More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2113 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2113  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
247 aa  509  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2918  undecaprenyl diphosphate synthase  75.77 
 
 
250 aa  360  8e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.15769 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1126  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  66.52 
 
 
243 aa  323  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2380  undecaprenyl diphosphate synthase  65.04 
 
 
233 aa  311  6.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0518  undecaprenyl diphosphate synthase  66.67 
 
 
280 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1945  undecaprenyl diphosphate synthase  64.71 
 
 
231 aa  300  2e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.77987 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.03 
 
 
282 aa  249  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.44 
 
 
249 aa  248  7e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.42 
 
 
246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  49.14 
 
 
241 aa  241  6e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.71 
 
 
246 aa  241  7e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  45.6 
 
 
291 aa  241  7.999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  48.93 
 
 
244 aa  241  7.999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  46.8 
 
 
282 aa  241  1e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
256 aa  239  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  46.61 
 
 
276 aa  237  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.95 
 
 
250 aa  237  2e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
236 aa  236  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_317  undecaprenyl diphosphate synthase  48.88 
 
 
236 aa  236  3e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.95 
 
 
259 aa  236  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  46.43 
 
 
232 aa  236  3e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  46.15 
 
 
276 aa  235  5.0000000000000005e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  51.05 
 
 
251 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  46.59 
 
 
285 aa  235  5.0000000000000005e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  49.58 
 
 
266 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_002936  DET0373  undecaprenyl diphosphate synthase  48.43 
 
 
236 aa  235  6e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0355  undecaprenyl diphosphate synthase  47.53 
 
 
236 aa  235  6e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.580646  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  48.92 
 
 
236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.73 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.73 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  46.06 
 
 
246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.15 
 
 
251 aa  230  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  47.01 
 
 
263 aa  229  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  50.44 
 
 
252 aa  229  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  45.97 
 
 
272 aa  229  3e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.76 
 
 
249 aa  229  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
260 aa  229  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0709  undecaprenyl diphosphate synthase  49.17 
 
 
259 aa  229  4e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0105503  unclonable  0.000000024348 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.09 
 
 
256 aa  229  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  51.09 
 
 
273 aa  228  5e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  44.78 
 
 
234 aa  228  5e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.35 
 
 
249 aa  228  9e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.76 
 
 
258 aa  227  1e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
240 aa  227  2e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.86 
 
 
237 aa  226  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1447  undecaprenyl diphosphate synthase  48.07 
 
 
257 aa  225  4e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2048  undecaprenyl diphosphate synthase  49.15 
 
 
260 aa  225  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  49.15 
 
 
260 aa  225  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0685  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.61 
 
 
259 aa  225  5.0000000000000005e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1782  undecaprenyl diphosphate synthase  48.29 
 
 
248 aa  224  7e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  49.58 
 
 
260 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2579  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
260 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93392  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3706  undecaprenyl diphosphate synthase  51.28 
 
 
255 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  46.91 
 
 
264 aa  223  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
260 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0979  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.8 
 
 
254 aa  223  2e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00602167  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.31 
 
 
246 aa  223  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.1 
 
 
254 aa  223  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.73 
 
 
260 aa  222  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.184494 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  46.72 
 
 
249 aa  222  4.9999999999999996e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  48.09 
 
 
247 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.55 
 
 
249 aa  221  6e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.64 
 
 
260 aa  221  8e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  45.68 
 
 
246 aa  221  8e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2433  undecaprenyl diphosphate synthase  49.37 
 
 
260 aa  221  9e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0292825  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  48.31 
 
 
260 aa  221  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.66 
 
 
254 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1551  undecaprenyl diphosphate synthase  49.37 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1324  undecaprenyl diphosphate synthase  49.37 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.134804  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.39 
 
 
249 aa  220  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  45.68 
 
 
252 aa  220  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3259  undecaprenyl diphosphate synthase  49.37 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540086  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2052  undecaprenyl diphosphate synthase  49.37 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2035  undecaprenyl diphosphate synthase  48.29 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  47.46 
 
 
253 aa  220  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6062  undecaprenyl diphosphate synthase  48.29 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.08 
 
 
249 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  48.29 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5325  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.86 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00863948  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.81 
 
 
258 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  48.29 
 
 
260 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3725  undecaprenyl diphosphate synthase  49.39 
 
 
251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3651  undecaprenyl diphosphate synthase  49.39 
 
 
251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.86266  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  45.54 
 
 
228 aa  219  3e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  44.26 
 
 
260 aa  219  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  46.05 
 
 
257 aa  219  3e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3585  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.39 
 
 
251 aa  218  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1282  undecaprenyl diphosphate synthase  49.14 
 
 
258 aa  218  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.222938 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.14 
 
 
233 aa  218  7e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  46.44 
 
 
245 aa  218  8.999999999999998e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  47.88 
 
 
259 aa  217  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0511  undecaprenyl diphosphate synthase  45.53 
 
 
257 aa  217  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0663424  normal  0.27617 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.53 
 
 
267 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1408  undecaprenyl pyrophosphate synthetase protein  48.09 
 
 
258 aa  217  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  43.33 
 
 
248 aa  217  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1346  undecaprenyl diphosphate synthase  48.71 
 
 
258 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0661425  normal  0.552617 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.37 
 
 
257 aa  216  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.05 
 
 
256 aa  216  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14881  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.05 
 
 
256 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.574217 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.3 
 
 
246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>