36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2072 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2072  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  421  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1394  hypothetical protein  77.31 
 
 		 325 aa  193  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2706  hypothetical protein  64.83 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0697  hypothetical protein  50 
 
 		 439 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.261572  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2250  hypothetical protein  45.64 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.599567  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0574  hypothetical protein  33.61 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2838  hypothetical protein  29.25 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1187  hypothetical protein  31.53 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4202  hypothetical protein  31.86 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0193396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1331  hypothetical protein  29.22 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0746592  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3833  hypothetical protein  27.83 
 
 		 164 aa  54.7  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1126  hypothetical protein  28.07 
 
 		 267 aa  53.1  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.577564  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3052  hypothetical protein  27.68 
 
 		 265 aa  52  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.542554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5505  hypothetical protein  28.81 
 
 		 256 aa  52  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3917  hypothetical protein  28.07 
 
 		 164 aa  51.6  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0470843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3276  hypothetical protein  27.68 
 
 		 265 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1511  hypothetical protein  27.05 
 
 		 255 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3107  hypothetical protein  23.42 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1388  hypothetical protein  28.75 
 
 		 266 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881994  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2566  hypothetical protein  27.12 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348776 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3250  hypothetical protein  26.79 
 
 		 265 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0058  hypothetical protein  29.25 
 
 		 170 aa  48.5  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1688  hypothetical protein  23.29 
 
 		 255 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.086166 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1436  hypothetical protein  27.59 
 
 		 258 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3782  hypothetical protein  23.77 
 
 		 259 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16840  hypothetical protein  29.13 
 
 		 176 aa  45.4  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0854  hypothetical protein  30.25 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1315  hypothetical protein  28.47 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215271  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1688  hypothetical protein  24.81 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3427  hypothetical protein  28.66 
 
 		 325 aa  43.9  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0467043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3650  hypothetical protein  28.89 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.122164  normal  0.805453 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0743  hypothetical protein  31.18 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.634607  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4208  hypothetical protein  20.97 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0415  hypothetical protein  24.55 
 
 		 169 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2975  hypothetical protein  28.47 
 
 		 185 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.701427 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0030  hypothetical protein  29.17 
 
 		 177 aa  42.4  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>