More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2084 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2084  guanylate kinase  100 
 
 		 207 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338387  decreased coverage  0.00871463 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1138  Guanylate kinase  75.85 
 
 		 209 aa  327  6e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2719  guanylate kinase  74.63 
 
 		 206 aa  305  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00356396  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0294  guanylate kinase  63.24 
 
 		 212 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2902  guanylate kinase  59.8 
 
 		 215 aa  240  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1406  Guanylate kinase  58 
 
 		 202 aa  230  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.77411  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2238  guanylate kinase  50.26 
 
 		 203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2327  guanylate kinase  48.37 
 
 		 203 aa  192  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000761567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1285  guanylate kinase  49.74 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194386  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1050  guanylate kinase  47.26 
 
 		 202 aa  186  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000462152 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3213  guanylate kinase  47.24 
 
 		 202 aa  186  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000935163  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2401  guanylate kinase  48.91 
 
 		 202 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0298091  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5842  guanylate kinase  54.44 
 
 		 259 aa  181  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4981  guanylate kinase  48.85 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2286  guanylate kinase  49.72 
 
 		 202 aa  177  8e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30068  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  50.81 
 
 		 202 aa  174  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3630  guanylate kinase  51.41 
 
 		 209 aa  174  8e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.601224  normal  0.100424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  48.88 
 
 		 199 aa  173  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3354  guanylate kinase  51.96 
 
 		 212 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  42.86 
 
 		 204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  50.56 
 
 		 204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  39.18 
 
 		 207 aa  171  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  44.92 
 
 		 194 aa  171  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0759  guanylate kinase  46.53 
 
 		 219 aa  171  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2003  guanylate kinase  47.15 
 
 		 216 aa  171  9e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0100  guanylate kinase  41.94 
 
 		 202 aa  170  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  44.83 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  49.15 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2523  guanylate kinase  48.13 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1078  guanylate kinase  49.14 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72675  guanylate kinase (GUK1)  46.86 
 
 		 193 aa  169  3e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.12779  normal  0.729563 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2000  guanylate kinase  48.04 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0607745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2277  guanylate kinase  48.04 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.140709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  40.8 
 
 		 200 aa  168  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  45.32 
 
 		 207 aa  169  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1535  guanylate kinase  44.39 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748909  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1212  guanylate kinase  46.89 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1953  guanylate kinase  47.78 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217119  normal  0.0786696 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1205  guanylate kinase  45.41 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  hitchhiker  0.00108752 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3720  guanylate kinase  50.28 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0647286  normal  0.109171 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  48.02 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0785  guanylate kinase  47.87 
 
 		 201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000101008  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0552  guanylate kinase  46.41 
 
 		 205 aa  165  4e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.713895  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04671  guanylate kinase  45.35 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0895533  normal  0.75989 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1062  guanylate kinase  43.88 
 
 		 220 aa  165  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1192  guanylate kinase  43.14 
 
 		 207 aa  165  5e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1311  guanylate kinase  43.14 
 
 		 205 aa  164  5.9999999999999996e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  48.02 
 
 		 207 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2537  guanylate kinase  45.71 
 
 		 183 aa  164  5.9999999999999996e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1220  guanylate kinase  50.28 
 
 		 218 aa  164  5.9999999999999996e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.289802 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  47.85 
 
 		 220 aa  164  9e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0988  guanylate kinase  46.15 
 
 		 234 aa  164  9e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0107524 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10188  hypothetical protein similar to guanylate kinase (Broad)  47.16 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.585201 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  43.84 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0793  guanylate kinase  47.46 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.637166 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0365  guanylate kinase  47.46 
 
 		 207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0195  guanylate kinase  46.29 
 
 		 188 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0190  guanylate kinase  45.71 
 
 		 184 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  48.02 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  48.59 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  48.02 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  48.02 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1266  guanylate kinase  46.96 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.979121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3162  guanylate kinase  46.77 
 
 		 202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0281521  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  43.84 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2606  guanylate kinase  52.15 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100354  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  44.26 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  44.79 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  45.6 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1763  guanylate kinase  47.03 
 
 		 218 aa  161  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1104  guanylate kinase  44.44 
 
 		 211 aa  161  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.631702  normal  0.011032 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3136  guanylate kinase  45.77 
 
 		 231 aa  161  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.328978 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0632  guanylate kinase  47.43 
 
 		 185 aa  161  8.000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2692  guanylate kinase  51.61 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17617  predicted protein  47.89 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.910339  hitchhiker  0.000867282 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  43.63 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2787  guanylate kinase  51.61 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1256  guanylate kinase  44.2 
 
 		 203 aa  160  1e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  46.96 
 
 		 192 aa  160  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0563  guanylate kinase  48.15 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  44.13 
 
 		 194 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0717  guanylate kinase  48.15 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116826 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0035  guanylate kinase  44.38 
 
 		 209 aa  159  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2280  guanylate kinase  41.67 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0052  guanylate kinase  43.37 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00408303  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3623  guanylate kinase  46.07 
 
 		 207 aa  159  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0464  guanylate kinase  43.54 
 
 		 220 aa  158  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3479  guanylate kinase  45.1 
 
 		 220 aa  158  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2919  guanylate kinase  43.9 
 
 		 211 aa  158  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0469  guanylate kinase  43.54 
 
 		 220 aa  158  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  46.33 
 
 		 207 aa  158  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  46.99 
 
 		 212 aa  158  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  37.98 
 
 		 216 aa  158  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2834  guanylate kinase  45.45 
 
 		 186 aa  158  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.522471  normal  0.276726 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1563  guanylate kinase  44.12 
 
 		 211 aa  158  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0545  guanylate kinase  45.56 
 
 		 203 aa  157  8e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  37.98 
 
 		 216 aa  157  8e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  45.76 
 
 		 207 aa  157  9e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2472  guanylate kinase  45.83 
 
 		 220 aa  157  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  42.65 
 
 		 207 aa  157  9e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>