More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2043 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 
144 aa  298  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  85.82 
 
 
152 aa  258  1e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  77.08 
 
 
148 aa  234  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  51.11 
 
 
143 aa  155  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.64453e-12  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  50 
 
 
143 aa  153  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  52.17 
 
 
146 aa  153  8e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  48.53 
 
 
153 aa  152  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  4.99535e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  50.35 
 
 
144 aa  147  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  52.17 
 
 
167 aa  144  4e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  52.17 
 
 
167 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  52.17 
 
 
167 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  47.06 
 
 
143 aa  143  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  1.2945e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  47.06 
 
 
143 aa  143  7e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  45.99 
 
 
154 aa  143  9e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  47.76 
 
 
147 aa  142  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  47.14 
 
 
143 aa  140  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  50.76 
 
 
176 aa  132  2e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5908  ferric uptake regulator, Fur family  48.89 
 
 
165 aa  126  8e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616966  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  40 
 
 
149 aa  125  2e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3769  ferric uptake regulator, Fur family  38.97 
 
 
151 aa  112  1e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3662  ferric uptake regulator, Fur family  38.24 
 
 
151 aa  112  1e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0842  ferric uptake regulator, Fur family  35.04 
 
 
152 aa  107  7e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1138  ferric uptake regulator, Fur family  39.84 
 
 
143 aa  107  8e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716078  normal  0.825565 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  44.53 
 
 
146 aa  106  9e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  38.62 
 
 
151 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  5.12773e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  37.67 
 
 
144 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  1.37697e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  43.85 
 
 
137 aa  105  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  36.62 
 
 
156 aa  104  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  38.85 
 
 
155 aa  104  5e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  1.54091e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0932  ferric uptake regulator family protein  46.28 
 
 
137 aa  103  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  37.41 
 
 
157 aa  103  9e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  37.93 
 
 
151 aa  103  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  5.72819e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0342  ferric uptake regulator family protein  39.02 
 
 
237 aa  103  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.087099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1036  transcriptional regulator, Fur family  37.93 
 
 
151 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0163253  normal  0.210334 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  37.41 
 
 
157 aa  103  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  36.96 
 
 
155 aa  102  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  33.8 
 
 
145 aa  102  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.48432e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1806  ferric uptake regulator family protein  38.76 
 
 
141 aa  102  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.696064  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  37.41 
 
 
157 aa  103  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4201  transcriptional regulator, Fur family  37.93 
 
 
151 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2968  ferric uptake regulator family protein  45.76 
 
 
151 aa  103  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  36.69 
 
 
154 aa  102  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  40.15 
 
 
154 aa  101  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.54751e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  37.68 
 
 
151 aa  101  4e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3031  ferric uptake regulator family protein  42.62 
 
 
139 aa  101  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2142  putative ferric uptake regulation protein  44.26 
 
 
137 aa  101  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0454  ferric uptake regulator, Fur family  43.07 
 
 
143 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1820  ferric uptake regulator family protein  41.67 
 
 
144 aa  101  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.168146 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  37.24 
 
 
158 aa  100  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0984  ferric uptake regulator family protein  42.74 
 
 
140 aa  100  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  31.43 
 
 
143 aa  100  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3832  FUR family transcriptional regulator  37.24 
 
 
151 aa  100  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4224  transcriptional regulator, Fur family  37.24 
 
 
151 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00546613  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3848  FUR family transcriptional regulator  37.24 
 
 
151 aa  100  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  8.44204e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4160  FUR family transcriptional regulator  37.24 
 
 
151 aa  100  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4001  FUR family transcriptional regulator  37.24 
 
 
151 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  8.32394e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4115  transcriptional regulator, Fur family  37.24 
 
 
151 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51163e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4313  FUR family transcriptional regulator  37.24 
 
 
151 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
142 aa  100  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  39.26 
 
 
155 aa  100  7e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  36.17 
 
 
146 aa  100  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.38692e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
149 aa  100  8e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0497  ferric uptake regulator family protein  54.65 
 
 
90 aa  100  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
144 aa  99.4  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  34.93 
 
 
149 aa  99.4  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  31.43 
 
 
142 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  31.43 
 
 
144 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  31.43 
 
 
144 aa  99.4  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
144 aa  99.4  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  31.43 
 
 
142 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.15951e-12 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2385  ferric uptake regulator family protein  40.94 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  34.93 
 
 
149 aa  99.4  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  36.36 
 
 
147 aa  99  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  31.43 
 
 
142 aa  99  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  1.72777e-06 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2494  FUR family manganese uptake regulator  44.63 
 
 
137 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  31.43 
 
 
142 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  31.43 
 
 
142 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  4.0057e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  34.56 
 
 
152 aa  99  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.93805e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1161  ferric uptake regulator family protein  44.63 
 
 
137 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.13561  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3767  ferric uptake regulator family protein  43.44 
 
 
140 aa  98.2  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0466  ferric uptake regulator family protein  44.35 
 
 
151 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0013  ferric uptake regulator family protein  42.5 
 
 
135 aa  98.2  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00124444  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0020  ferric uptake regulator family protein  44.35 
 
 
149 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0165645  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0244  ferric-uptake regulator  44.35 
 
 
143 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
143 aa  97.4  5e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  36.43 
 
 
159 aa  97.8  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0044  ferric uptake regulator family protein  45.08 
 
 
150 aa  97.4  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  34.56 
 
 
152 aa  97.1  7e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3615  ferric uptake regulator family protein  44.17 
 
 
168 aa  97.1  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1147  ferric uptake regulator family protein  39.44 
 
 
155 aa  96.7  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  39.53 
 
 
150 aa  96.3  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0013  ferric-uptake regulator  43.55 
 
 
156 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0292053 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  38.76 
 
 
161 aa  96.3  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  3.1646e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0588  ferric uptake regulator family protein  44.35 
 
 
165 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  37.98 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  9.66153e-09  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0928  FUR family manganese uptake regulator  43.44 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  34.78 
 
 
143 aa  95.9  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0435  ferric uptake regulator  39.53 
 
 
135 aa  95.9  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0406  ferric uptake regulator, Fur family  37.23 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0603  ferric uptake regulator family protein  37.78 
 
 
138 aa  94.7  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401566  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>