27.86 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0710  aspartate aminotransferase  30.52 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  32.9 
 
 		 400 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  27.44 
 
 		 375 aa  153  5e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  29.27 
 
 		 395 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  29.27 
 
 		 395 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  29.27 
 
 		 395 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  29.27 
 
 		 395 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  31.22 
 
 		 404 aa  153  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  29.27 
 
 		 395 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0897  aspartate aminotransferase  30.47 
 
 		 389 aa  152  7e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0789129  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0429  aminotransferase class I and II  29.82 
 
 		 390 aa  152  1e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  29.14 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1393  aminotransferase class I and II  33.24 
 
 		 373 aa  152  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1121  aminotransferase class I and II  32.33 
 
 		 381 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  29.4 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  31.32 
 
 		 392 aa  151  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  29.48 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3133  aminotransferase  30.4 
 
 		 370 aa  150  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.367697  normal  0.475875 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  30.12 
 
 		 399 aa  150  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  32.18 
 
 		 396 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0973  aminotransferase class I and II  30.27 
 
 		 379 aa  150  4e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  27.06 
 
 		 375 aa  150  5e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  32.28 
 
 		 390 aa  150  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2116  aminotransferase class I and II  30.77 
 
 		 400 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  28.34 
 
 		 390 aa  149  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3263  aminotransferase class I and II  31.72 
 
 		 382 aa  149  7e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  29.57 
 
 		 387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1731  L-aspartate aminotransferase  30.77 
 
 		 400 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  30 
 
 		 393 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2206  aminotransferase class I and II  30.24 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  31.2 
 
 		 388 aa  147  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2542  aminotransferase, class I and II  35.11 
 
 		 399 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  33.61 
 
 		 392 aa  147  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>