More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2028 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 167 aa  326  8e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  75.45 
 
 		 167 aa  252  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  71.14 
 
 		 168 aa  214  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  64.43 
 
 		 171 aa  197  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1828  50S ribosomal protein L9  58.33 
 
 		 168 aa  169  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  53.69 
 
 		 160 aa  167  5e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  47.62 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  44.22 
 
 		 151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  44.22 
 
 		 151 aa  135  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 		 148 aa  134  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  44.9 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 147 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  42.36 
 
 		 147 aa  132  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  46.94 
 
 		 149 aa  130  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 151 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  45.58 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  45.58 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 149 aa  128  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 		 148 aa  127  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  41.67 
 
 		 148 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  43.06 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  42.36 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0597  50S ribosomal protein L9  39.53 
 
 		 179 aa  124  8.000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  45.27 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1948  ribosomal protein L9  46.62 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  41.36 
 
 		 170 aa  118  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 194 aa  117  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  38.89 
 
 		 148 aa  117  7.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0741  ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0681469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 		 147 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0120  50S ribosomal protein L9  43.7 
 
 		 149 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0927016  normal  0.199932 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 149 aa  114  6.9999999999999995e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  41.67 
 
 		 209 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1210  50S ribosomal protein L9  39.33 
 
 		 209 aa  113  8.999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0873917  normal  0.750153 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0586  50S ribosomal protein L9  44 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.482938  hitchhiker  3.77539e-17 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  39.58 
 
 		 179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  45.1 
 
 		 149 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  39.33 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  45.64 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  44.83 
 
 		 191 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1112  ribosomal protein L9  36.3 
 
 		 147 aa  112  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573323  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  41.67 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2050  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00744  50S ribosomal protein L9  41.61 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.73532  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2131  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.103333  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  43.24 
 
 		 150 aa  111  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 147 aa  110  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  42.86 
 
 		 148 aa  111  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 148 aa  111  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0889  50S ribosomal protein L9  43.06 
 
 		 194 aa  110  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1329  50S ribosomal protein L9P  41.22 
 
 		 148 aa  110  9e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.556068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 		 148 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0007  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2587  50S ribosomal protein L9  43.38 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1030  50S ribosomal protein L9  41.42 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1642  50S ribosomal protein L9  40.24 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0557513  normal  0.0367892 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3185  ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0210  ribosomal protein L9  36.13 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000722973  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3281  50S ribosomal protein L9  41.33 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.134585  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 149 aa  108  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  40.94 
 
 		 151 aa  107  6e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  40.28 
 
 		 189 aa  107  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  40.12 
 
 		 193 aa  107  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2007  ribosomal protein L9  35.62 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  41.61 
 
 		 165 aa  107  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 189 aa  107  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1350  50S ribosomal protein L9  39.58 
 
 		 189 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3363  ribosomal protein L9  38.89 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  42.14 
 
 		 146 aa  107  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1043  50S ribosomal protein L9  40.28 
 
 		 204 aa  106  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  41.1 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07670  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 148 aa  106  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.957501  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1339  50S ribosomal protein L9  41.21 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.361215  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0648  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000594391 
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  40.28 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  40.4 
 
 		 149 aa  105  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 189 aa  104  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0411  50S ribosomal protein L9  40.74 
 
 		 195 aa  104  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.112533  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4931  50S ribosomal protein L9  44.12 
 
 		 148 aa  104  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100703 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  34.46 
 
 		 148 aa  104  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  35.57 
 
 		 149 aa  104  6e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4665  50S ribosomal protein L9  44.12 
 
 		 148 aa  104  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0656931 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 147 aa  104  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04070  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3790  ribosomal protein L9  38.26 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00574678  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4736  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257928  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5718  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.595872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1361  ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 150 aa  103  8e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0777  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000131124  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4673  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4764  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4447  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>