More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1934 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1934  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
367 aa  747    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.142623 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3016  glycosyl transferase group 1  48.05 
 
 
373 aa  329  4e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1402  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.94 
 
 
392 aa  311  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 
401 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3120  glycosyl transferase, group 1  38.24 
 
 
366 aa  99.8  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0017817  unclonable  0.0000176244 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 
382 aa  98.6  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  35.18 
 
 
403 aa  96.3  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  32.31 
 
 
387 aa  96.3  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  33.6 
 
 
399 aa  95.1  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  36.45 
 
 
391 aa  94  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  37.17 
 
 
371 aa  92  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2958  glycosyl transferase group 1  35.88 
 
 
366 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.298871  hitchhiker  0.000213048 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  34.91 
 
 
468 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 
394 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 
393 aa  90.9  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  33.85 
 
 
360 aa  90.1  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  31.69 
 
 
403 aa  89.7  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  40.56 
 
 
453 aa  89.7  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
371 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 
384 aa  87.8  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 
373 aa  85.9  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
371 aa  85.9  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 
370 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0358  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 
364 aa  84.7  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 
419 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 
402 aa  84.7  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 
375 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 
387 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
377 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 
374 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  37.36 
 
 
389 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 
739 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  33.98 
 
 
387 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 
384 aa  82.4  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  31.64 
 
 
388 aa  82  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  35.87 
 
 
413 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 
366 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 
377 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.93 
 
 
397 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  32.44 
 
 
401 aa  82  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1755  glycosyl transferase group 1  22.11 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1546  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 
400 aa  81.3  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0752517  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4417  glycosyl transferase group 1  38.12 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 
390 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 
372 aa  80.5  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2615  glycosyl transferase, group 1  34.94 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  35.24 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  33.91 
 
 
398 aa  80.1  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 
363 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 
372 aa  80.1  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 
409 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2213  glycosyl transferase group 1  35.57 
 
 
384 aa  80.1  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.013573  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
378 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 
379 aa  79.7  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  31.75 
 
 
390 aa  79.7  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.65 
 
 
373 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 
359 aa  79  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2384  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
374 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
398 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1365  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 
395 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  29.06 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 
412 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1742  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 
371 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.711443  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
392 aa  77.4  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  26.21 
 
 
368 aa  77.4  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
440 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  36.84 
 
 
384 aa  77  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 
360 aa  77  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0495  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
387 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 
370 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 
389 aa  77  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 
436 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3642  glycosyl transferase, group 1  41.57 
 
 
411 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 
395 aa  76.6  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3176  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.17 
 
 
373 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0306  glycosyl transferase group 1  42 
 
 
412 aa  76.3  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 
372 aa  76.3  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1254  glycosyl transferase, group 1  31.67 
 
 
398 aa  76.3  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163689  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
398 aa  75.9  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
378 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  31.61 
 
 
365 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.6 
 
 
349 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 
382 aa  75.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0113  glycosyl transferase, group 1  28.11 
 
 
369 aa  75.5  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
360 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2209  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 
379 aa  75.5  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2192  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0496  glycosyl transferase group 1  37.91 
 
 
409 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 
355 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  26.96 
 
 
383 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  32.89 
 
 
411 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3847  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
360 aa  75.1  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4992  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1641  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>