266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1951 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  100 
 
 
122 aa  241  3e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  80.68 
 
 
96 aa  150  7e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  61.54 
 
 
126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  61.64 
 
 
113 aa  100  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1807  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  90.2 
 
 
193 aa  100  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.988739  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.62 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  49.51 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  56.72 
 
 
111 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  52.24 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  53.12 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  49.21 
 
 
106 aa  77  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  37.04 
 
 
120 aa  67.8  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  45.16 
 
 
88 aa  67  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  35.58 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1982  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  56.36 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0382774 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  49.28 
 
 
231 aa  64.3  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  49.28 
 
 
229 aa  63.9  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  48.15 
 
 
207 aa  63.9  0.0000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.63 
 
 
92 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  44.26 
 
 
104 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1344  twin-arginine translocation protein  50.98 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.108227 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.83 
 
 
128 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  54.9 
 
 
180 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  50.91 
 
 
91 aa  62  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.79 
 
 
152 aa  62  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  37.31 
 
 
96 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.58 
 
 
116 aa  61.2  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  50.98 
 
 
178 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  41.18 
 
 
147 aa  60.5  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  48.33 
 
 
130 aa  60.1  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.93 
 
 
254 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  38.57 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  47.17 
 
 
87 aa  60.1  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  55.32 
 
 
180 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  44.12 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  44.12 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  40.7 
 
 
90 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  50.98 
 
 
172 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  53.19 
 
 
200 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1796  twin-arginine translocation protein TatB  44.93 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1987  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  42.25 
 
 
71 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283995  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  34.34 
 
 
182 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  34.34 
 
 
182 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  34.34 
 
 
182 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  34.34 
 
 
182 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.75 
 
 
169 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  34.34 
 
 
182 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.08 
 
 
90 aa  58.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  35.29 
 
 
88 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0264  twin arginine translocase protein A  50.98 
 
 
76 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  42.62 
 
 
214 aa  57.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.58 
 
 
190 aa  57.4  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  51.92 
 
 
110 aa  57  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  37.93 
 
 
88 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.42 
 
 
96 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2080  twin arginine translocase protein A  49.02 
 
 
77 aa  57  0.00000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.42 
 
 
96 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35.29 
 
 
155 aa  57  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.11 
 
 
234 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  28.69 
 
 
149 aa  56.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  48.94 
 
 
188 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  38.18 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24611  twin arginine translocase protein A  49.02 
 
 
91 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  36.76 
 
 
171 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.76 
 
 
171 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.26 
 
 
203 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.65 
 
 
99 aa  55.5  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.1 
 
 
96 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  36.76 
 
 
171 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2704  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.18 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.68 
 
 
163 aa  55.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.36 
 
 
197 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1210  twin-arginine translocation protein TatB  35.71 
 
 
173 aa  55.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  32.14 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  36.76 
 
 
171 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  36.76 
 
 
171 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  36.76 
 
 
171 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  36.76 
 
 
171 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  36.76 
 
 
171 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5555  sec-independent translocase  32.26 
 
 
165 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  36.62 
 
 
162 aa  55.5  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2957  sec-independent translocase  40.3 
 
 
154 aa  55.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.281897  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  41.79 
 
 
184 aa  55.1  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  36.76 
 
 
171 aa  54.7  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0410  sec-independent translocase  30.39 
 
 
175 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3548  sec-independent translocase  40.3 
 
 
172 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868381  hitchhiker  0.000446597 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2747  sec-independent translocase  40.3 
 
 
182 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50 
 
 
190 aa  53.9  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350642  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0707  sec-independent translocase  35.82 
 
 
155 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114909  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1519  twin arginine-targeting protein translocase  42 
 
 
89 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.085933  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38.33 
 
 
146 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38.33 
 
 
139 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38.33 
 
 
139 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35 
 
 
208 aa  53.5  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02761  Sec-independent protein secretion pathway component  46.81 
 
 
83 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.226319  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3547  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.1 
 
 
64 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00015351  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1617  twin-arginine translocation protein TatA/E  44 
 
 
71 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0815  sec-independent translocase  35.82 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03820  twin-arginine translocation protein, TatA subunit  34.55 
 
 
60 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0700  sec-independent translocase  37.31 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>