37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2064 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2064  ATP synthase protein I  100 
 
 		 92 aa  190  6e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1386  ATP synthase protein I  63.74 
 
 		 91 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2698  ATP synthase protein I  57.14 
 
 		 91 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2089  ATP synthase protein I  48.84 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0218096  normal  0.87278 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2252  hypothetical protein  42.05 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00019318  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1583  ATP synthase protein I  47.83 
 
 		 71 aa  73.6  0.0000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0022057  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0013  hypothetical protein  40.26 
 
 		 82 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501969  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2797  ATP synthase protein I  34.12 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0200156  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3140  hypothetical protein  40 
 
 		 80 aa  62  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000379803  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1509  hypothetical protein  39.71 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1607  hypothetical protein  35.8 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3929  hypothetical protein  33.33 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000115703  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4013  hypothetical protein  34.29 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0628  hypothetical protein  34.62 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0336  hypothetical protein  32.47 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00273364  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4246  hypothetical protein  30.99 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000585685  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2667  hypothetical protein  37.14 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000715899  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3247  hypothetical protein  41.86 
 
 		 123 aa  51.6  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3357  hypothetical protein  36.92 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000003044  hitchhiker  0.0072657 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3744  hypothetical protein  40 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212902  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3673  hypothetical protein  48.78 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000387976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4482  hypothetical protein  34 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6943  hypothetical protein  38.33 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7656  hypothetical protein  43.14 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120785  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2386  hypothetical protein  29.49 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0414094 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0715  hypothetical protein  37.74 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.631945  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3500  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2595  ATP synthase F0, subunit I  36.36 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463887 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0553  ATP synthase protein, subunit I  36 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0511  ATP synthase protein, subunit I  36 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0381  ATP sythase protein I, putative  35.29 
 
 		 132 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3371  conserved hypothetical proteinn  37.25 
 
 		 121 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0949448  normal  0.745909 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0744  hypothetical protein  33.87 
 
 		 123 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.32586  normal  0.360588 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3176  hypothetical protein  31.82 
 
 		 122 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.984172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0393  putative ATP sythase protein I  35.29 
 
 		 132 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0446  putative FOF1 ATP synthase, subunit I transmembrane protein  42.86 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912309  normal  0.120038 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0499  ATP sythase I  31.67 
 
 		 132 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.417293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>