51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2137 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2137  adenylylsulfate reductase, beta subunit  100 
 
 		 167 aa  346  7e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2892  adenylylsulfate reductase, beta subunit  91.62 
 
 		 167 aa  323  5e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.409396 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1109  adenylylsulfate reductase subunit beta  90.91 
 
 		 162 aa  294  4e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000257152  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2130  adenylylsulfate reductase, beta subunit  85.71 
 
 		 162 aa  289  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.925917  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1967  adenylylsulfate reductase, beta subunit  79.64 
 
 		 167 aa  286  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0419652 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3197  adenylylsulfate reductase, beta subunit  83.55 
 
 		 162 aa  273  6e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000312858  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0873  adenylylsulfate reductase, beta subunit  67.61 
 
 		 161 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.970747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0636  adenylylsulfate reductase, beta subunit  64.38 
 
 		 147 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1047  adenylylsulfate reductase, beta subunit  63.83 
 
 		 147 aa  189  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0187678  normal  0.010444 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1838  adenylylsulfate reductase, beta subunit  70 
 
 		 140 aa  187  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0138336  normal  0.023497 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3578  adenylylsulfate reductase, beta subunit  65.41 
 
 		 146 aa  187  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000448806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1586  adenylylsulfate reductase subunit beta  70 
 
 		 140 aa  187  7e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00926364  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0040  adenylylsulfate reductase, beta subunit  69.17 
 
 		 140 aa  185  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0997  adenylylsulfate reductase, beta subunit  62.69 
 
 		 144 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000160425  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1081  adenylylsulfate reductase, beta subunit  62.69 
 
 		 147 aa  180  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1886  adenylylsulfate reductase, beta subunit  62.5 
 
 		 145 aa  177  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000106288  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0272  adenylylsulfate reductase, beta subunit  49.15 
 
 		 161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000000553885  hitchhiker  0.000000190129 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0064  adenylylsulfate reductase, beta subunit  45.99 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0351  adenylylsulfate reductase, beta subunit  45.65 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.480328  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1234  adenylylsulfate reductase, beta subunit  42.11 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.480788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1429  adenylylsulfate reductase, beta subunit  44.78 
 
 		 160 aa  107  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0667078 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2283  adenylylsulfate reductase, beta subunit  44.2 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.95 
 
 		 107 aa  89  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1888  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000841156  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0925  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.64 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.29 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1709  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  31.43 
 
 		 118 aa  62  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1192  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.95 
 
 		 105 aa  50.8  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1831  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.9 
 
 		 103 aa  47.8  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34920  putative ferredoxin  40.98 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000025951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3162  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.79 
 
 		 81 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4072  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.54 
 
 		 80 aa  44.7  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.512619  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5012  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.98 
 
 		 81 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0206  ferredoxin, 4Fe-4S  40.98 
 
 		 81 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.623695 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4092  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.34 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.141555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.34 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1297  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.34 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.814234  normal  0.164928 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0496  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.31 
 
 		 672 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.747428 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5288  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.34 
 
 		 81 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.782627  normal  0.0624847 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1961  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.34 
 
 		 81 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323948  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6104  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.98 
 
 		 81 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416021  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3883  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.07 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1888  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.34 
 
 		 81 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1973  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.98 
 
 		 81 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.13 
 
 		 76 aa  41.6  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  35.59 
 
 		 610 aa  41.6  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2707  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.3 
 
 		 73 aa  41.2  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.670596  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0380  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.5 
 
 		 71 aa  41.2  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3675  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.24 
 
 		 77 aa  40.8  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.969084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3350  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.24 
 
 		 77 aa  40.8  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.33 
 
 		 1126 aa  40.8  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.633226 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>