More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2058 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
102 aa  203  6e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  89.22 
 
 
102 aa  185  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  86.27 
 
 
149 aa  181  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  72.28 
 
 
102 aa  159  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  63.11 
 
 
103 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  56.44 
 
 
104 aa  121  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 
102 aa  120  9e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 
102 aa  120  9e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 
102 aa  120  9e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  58.25 
 
 
104 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 
102 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 
102 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 
102 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 
102 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 
102 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 
102 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 
102 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 
102 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  58.42 
 
 
103 aa  116  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  58.25 
 
 
103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  58.25 
 
 
103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 
103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 
103 aa  114  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  58.25 
 
 
103 aa  115  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  55.34 
 
 
103 aa  114  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  58.42 
 
 
103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  56.31 
 
 
103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  61.76 
 
 
102 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  57.28 
 
 
103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  111  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 
103 aa  111  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  56.44 
 
 
103 aa  111  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 
103 aa  111  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 
102 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 
103 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  56.31 
 
 
103 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 
104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  56.44 
 
 
103 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 
102 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  55.45 
 
 
103 aa  110  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  56.31 
 
 
103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  55.88 
 
 
103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  53.85 
 
 
104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  49.51 
 
 
104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 
103 aa  108  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 
104 aa  108  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  51.96 
 
 
103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
103 aa  107  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  55.45 
 
 
115 aa  107  6e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 
103 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 
103 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  50.5 
 
 
102 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 
115 aa  106  9.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  53.92 
 
 
103 aa  106  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  51.92 
 
 
104 aa  106  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 
104 aa  106  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3417  ribosomal protein L21  61.17 
 
 
103 aa  105  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0473  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
103 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000637379  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0525  ribosomal protein L21  57.28 
 
 
103 aa  105  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  57.43 
 
 
103 aa  104  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  103  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1211  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 
102 aa  103  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000816286  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 
103 aa  102  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000647108  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
103 aa  102  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  51.49 
 
 
131 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  53.85 
 
 
103 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 
103 aa  103  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1704  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 
102 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000276664  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  49.5 
 
 
105 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  51.02 
 
 
124 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1737  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 
102 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000015429  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
104 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  101  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
103 aa  101  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 
102 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 
102 aa  102  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
106 aa  101  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  101  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  101  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  101  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 
103 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
103 aa  101  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  101  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 
103 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 
103 aa  100  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0793  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  100  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000236829  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 
102 aa  100  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
104 aa  100  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1008  50S ribosomal protein L21P  54.46 
 
 
103 aa  100  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012148  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  100  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>