More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2029 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2029  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 87 aa  176  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1351  30S ribosomal protein S18  92.94 
 
 		 87 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2023  30S ribosomal protein S18  90.59 
 
 		 87 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.344457  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1411  30S ribosomal protein S18  86.21 
 
 		 87 aa  157  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000532082  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1829  30S ribosomal protein S18  72.94 
 
 		 87 aa  136  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1095  30S ribosomal protein S18  73.26 
 
 		 86 aa  135  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.443654  normal  0.0284482 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0009  30S ribosomal protein S18  68.06 
 
 		 83 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.99289  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2843  30S ribosomal protein S18  63.24 
 
 		 106 aa  92.8  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270954  hitchhiker  0.0000000000000931425 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3677  30S ribosomal protein S18  60.53 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0799478  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0666  30S ribosomal protein S18  63.24 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3187  ribosomal protein S18  62.69 
 
 		 81 aa  89.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0759  30S ribosomal protein S18  60.87 
 
 		 94 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000168995  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1477  30S ribosomal protein S18  56.58 
 
 		 92 aa  89.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00897037 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2763  30S ribosomal protein S18  56.58 
 
 		 92 aa  89.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2608  30S ribosomal protein S18  60.87 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0113564  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1998  ribosomal protein S18  63.77 
 
 		 91 aa  88.2  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.471934  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1676  30S ribosomal protein S18  64.71 
 
 		 89 aa  84.7  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000141185  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4505  ribosomal protein S18  56.72 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0652  ribosomal protein S18  66.13 
 
 		 81 aa  84  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1691  ribosomal protein S18  55.88 
 
 		 79 aa  84  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0130  30S ribosomal protein S18  64.52 
 
 		 75 aa  83.6  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00643171  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2103  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.499514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3306  30S ribosomal protein S18  59.02 
 
 		 77 aa  82  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014501  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  61.76 
 
 		 78 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2538  ribosomal protein S18  66.13 
 
 		 74 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000029732  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2914  SSU ribosomal protein S18P  57.35 
 
 		 74 aa  82  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000742104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7310  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 78 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.879868  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4353  30S ribosomal protein S18  61.9 
 
 		 76 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3421  ribosomal protein S18  58.82 
 
 		 75 aa  80.9  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2460  SSU ribosomal protein S18P  57.14 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168294 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 86 aa  80.5  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0335  ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 78 aa  80.1  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.793411 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2214  ribosomal protein S18  60.32 
 
 		 75 aa  80.1  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  49.3 
 
 		 87 aa  80.1  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0121  30S ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.184225  normal  0.109156 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  64.52 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0135  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0117  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0124  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1436  30S ribosomal protein S18  57.97 
 
 		 75 aa  79.7  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00709518  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0584  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 74 aa  79.3  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.501506  hitchhiker  6.40936e-16 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23340  ribosomal protein S18  58.21 
 
 		 70 aa  79.7  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000096386  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4662  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 		 78 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 97 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3667  30S ribosomal protein S18  57.97 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0312817  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27900  SSU ribosomal protein S18P  49.3 
 
 		 86 aa  79  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000408904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  59.09 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 80 aa  79  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 80 aa  79  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000144955  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3559  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.842484 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  57.75 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9355  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 78 aa  78.2  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1328  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.52927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0075  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000152962  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 		 77 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1218  SSU ribosomal protein S18P  57.97 
 
 		 91 aa  78.2  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3062  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382795  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 77 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 77 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 77 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 77 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4520  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 78 aa  77.8  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 77 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 77 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0755  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000506389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3928  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0713  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.348938  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3282  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0561913  hitchhiker  0.000203056 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0743  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000702658  hitchhiker  0.000126667 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3641  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000922351  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0734  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213573  hitchhiker  0.0000000101296 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3258  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000185776  hitchhiker  0.00000962833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0689  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00223713  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3349  30S ribosomal protein S18  55.88 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000024458  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0703  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000172761  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_002936  DET1044  30S ribosomal protein S18  51.39 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0572  ribosomal protein S18  56.52 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.504032  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3584  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.173791  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0759  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190988  hitchhiker  0.000000223269 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4210  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.882361  hitchhiker  0.000251035 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3590  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 75 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.307968  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1363  ribosomal protein S18  55.88 
 
 		 75 aa  76.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143055  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3433  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 75 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00939921  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0517  30S ribosomal protein S18  55.88 
 
 		 75 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.370813  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  61.29 
 
 		 78 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0927  30S ribosomal protein S18  51.39 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000227736  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_915  ribosomal protein S18  51.39 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043534  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5066  ribosomal protein S18  53.97 
 
 		 78 aa  76.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.185041  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1895  30S ribosomal protein S18  55.71 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00156223  hitchhiker  0.0000000574659 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2414  30S ribosomal protein S18  55.71 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.398519  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0004  30S ribosomal protein S18  55.71 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0418254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2289  30S ribosomal protein S18  55.71 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.189033  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0913  30S ribosomal protein S18  55.71 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.317596 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1166  30S ribosomal protein S18  55.71 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>